Ll_transcript_254654

• Id Trinity: FTRINITY_DN59104_c2_g1_i31
• Name Transcript: Ll_transcript_254654
• Sequence: TTGCTCGGACCTAACTACCACACACCCCACGTGATTCTCCCTCTCACTATATAAACTCCCTTCTCTCCACCTTCCTTCACTTCCCTCTCTCTCTCTAACA CGTAACCACCAACACCTAACTCTCTCTCTCTCTGTTTCTTCACGTCGTTCATAACTAATTACGCGCTCAAGGGAACCACTTATTTTGTACTAGATCTATC GGTTTCTTCTTCATGGCGACTGGACAACTGTTCTCCCGTACTACACAAGCTCTGTTTTACAATTACAAGCAACTTCCCATCCAGCGGATGCTTGATTTTG ACTTCCTTTGCGGTAGAGAAACACCATCAGTTGCTGGAATAATCAATCCTGGTTCTGAGGGATTTCAGAAGCTCTTTTTTGGTCAGGAGGAAATTGCCAT TCCAGTTCATGCTACCATTGAAGCTGCTTCTGCTGCACATCCTACTGCTGATGTCTTCATCAATTTTGCATCATTTAGGAGTGCTGCTGCATCTTCCCTG GCTGCTTTGAAGCAACCAACAATCAGAGTTGTTGCTATTATAGCTGAAGGAGTACCCGAGTCAGACACTAAAGAATTGATTGCATATGCCCGGTCAAACA ATAAGGTTGTTATTGGCCCAGCCACTGTTGGTGGAATTCAAGCTGGTGCTTTTAAGATTGGTGACACAGCTGGAACAATCGACAATATAATTCAATGCAA GCTCTACAGGCCTGGATCTGTTGGATTTGTTTCTAAATCTGTATGTTGTTAATTATGTTCATGTATATGTTGCTGTCATCTTTCTCGCATTGAGAATAGA ACCCTTTTTGTTTAGTACGTAACTACATACCACCATGAAATTTCTGTTAATGTTTATGTGCTTGTGTTAAGGAGGTGAGGAATGTGTTCAAAACGTTTGC AAATGTATACATTCTACTAAGGATAATTGGGTATTGAGCATTTGATTAATAAGAACGGATTTTTTTAATGGATAGTTGTTATACTGGAAAGGAGATTCGG GTCCATTTTTTTGCCCATAATCCTCATCCTGTATTACGAGGAACCTTGCAGACTATCCCCATGGGGGTTATGAAAGGAGCGCCCCAATTGGTAGGGAAAA AACCAGTAACTCCTTGAGAATCGTAGGAGAGATGACTATGAATTGTGTCCTTTTCTTGTATATACTAGTCCATTATGGCTTAGTTCATCTAAAATCTTGA AAAGTAGTATGGTCTACGGGAAATCTCCCGAATCCTTAATCTTCTTATAAGCTTATTGCATAGGTTCAATATATGAAGATATTGTTCACAGTAATTTGTC ATTTGAGCTTTATTTCTATTGGTATGATATAATGTATACATTGATTGTTCTAATAAGAGAAGACAACCTTTTGAGTTGCAGGGTGGGATGTCCAATGAAT TATACAACACCATTGCCCGTGTAACTGATGGGATTTATGAAGGCATTGCCATTGGAGGAGATGTTTTCCCAGGTTCCACACTTTCTGACCATGTCTTACG GTATAACAACATACCACAGGTCAAAATGATCGTTGTACTTGGGGAACTTGGTGGGCGTGATGAGTATTCATTAGTGGAAGCTCTAAAACAAGGGAAAGTG ACAAAACCAGTTGTTGCCTGGGTTAGTGGAACATGTGCACGACTCTTCAAAGCTGAAGTACAATTTGGTCATGCTGGAGCTAAGAGTGGTGGTGAGCTGG AGTCTGCTCAAGCAAAGAACCAGGCACTAAAGGAAGCTGGGGCTGCTGTTCCCACTTCATACGAAGCTTTTGAAGTTTCAATTAAAGAAACATTTGACAA ATTGGTTGAAGAAGGGAATATCACATCAGTGAAGGAATTTATTCCTCCACCAATCCCAGAGGACCTTAGCACCGCAATTAAGAGTGGAAAAGTTCGTGCT CCAACTCATATTATATCCACCATTTCTGATGACAGAGGTGAGGAGCCATGTTATGCTGGTGTGCCCATGTCTTCCATTATTGAAAAAGGTTTTGGTGTGG GTGATGTTATCTCTCTTTTGTGGTTTAAACGCAGCCTACCTCGTTACTGTACTCAATTTATTGAGATATGCATCATGCTATGTGCCGACCATGGTCCTTG TGTCTCCGGTGCACACAATACTATTGTCACAGCAAGGGCTGGAAAGGACTTAGTTTCCAGTCTCGTATCAGGTTTGCTTACAATTGGCCCTCGATTTGGA GGTGCCATTGATGATGCTGCTCGCTACTTCAAGGATGCTCGTGACAGGGTATGGTTAATAGGCTTTTCCAGTGGAGCTGGTTGGAACTACAATTTTAGGG ATTGAACTGTTAAAGTGGCCATTTTTTTATAGAAATTAAATTAAATAAGGGAAAATTTTAAAGTTTTGATCTCCATCCCCATCACCATGCACTGCATCTT