Ll_transcript_534108

• Id Trinity: TRINITY_DN36493_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_534108
• Sequence: AATCAATCAAGGTAATCTCACTCTCCTAATTTGATTTAATTTTTTTAGATTTTGTTCTTGTTATTATGCTTTTATTCTTCATTCAGCACATTTCGAAGAC TTGCAGGCTCTCTATACTTAATAGCCTGTTAGATCAAAGCGTGTGCAACATCACAATTCATCATATTCTTCATTTCATATCCTCTTGTTCTTATTTTCTT GAGGTTTTATGTAGAAATGATGAACATTCTCTAATTAATCCACAACTTGTTACTATTAAATTTTAAGTGTTGTGTGATTTATTGTTTTAATTCACTTTTT TTTTTAAAAATCAATTTTTTTGTGCTTATGGACGGTCATGTGCTGATTAGATTCTACATCAGCACATAACATATAAACCTAAGCTATATCTAATGTTGCT ATGATGTATATATTTGTGTGTCTTCCAATGATTAAATGGGAAACACACTATACATTGTGGCAAATATTGTAAATGTTATTAATTCATACTTATGTTTTAA TTACAAAATTTTAGAACTCCATTTCTCTCATTTTGAATTTGAAGGTATTTTCTATTTCATAGTATAAACCTATTTTTTATTGAAGCAATAATTGTGACAG TAATGTTTCAGAAATAACCAAAAATGTAATGCTTGCTGTAATACTGTGTCACTGTTAATAGTATTATTTTGCAATTGTATTCAATAACTTTTAAAACCTA ATTTTTGTAGCATTTATAGACTGAATTGTCATCATAATTGGATAAAGTTTAGCATTTTGTTGATGTTCACAATAACTTAAGTTATTTTTTCAAACATTAA TCACTTCTTTAACTTTAAGATTGGCTTTTTATGATAACTATATATTAATTTTGTATAAATGTATAATAGTTGAGTTGCGAGAGGGTGAGCCTCAATGCAA TTGTAAGTTGCTTGCTTTGTGACTCGGAAGCATGAGTTCAAATCCTCCAAACAGTTTCATTATTCGTGACAGTAATACTGTATATATCTGCCCTCTCTAC ACCCAATTAGATGTGAGTGTTTGCACTGAGCTGCCCCTTTTTATGATAGTTGTGTTGCTGTAAAATTTGATATATCCATGCTTCCTGCATTGGCCATATT CATCAATATTTGTGTAAAATTATATCTTGAGTCTCTATTTATATTAAAATCTATTCTAATGAATTTTGTGATGATCTTTGTGTAGGAAGTTTGGTTGTTT TGTGACTTAGTAGTGACTAAAGATGTCAAATCCAAAAGTGTACTTTGATATTCTAATTGGAAAGTTGAAAGCTGGGAGAGTAGTTATGGAACTCTTTGCT GATGTTACTCCAAAAACAGCTGAAAACTTCAGGGCTCTATGCACGGGCGAAAAGGGCATCGGTAGATCAGGGAAACCTTTGCACTACAAAGGATCAGCTT TCCACCGCATTATCCCAGACTTTATGTGCCAAGGAGGAGATTTTACTAGAGGGAATGGAACCGGAGGGGAGTCAATTTACGGCGCGAAATTTGTGGATGA GAATTTCAAGCTAAAGCATACAGGGCCTGGTATCCTATCCATGGCTAATGCTGGACCTAACACTAATGGTTCACAGTTCTTTATATGCACTAGTAAGACA TCATGGCTTGATGGGAAACATGTTGTGTTTGGCAAAGTTGTTGATGGATACAGTGTAGTGCAGGAGATGGAGAAGGTGGGTTCAAATGGTGGGAGTACAT CAGAACCTGTTGTAATTGAAGATTGTGGTCAGATAAAAGAAAATTGAATGTATTTATTCTCTGGAGATGTTATATAATAAGCCTGTTTGCTTTGAAGTGT AAAATTTGAGATGTTAATCAGTTTTACATATCAACTTTTTGTTGATTTTATTCTAATCTTATTAATCAGTTTATGTTTTACATGTCAACTTCAGTTTATT CTAACTTTTTCTGGAGATGTTGGTTTTATTCCAATTTCATACTGAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_128110;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_534108

FPKM

• PAB: 0.6
• PNAB: 18.7
• PS1: 7.3
• PS2: 5
• PS3: 7.5
• PW1: 7.9
• PW2: 6.6
• PW3: 4.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_534108

• Blastp: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-3 from Arabidopsis with 85.47% of identity
• Blastx: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-3 from Arabidopsis with 85.47% of identity
• Eggnog: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity(COG0652)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G56070)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019433438.1)
• Pfam: Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD (PF00160.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;