Ll_transcript_16085

• Id Trinity: FTRINITY_DN59250_c8_g1_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_16085
• Sequence: GAGTAATGTTAAAAACCATTGTCGCGCATCGATTTTCGGCTGCACGACTTGTTTAGAGTCACCATTACATTTTATAGTTAAAAATATAGAAAAAATATTT TAAGTCCGGATCGGATGAAAATGGTCATTGACCCAAAGATTTTGGGCTCGGAGGTCGGTTACGGATCAAGGAAGGTATTAACACCTCGTCCGCCCGCATC GGAGCGGTACCCTAGTTAATTACATATTTTAATTACCCTTAATCTTAATAAATTTTGGTAAAAAAATATTTTACGTTTTTATATTTGTGTCTCACAAGAG TTCGTCTTGCTCCTACGTATCCCTAGGTGCAATAGGGAAATCAAGACTACGCAGTTCTGGTTGGATTCATTAAATGAGCACCCTTGATTTGTTTTAGGAT AGCAAAAATGAGTTTCGGGAAATAGCTCAGAGTCGATATTGGTTGTTCACCTTATTCTCATTTTTTAGAGAATTTAGAAACAACTCAAATCGGAACCTCA CCAATAAAACTCCATTAAGATATTTTTGTTTGGGACAAAGATTTCTTATAATTTGGCATGAATTTAATTCTTAGACTTGGTACTAATTGTACCCCTCATT CTCTTTTCAGAGAGCTTAGAGAGGATTCGAACTATTACTTACTATTGGAATTTCTTTTAAATGTAAGTTTGAGATACTAAATAATTAAGGGAGACTTAAA AAAAATTTAATTTGAAGAACAATATATCGTTTGTTAAGATAGGATTGGTAACTGAGATATGATGTGGTTACCTAATTATATTCCGAATATTTAAATAAGT TTTAGATTATTAATGATAATATTACTAGTCATAATAATGATAATATCATTGATATCAATAGCATTATTTTACAATGATTTTATTAACACTTGATATTAGG AAAGATAATAATGTTAGTAATATTAATAATGATAATTTATAAATTATAAAACTGATTTGTAAAAAGGGCCAGAGGTGCTGAAAGTGTATATTCGGTTGGC CCAGGATCCGCCTGGGCCCAACCGGGTTATGAAAGGGGATAGGGGGTGGTGCAGTTTCATTTCATTTTCCCCCATTTTTCTCAGAAATCCTAAACTCCCA CGACCCCCACCTCTCATCGCCTTCATCTTGTTGCCCTCACTCTCACCGTGGATCTGTCCTTCTCCCCTTCATCTTCGATTATGCCTTCCTTCACCTTCAA CATCACTTTCGATTCCAATTTCACTATCGCCTTCGGTTTTAACTTCACCGTTGTTGTCTCTTTCGATTTCAATCTCCACCAAAATCCTCTGCTTCGATTT CAATCTCACTATCTTCTCCTTCGGTTTTGTTTTCAGCTTTACCGTCTTCTCCTTCGGTTCCAATCTCACCGACATCTTCCCCTGCAATTTAAATCTCACT GTCGTCTTCTTCGATTTCAATCTCACCGGCATGTTCTCCTTCGACGATTAAGGTTTTGGGACCCCACCTTCGAATAGGGTCAATGTTTAACCCTTTTCTC GGTCTAGTGGTAACAACCATGCGCAAGGATAGCTCATGGTTAGAGTAATGTTGCTCCGAATGAGCTCAAACGGATTCGGAATGTAGGAGGGATGCTATCA GGAGCAATGGACTTAGAAAAACATCCACCACTTTGGTGGCTATGAATCTTGAAAATTTGGTATAAGTCTTTAAGATTGAATGGCTTAGACTCTTTGTCAC TCAAGATGTTACTACAACAGCAATTGATAATGTCTCCATCTCTTGAGCATTTTGATAACTAGATAACCAGAAAATGGTGCATCTGGTGGAGGAACTTCAA GTGTACTAGGACTTCTCCTGGGATCTACCTCACTGGAAGACAAGGCAAGGGAAATAACAATTGTTTATGGCCCTTGTGAAAACAATAGAGATTATCTTTT CCTGCTTGAAAAGACCTTGCATGACATTGGTAAGCTTTCTATCTGTACCATTACAGTTACAAATTATGATTCTCTCTTAAAAAATATTAAGTTGCTGACA CTACATACATTATTTTGTCATAAACTAATTGAAATTGTTGGTATGTTGTGTTGTAGAATTAAAAGTGGCACTTTTAAGGATGGAGATTTGCTTGTTAACA GGGATGGCGTCCAAAATTTATAATTTATTTGTTGCCAATAATATGTTTTGGGATAACAAATTCATGAATGTTGTGATATTGCATTTCTTATATCTGGTCT TTATTGCATTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_84271;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_16085

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.5
• LF1: 0.6
• LF2: 0.4
• LF3: 0.5
• LF4: 0.3
• UF1: 0.1
• UF2: 0.2
• UF3: 0
• UF4: 0.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_16085

• Blastp: -
• Blastx: Gamma-glutamylcyclotransferase 2-2 from Arabidopsis with 58.14% of identity
• Eggnog: cation transport(COG3703)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G31290)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442776.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;