Ll_transcript_146560

Id TrinityFTRINITY_DN59086_c4_g1_i23
Name TranscriptLl_transcript_146560
SequenceTTATTCTTCAGCTTTTAGATTCTTCAGAAGAATTATACAGATGCTGTTAGTTCTTCCTTTGGTAAACCTTTTTGCCATTCATAAGAATTTTAGCTTTTAA GATACTTGACCATGGTTTATGTGGGTTCTCATTTTTGCAATTATTTCATAAGCCCTTCTCTGTTTTATTTGTCTTTTGGCTGAACTTGCAGTTGCTTATG GTAAATTATACTTTGGTGAAGGCTGTAGCTAACTCCAGTCAGGATAATCCTTGACCTTTGGAGATTAAACGTTTTTTAAAGTACATCAAACTGCTAGTTG TGTATTAAGAGTTCTCATGTAGGAATTGTGGTAAGGCTTGCTTAATTCCACAATGGCTTACATTGAGTGCTAACAAAATCATCTAGCTTGCTTATAAAGG CAATTCCATTTTGCTCTTGAATGCAATAATTTGCCTATGTGCCCGACTTCAACGTTGTAGATCATCCAATCATCTCATCTTTATTTAGAGTGTATTTGAA TTCAATTGCTCAATTTTCTATTAATTTGATTTCTAACATTACTCATGTAACTATCTTCAGTCACGAGAGAAGTTTGTGTCCTTGAAGAAAAATACCCCGG GAGACATTGTCGCTGAATTAGAAGAGGTTTGCTTCATCAATTTGTCAATGATTAGTAATTTCTAAAAATTGACGCATAATTTAATTGATATCTACTCTAG AATTTGTTTCATATTTTATTGCTTTAATAAAAAATCTATTAGTGTCTTTTTATTGGTGCATTAAATTAATTAATATTGTCAATGAATGTTGAAGTAAGTA GTAGCTCATTTCTGGCTGAAGCTTTAGTTCTGTATTTAGGTATGAAAGGTTGATTAAGTTTCACAATTTTTATTCTCTTCATTCTTTGTCCACTTTTTCT TTTTTGTTTGACTCCGCCTTGGATAATTCATTTTGCCTTCTTGATGATTGATTTGAGTTTGAAGTGTATCACTCATATATCCAAATCTTTGACCAATCAG TATCGTAAAAGGATAAAACGTGCTGTGTAATATCTTAGCTATATGTAAATTTAGTGGGCAGTATTATGGACCCATTATGTAGACATGTATTTCCAGCAAG AGCTGTCTTATTGTTTAGAGCCTCCATGCAATAGAGGGTCTACTGTCATGGAGCAAGGCCTTTTAATCTATTTTATTACCTTGTTGATCTTGATTCATGG ATGACTTAAATATTTGTTCACATTGCCATCTAATTCATCATGTTCTCATCTATTATTTATTGTTAAATAGCATATTCTTTCACAGATATTTGTGATTCAA ACTTATTTAATCAATCATCTCACTATTCTGATCCCGGACAGGATCTACAAAATTCAAAGTCAGCATTTGAAAAAAGTCGCTTCAATCTAGTATGTCTTCT ACAATTATGGACCTTTTCTCTGTGTCGTTTGCTGACATCTCCACCATTGTTTTTATTTATGAACCTGGTTATTGGGTTTTAAGGAGTGCAGGTGAACTCG CTCATGAATATTGAAGTGAAAAAGAAGTATGAGTTCTTGGAGTCCGTTAGTGCAATAATGGATGCTCATCTGAGATACTTTAAGTTGGTCTGTTAATTGA CTGCTGATTCTTCATTTGTAAACTTGTGGGTTTTATTTCTCCCCTTTTTTCTTAACAAGTTATCTTATGCTTTAGGGTTATGAGTTACTGAGCCAAATGG AGCCTTATATTCACCAGGTGCTAACATATGCTCAACAATCTAAAGAAATGGCTAATATCGAGCAAGATAAGCTTGCAAAACGAATCCAGGAATACCGAAC CCAGGCCGAGCTGGAAAATACACGAGCTTCTTGCAATACAGAAC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_82702; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_146560

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_146560

Blastp-
BlastxADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 from Arabidopsis with 64.29% of identity
Eggnogdomain, ankyrin repeat and PH domain(COG5347)
KeggLink to kegg annotations (AT1G10870)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019413717.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;