| Id Trinity | FTRINITY_DN58993_c0_g2_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_38870 |
| Sequence | AAGGTTTTTGAATTAAACGAAGGAATGAGAAGGAACATTCCGCGCTCTGACTTAACAAAAAAACATTGATTCATTGATTGATTCATTGATTGATTCACCG ATTCCATAACCTTAGATCCATTTTCTGAAATCGTTGAGAATGTTGATGAGTCCAAGATTAAGAGGATCAACATTAACAGCATCATCAGCGTTATTATCAT CATCATGGGATTCAATGCTCCCTGGTCCACCAACCCGAAACAATTTCGGTTCTTCAGATCTCAATTCTCAAGGCCTTCTCGTTTTCTCTTCTGGAAGTTC CTTATCAATTATCGATACTCATTCTATGCAACTTCTCTCTTCTTTCTCTATCCCTTCTCCTTCTTCTTCTCTATCTCCTTTTGTAACCGCTCTTCGCTGG ACCCCACTCTCTCTCAACCGTCAATTTCTCTCTACTGAACCTTCTTCTTCTCATCTCGTCATCGCCGCCGGTGACCGTCAAGGTCGAATCGTTCTTCTTG ACTTTCGTCTCAAATCTCCGATCCTATGGTTCGATACTGATTCCAATTTCGGTGTTCAAGATCTTTGTTGGGTTCAGGCTCGACCTGATTTATACCTAAT TGCTGCGATTCATGGTTCCTCTACGCTTTCTCTTTACAATGCTTCTACTGGTCGCTGTGTTTGGAAATACGATGCTTCTCCTGAATTCTTCTCTTGCGTT CGTCGCGATCCGTTTGATTCGCGACGCGTGTGTGTAATTGGACTCAAAGGTTTTCTCCTTTCTGTTGTTGTTGTTGGTGAGGAGAGCATTGTGATTAAGG ATCTTCAGATTCGGACTGATAGCAGCGAGTTTATTAAGGTCGAGAGAGATGTTGCTGCCGCTGGTTCTGCTGCATTGCCTGCTTCGGCCGCGTTTCCGCT 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TCTCAGCTACAAGATGCCGGGTGCTGGACGGATGCTGCGACCTTAGCTGCTAGTCACTTGCAAGGATCAGATTATGCAAGGTTCTTATTCTTTCCTTGAA CAGATGCTTCTGTCCACATAAATTAACGTCACTGTAAGACAACTTTGTTTTGTTATTTTAGTTTACACGAACAGGGTAAACACATTCATTCACATCTGCT AGTTGCAGCATGACCTCCAAAACTTTGGCTATATGACACAAAATACCTCACTAGTATTTGTGACTTATATCAAACTTATTATCCCTGACCTTATTGTTAA TATAGGGGAGAAACTTAGTTTTTGCTTTTGGTTATTGACATCATGCCAGTGGCAGATTTGTAGAATCATTTGTAATTTTACGTAGTTTTACATTTTTTAC TCTCTGACATGATTGCTGTCTCAACCTCTGCATTCGGATGACTGTCAAAAAGAACATTTGAATTGTATGCCATCATGATCATGACTAGAAGAGTTTTTCT CTATTTTGTATTCTTGCAGAGTGTTGCAAAGGTGGGCTGGATATGTCTTGCACACTGAACATAATATCTGGAGGGCTTTGATTTTGTATGTTGCTGCTGG TGCACTACAAGAGGCATTAACAGCTCTTCGCAAGGCTCAACTACCTGACACAGCTGCAATGTTTGTCCTTGCATGCCGTGAAATCCATGAAGAAATAGTT TCCAAGTTAGGTATTATCGATGATGAATCTAGTTCATCAGTTATGGATAACCTACTAAACTTGCGAGATTTAGATCCAGAGAATGAAGATGTCATTGCAG TTGGTGAATACTTTGGGGAATACCAAAGAAAATTGGTGCACCTATGCATGGATTCGGAGCCATTCTCTGACTAATTGCAGGGCTTGATGAAATGGTTTCA AATTTCACATTTATGTTCATTAAAGCAGTGGATTAACAACTCTGGGCTTGAAAACAAAATTGTAGGCTGATTGCTCTGGCCAGTACCCGCTAAAAGGAAC AGATACTTTCATTACCCAAGTTGCTGCCAAATATGTATAATGATGGAAGGCACTGGGAAGGGTATGACCCAAAGCGACTTGGACAGTTGCAGGTGCCAAA ATACCAAGTCTTTCTATGTAATATTGGTTTACATGAGCTTTCTAAAGTTGAAAAGACCCCATCAAATACTATTGTAGCTTGTGGATAAAATTGTTGCCAA CTAATCATTCAATTGTATTGTATTTATATCTGGGTTAAAACAAAAACAAAAATACACATGCGCAATGTTAGATTACTGTATTACTCAGACGTGCCAATTA ATAATACTCGATTTTTGTCGGTGTTGG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_81881; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_38870
| Blastp | WD repeat-containing protein 11 from Homo with 22.32% of identity |
|---|---|
| Blastx | WD repeat-containing protein 11 from Homo with 23.01% of identity |
| Eggnog | WD repeat domain 11(ENOG410XT4R) |
| Kegg | Link to kegg annotations (55717) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452543.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |