Ll_transcript_14720

Id TrinityFTRINITY_DN59219_c2_g2_i28
Name TranscriptLl_transcript_14720
SequenceCCAGAAGGCAGATGTTTTCAGTTTTGGAATATCTCTTTGGGAGCTTTTAACTGGAGAAGTGAGTACTTTCATGGTGGCCTTTGCTGCTTTAACTTTACTT TATTATTCTTGTTTGAAAGATTGATCTAGCTTTCCACTACTCTTTATCTCATTGTATATGCTAATTTACTTGACCAGCTGCCTTACTCTCACTTGACCCC AATTACAAGCAGCTGTTGGCGTCGTTCAGAAGGTTTTCATTTTTTCCCTCTTTGCAGAAAACTTCATTGTAAACATTTTTCTTGTTTATGCGTCGAAATT TTGCCGAAATAATAGAAATTCTTTGGCAGATAACAAACGAGGTAATGTATTTTTTAATTTTTTTTAAAATAAGACAGTTTGAACTATTAAGCAATTTTTG CGTTGTGTTTCTAACAGGTCAATGATGGAAAAACAGATGGACAAAAAGATAAGGCATCTCATTCCTTTCTCTCATCATTTAAACGCTCTCACCACTGAGT ATTGGAGTTCCTATTTAAGGATCATATAACACAGTATAGCCTTTTTGTCCTGTATAGTCTAACCAAAGATCAAATGAGTTGGTTGCTTCTGCTCATGAAA GATCGGTTATATTATGCTATTCTATTGTTTATAATAGGCATCACTGGTCCATATAGTTCTACTAATAGTATTTTTGTTTGTTACATATCAACAGTTCACA ACTATTTTAATAATATGGTCAAAGCAGACTTGTAAGAGATTGCTCAAGTTGGCAGAGGACCCTACCAACCAACCTGCATTTCAAGTTCGCTTAGTACAGG TAAAAGCAGACTTGTAATTTGTTTCAATTACAATTATATATGATAATATGAAGTTAGCAATGGTATATTAGATTGAAAAACAGGAGAGAAGTGAGTATTT ATGTAAAATTTGAAACATGGATTGTATTTGATTGATCTTCAGATTACGCATTTGTTGGCTTTATGAGAATAATTAAGTTTGCTAATTAAGTTCACTGATA TCCAACAACCTAACAGTTAACTAGTCTTTCTGACAGCTGAATAGCAGAATTTAACAGAGTCATCTAATCTGAAATTATGAATAACTTGGCCACCTCGACA TGTAGTGCTAAGCTGAACATATTCTTACACATCACATGCCCTTTCTATGACGAGGTCCTGTAGTTAGTATTTAATATGTTCTGTTTAAACCTAAATGCTT TATCAGTTTACTAATAAACCAGTACTGTAAAGGTTATTATTGTCGATGCATGAGACTGGTCTATTTCTATCCCTGACTCCAACATTGTGCTACAGACATC ATTGATAACTTCTACCTGTTGTTGGCATAAAATTTGGAATACTGGAATCAACATCAATATAAGTGCCTAAAATATGTCTTGCGAAGTGCTACTCTACATA CACATCGATTCATGTCAGTATCATCCTTATGCAGGTATATCCTTCTGGCAGTGCAATTGATTCCATGCACTCAGATCCTTCTGAGAAAGAAGATGCACAA AGTTCTCTTAATTATTCTTTTAAGCAGGGAATTCATCCACCACCTACTTTTGGTTCATCCTCTAATCTTGAAACTCTTCCACTTCAAACAACTAAAAATA ACATTGAAGATGGTGGCAGTGCTATGGGTGTGAAAGCATGTTTTCCACGGCCCATGCATGAGATTACCTTTTCAACAATTGACAAGCCCAAACTCCTTAG TCAGTTAACTTCAATACTTGGTGAGATGGGACTTAACATTCTAGAAGCTCATGCATTTTCCACCACTGATGGGTTTTCTCTAGATGTTTTTGTCGTCGAG GGATGGCCAAACGAGGTAGGAAGAAAATAGATAACCAATCTCCTCCTAGAAAGTATTTGGGAAACATAGAGGCTTAATTATGTAGGCCTTGAAAATCTTG ATATGAGAACAGGCTGCAGTTTTGAATTTGTAAAAAAGATGTGTAAAGATCCGACTTCAACATTTTCTTATCACTTCATGGCATGCTTACCATTCCATTA AACCATTCCAATAGATGATATATGGTTGCTTATGCTGTCCCCATGGAATTTTTAACTATCATATTGTATGGAACAAATACATAAATGCATCGTTATTTGA