Id Trinity | FTRINITY_DN59126_c0_g3_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_255353 |
Sequence | GTTCCCCATAAGGCTAGAAGGTCTTGCATATTCTCATGGTGCTTTCTCAAGTGTAAGTTTATACACACACATGTATGTCCCCAAGAGTCGGCTTAGTTGG TAAAACTATGGGACATAAGTGTGAACACCTTGGTTCAAACCCTGACAGCTGCACAATCCCCCCTCCTTGTCAAAAAACATTGCCTATAAATATATATATA TATAGGGATTTGCTAACATGAGTCCTCTTCTTTTTATGAAGGAACATGTTAGCAACGTGTACCTAAAAAATCGAACAAAAATGCTTACATTTTCTTTACA TAAATAACCCTATTACCAAGGTTATATTGGTTTATTGAAAATTAAAAACAGTTTCCCACTCTTCTCACCGGGACCCCAAACCCAAATTCATTCCACAATT TTTAGTTTTGCAAATTATTGTTCAGCCCTTGTTCTTCTTTAGTAAAATCTCATATTTTTCTCTCCCTTGCCCTCATTATCGTTCAACAATGTAGGAAAGA AGGAATAGTAGATGGATTTTTCTTGTACATGGAATAAATATGGCTTTGGTCAAGGAAGCACGTTAATAAGATGTTTAGGAAAATGATAGAGAGAAAGGAA AGGATGGTTTGCCATTAGAGATAAATTAGAGACCATTAGATAGTGGTTGGGTTGAACTATGGTGATGGGTACCAGAGATAGAAAGGTAGTAAGAACAGTA AAACAGAAAGGCAATAGGTTTATGTGCAGCAATTTAGGAATGCAGAATTAGCTTGAAGGAATTGAAAGTTCAGTAGTAATATATATAAAGATTAGAGATA AACATAGAGGTTGCCAAATCCTCTAATTCTCAGTCCCACTAATCAGTTCCAACCTACCCTCTTTGTCCTCATTCTCACAGATATAATCCCTTTCCTAACT 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ATTACGTTGTTTGAACATTGATTATGTTAAGGTAGTTTTGAATTTGATTCACTGTTGATAGAATTAGCTCCACATACCTGTGGATATTCCCGATTTTGAT ATAATTACTAGTATGAGGATACATGTGAAAAACAAAAAAATAGCAACTACCAAAGAGTTTGAAGATTTCAAATCACTTTCTACGCTATTATTACTATCAA TTATTAATTTCATGGTTATATGTATTGAATGATGTCATAAGGTTCTCTCTTAAATTATATTCAGAAGACATTTATCTCTATTTTTTAGTATTTTTGAAAG TGTAATTCTATCATTTTCACTAATACATTCATTTTTAATTTTACTTCATCTAGTTGTTTACTTAACCAACACAACATTCTCATATCTACTACATAGAGTC TATTATCTTGTTGACATTTTATCATCCAACATTCAGTATTATATAACACTGCAAGTCTTATAGACGTATAGTAAAACTTCC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_83044; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_255353
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 from Sophophora with 42.34% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_015964281.2) |
Pfam | Chromo (CHRromatin Organisation MOdifier) domain (PF00385.23) |
Rfam | - |
GO | - |