Ll_transcript_317721

• Id Trinity: TRINITY_DN36717_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_317721
• Sequence: GACCAAATATGCGGTAGGAATATGAGGTTTCTGACCGGCGAATTGTGATGCATCGAGACACAAATAAAACAACACCCCATTTTCTGGTTTCACCTTTGCA ACTCAAAAAACCTCAACTTTAATGTTCTCTTAGTAAGTTATCTTCCTCTTTATACCTCTTCCACTCTTTATCTTACAAAAAAAATGAGAACTTCATATTA GTCCTTTATTGGGGTTGGAAGTGGTGATGTTGAATTATGGTTGCAAAGTTATCAACTAAAGTTCTCAACATATGCATTGCTTCAATTTGTAAATCTAAGC AATTGGGTAAAGCTGAAATTGTCTTAATTGATGGTATAAGATTAGGTGTTCTTCCTGATGTTGTTACCTACAACACTCTTATTGATGCATATTGTCGTTT TGTTAGCTTTGATGCTGGTTATGCTGTTCTTTATAGAATGAATGAAGCAGGTATAAACCCTGATGTTATTTCCTATAATTCTTTGATCTCTGCTGCTGCA AGAAAATGCTTGTTGTCTAAGTCCTTGAACCTGTTTGATGAAATGCTTCAAAGAGGTATACACCCTGATGTTTGGAGTTATAATATATTGATGAATTGTT TGTTCAAGCTTGGGAAACCGGACGAAGCGAATCGTATTTTTATGGATATAGTGCTTGGGGAATTTCGTCCCAGTCCGGCTACGTATAACGTCATGATTAA TGGGCTGTGCAAGAATGGGTATGTCAATAACGCTCTTGCACTGTTTAGGAATTTGCAGCGGCATGGGTTCATTCCTCAAATTTTGACGTATAATGCTCTT ATTAATGGACTTTGCAAGTCTAGAAGAATGGGTGCAGCAAGAAGGATTCTTAAAGAGTTTGGGGAATTGGGTTATGAACCGAATGCCGTTACCTATACTA CAGTTATGAAGTGCTGCTTCCAATGTAGTAAGTTTGAGGAAGGGTTAGAGATCTTACATGAGATGAGAAGTAAAGGGTATACATTTGATGGCTTCGCGTA CTGCACGGTGATTGCTGCGTTGATAAAGACTGGAAGGATCCAAGAGGCTAATGAAATCATTGAGCAGATGCAGAGTAATGGTATTGAGCCAGATCTGGTG TCTTATAATACATTAATAAATCTTTATTGTAGACAAGGGAAATTAGATGAAGCTTTGAAATTATTGGATGAGATAGAGAAAGAAGGTTTAGAATGCGACA AGTACACCCACACAATTATAATCCATGGCTTATGCATGGCTGGAAATTTTTTGGGGGCTGAACAGCATTTGAATTATATGAACACATTGGGTTTTGGTTT TAATTTGGTTGCTGTTAATTGTATGCTTGATGGCTTGGGTAAAGCTGGTCATATTGACCACGCCATGAAATTGTTTGAAGCGATGGAGGTTAAAGATTCT TTCACATATACCATTTTGGTGCACAACCTTTGCAGGGCGGGAAGGTTCCTTTCTGCCTCCAAGATTTTGGTTTCTTGTATAAAGTGTGGCTTTAAGATCT TAAGGGCCACTCAGCGAGCTGTTATTGATGGCCTCATTAGTATTGGGTATACAAATGAAGCCAGGAAGCTTAAGTCTAAAATTCGAATAGCTCGATTGTT ACATTGATTAGTGACAGTTGCTTTTAGGATCTTTGGATATGTATTGATTATTGGAGGAACCTTTGTTGGCCTAACAAAAGGATGAAATTCGGGTCCATAA GCCCTATAATTTGATCTTCATAACCATCATGCAACGGCAGATTATAATGATTATGCTACAACACATTTGTGGTAACAGTTAACAAAGTTGGCAAACATTC TGTACTTGCTGATATTCAACTTTATGGAATCGGTCCTTTCCAGGTGAAAAATACTTGACAATTTGTAAAAGAAAAAGGAGTGAGACTTTTTGGTATATTC CTTTGAAGAAGAAACTATGAGAAATCTCCTTGTGATAAACTTTTGTTTTTAATGGAATTTTATTGTAAAATATAAAACTAAAATACCTTATTTGAAGGTA GTCTTCCTTTTCTTATATAGTTAGCATTTGACCTGCCTTATCAAGCTCTTGTTATGGCAATCCAGATTGAGATGCAAAGACATCATGATGGCCATTTCAT TTCATAGATGTCTTGCTCCCAATTTTATTCAATTCATGGTAAAATTCTAATTTTATTATGAGACCTTGTGACG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_128299;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_317721

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 1.5
• PS1: 1.1
• PS2: 0.9
• PS3: 1.5
• PW1: 0.8
• PW2: 0.3
• PW3: 1.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_317721

• Blastp: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At4g17915 from Arabidopsis with 54.12% of identity
• Blastx: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At4g17915 from Arabidopsis with 54.12% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464934.1)
• Pfam: Pentatricopeptide repeat domain (PF13812.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;