TCAATTTTGGATATGGCAGGTTATTTTATTAAACAGTATGCCTAATCAGTGTAAACAATATCATCAGCCAACAATGTAAAAACATTCCATTTTAGCTATA AAGTTAAGGCATGCAACATAATTAAAGGGTACATACCAAGTACAGGTACTACACCTAAAACAGTGTATCAGTATGACCTATGGGATGATGATTTCTCATT TTATATTGTACACCCACCTTGTTTTGAAATGTTGTGAAACTTTAAGTTGTCTGCTTTCAACATTAATTTCATTATCTATAATTGTTTTCTTCTTTTTCCG AATCAAGATTATTGGCATACTGCATCCACTTAAATTTTCTTTGTTTTCTGTTATAAGTTGCTCTTAAGCATTTTCCTTTTTCATATGAGAGACCTGAATG CATTCTATCTTTTCTATATAATCATGGTTAAAATGTTTGATTACTGTATCTTTTGTATTTGTGAGATCTTCCATCAGTTAACGTCTTCCGTATATGCTTG ATATCCATTATCAAGTAAAAAAGCATATCTTGGTTTTAAGTTTTAATTGAAATTCCTTGCCAAAAACTAGCTTAGGAGCTTCCTATACAAGGTATGTTAA TGTTGGTTTCCACAATATAATTGAATGTTCACAGAAACGAATATCAGAGGAAGGTTTGACTAAACATTGAATGTTACATAATATTTCGTTGACTTCTTAT TTTTGTCTGGCATTCACGAGTCCAGCAAGCTTTTGTTGTTTTCGACTTTTGTTTACTTTTTATAACAGTTTCCAGCCATAGGATTGGATTGTCATAATTC ACGAGGATTTGAATCTTCTGCTTACAAATCCTTTGGCTGTTTGTTCATATAATTTATTTACTTTTGTGTGAAGCTAATATTAAATTTTGTGTGGTTAACT TTTCTTCTTCATTTTCAAATACATTTTCCATTTCCAAATAGGCATTATTTATCTTTTCCTTTTGACATTAAGGAAACTGAGGAGCTTAAAGGTGTGCTGG AAAAGGAAATTTTGAAGGTTAAGGAGCAATATCTGTCAAATCAGGGCATACTTCCTGCTACTAATGAACAATGCCGGGCAAGGATGGAAATCTCCCCTCA TTGCATACAAATACCTTCTGATGGAGCTGATGTGTGGGAAATTGATACCAATCACTTGATCTATGCAAACAGAGTTGGCTCTGGGTCATTTGGTGACTTG TGAGTTATATTTGTTGGAAATACATTAGAAATTGACTTAGCTTCATAGCTGATGTTTATTTTTACCTTTTTATTTGAGCTTCCTTAGGTACAGAGGTACA TATTGCAGCCAAGATGTGGCTATCAAAGTTCTAAAGCCTGAGCGCATAAGTACAGATATGCTGAAAGAGTTTGCACAGGAAGTCTATATCATGAGGTTTG TTTGCATAACTGAATATGATTGGAAGAACTTCTATTTTCCTTTAATAAGAATTTTGTTTCTCCCCTTTCTTCTTTCTTCTGTTTGATCTATCTTTTGAAA ACCAATGAGCACCAGTGGTCTGATTAAATTTTTTTCTTTCTTCTGTTGTGCTAGCTATGCTTCTAATTGATTGTTTTAAATGAAGCATATTTGGGTTGTA ATCTTAAATTTTTAAGTGCTGCAAAATCCCCCACATTTTAGATATATAATCTTAAATCTATGGTAGACTGATTCCCTGTATCCACTGCCC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_83950; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_14720

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_14720

BlastpSerine/threonine-protein kinase STY17 from Arabidopsis with 59.54% of identity
BlastxSerine/threonine-protein kinase STY17 from Arabidopsis with 58.21% of identity
EggnogSerine Threonine protein kinase(COG0515)
KeggLink to kegg annotations (AT4G35780)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019421298.1)
PfamACT domain (PF01842.24)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;