TTATCCTCCAACTACCTCACTTCAACTCCCCTACAACTCTTTAACATATGGTACTATACTTTGTCTTGTCACAGAGTCTTACACCTTATGAGTTTGTTGA AAGTATGAAGAAGAAGGGCATTCGTGTGCCAGGAATAGGACACAGGTAACTAACTGTTCATTTACTAAGTAATAATTGTGCTGTTTCTGCAGCTTTTACT ATTGCTACGAAAGTCTATGTTTTTGCCAATGAGAGTTGGTTCTGTTAGTAGGATAACGTTGTCAACCATAAGGTCTTGGGTTCATTCTTGTCAGTGATAT TTTATTGTTGATCACTTGATCATCTATAAGTACTATAGGGCTTTCATTGAAGCTTGTACATTACACTTGCCTCGGAAAGAGGCAACCTCCCCTCCCTAGA AACTTTGTTAAAATAGTTCTAAATATTTGAAGCTTGGTTTTGCTTTGTGTAAAAGGATCAAGAATAGGGACAACAAAGATAAGAGAGTTGAACTGCTTCA GAAGTTTGCAAGCACGCATTTTCCTTCAGTGAAGTACATGGAATATGCTGTTGAAGTTGAAACCTACACTTTGACAAAGGCAAATAATCTAGTTCTTAAT GTTGATGGTGCAATTGGGTCTCTATTCTTGGATCTTCTTGCTGGTAGTGGAATGTTCACCAAGCAAGAGATTGATGAAATTGTGGAGATTGGCTATCTAA ATGGGCTCTTTGTGCTGGCACGTTCCATTGGTTTGATTGGGTAAGTTTAATATTTTTTATACATCTTTAGCATGAAGAACACTTCTTTGAATGAAGATCT CCTATCCCTGTCTCCCGCACCAATTAAAATGTGTCATTCAATTAAAAAAAAAATCATAAAAACAAAAACATATTATTTTGTGTAACTTTGTTGGATATAG AGAGTTTTGGGGACATGGCATCTCTCTTTCACTTTTTTTACATTATTGTACTTTTGGACCTTAGTGGCCCCTTCTTATCCACAATTCTTTTGTGGTTCAA AGGGTTCCTAGTGGGTCTCACTTTTACTGATGGTGCTTGTTGGTTGGTGACCAAGTGTTCTCTTTTTTTGTGTTAATCAATTGAGCTCAGGAATCTGAAT CCATCTCTAAAATGACAAATAAAAACACACCATATGGCTTAGTTTCATTCATTCATTCATTGTTCCTTATTTAAAATTTCAGGCACACCTTTGACCAAAA GAGATTGAAGCAACCACTCTATCGCCACCCATGGGAAGATGTTCTCTATACAAAGTGAGAGGGTCTTTTTTATGGCTTCAAGAACATCATCATCATGCTT CAAATTAGCAATCTTGAGTCTGAAATATGCAGAAATGTTTTTTTATAGCTGTTAGATTAGTGTTGTATGTTCTGGTGACAATCCATTTTTCCATTCTTAA GTTGTATTAAAATTCATGAAGAATTAACTCTGTCAATTTAAAATTTTACCTACTGATTCCTATCTCTGTTGTGTGGTGCCTTCAAAGGGAGAGGTCACTG AGAAAGTTGGTCCAGTTGAGGCTCACAGTTACTAATATCCAAAAAATATGATAACTTTGTGGTTAAGCAGATCATTATATTATAATATTTATTATCAGTC TAAAAATTTATACTATACTATTACATCGGATGAATGATAATTAAATTATACAGTGTCAATATATACTTTTTTTTTCCTCTTACATTAAATCCCAATTCGA ATATATAATGTCCTGACCAATTTTGCATGCATAGCCCTAGTATAAAGTTTCTGTTCCTTTAAATAGAAATCTAATTTAGGAGTTACCTTCGAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_82839;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_254654

FPKM

• FPAB: 10.1
• FPNAB: 6
• LF1: 9.2
• LF2: 7
• LF3: 3.6
• LF4: 6.6
• UF1: 12.2
• UF2: 7.2
• UF3: 4.4
• UF4: 7.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_254654

• Blastp: ATP-citrate synthase beta chain protein 1 from Arabidopsis with 90.59% of identity
• Blastx: ATP-citrate synthase beta chain protein 1 from Arabidopsis with 90.66% of identity
• Eggnog: Succinyl-CoA ligase ADP-forming subunit alpha(COG0074)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G06650)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019440155.1)
• Pfam: CoA-ligase (PF00549.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;