Ll_transcript_324805

• Id Trinity: TRINITY_DN38459_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_324805
• Sequence: AAACAACAACACATAAACCCTAAGAGGAGAAGGGTTTAACGGTTTCTCTCTTTTCTTCTCTTCTCCCTCTTTCTCCATTGTTCTTCACTCTTCACTACAA ATCAATGGAAGTTATTATAGCCTCTTCATCCGTTGATTCTGGAATTGGTTGTTGGGACCTTCACACTGGTTCCGAACAACTCCGTTATAAATCATGTTCT TCACCTTCTCATGGCCTTGTTTCCGTTGGTTCTCGCTTCATCGCTTCTTCTCAGATTCGTGATCCTTTAGCTTCTTCTGGTTCTCTTCTCTATTGGTCTT GGAACAAGCCTCAGGTTGAAGTTAAGAACTTTCCAGCCGAACCCATTAAGCCAGTTGCTGCTAATCAATCAGGAACTTATTTAGCTGCTGGAGGAGCTAA TTCTGGTGATATCTACTTTTGGGAGGTTAGTTTGAATATTATGATATTTACCCATCAAAAGGGGTGGTTTCAATTTGTGTTTATGTTTTTAATTGTGGGG TTTCACTGTGTTTGGAATAAAAAAAGAAAATGTGTACCATAATTGATTGTATTATTAATAATTGGAATTTGAAATAATGCATGGTGGTGCTTTCTATATG CACCACCATTTTTGCAATAATGGTTTCTAGGAGTATTTGATGATGGTTGTGACTTCCCATACTCTGATCTCCATGGCTTTTGGTTTTGAAGGTTCGCTAT TTGTTAAACACATTCACTCAACCTCTTATATGTTTTCTCTTTTGAGTTTTGTGGGTTTCACTATAGTTGTCTGTATTGAAAGCTTGTTATGTTGAATGGA TCTGAATAATTCATGGGTAAGTTTTGAATGGATAAGTTTATAAAGAAATGCTACATTAGTTACGGAATGCCAAACTTACTCTAAAAAATAGAACATTATG TTGCTGTTTGTGGGCAAAAAACTTAGTTGTTATTGTTATTAGGTTGTGCAGAATGACTTAGTTTTTCTCTATTGTTGTTTACTATACTGTACCGAGTTTC ATGTGTTACTGGGTAGGTTGATACTGGCAGATTGCTTAAGAAGTGGCGTGCTCACTATAGACCTGTTACTTGTCTGATATTTAATGAAGATGAGTCACTG CTGATAACTGGCTCTGAGGATGGTTGCGTAAGAGTGTGGGATCTCTTCATGATATTTGATGATTTGAGAAGTCAGGAAGCAGGTAATCTTTATATGCATA GTTTTTCAGAGCACACCCTGCGTGTAACTGATGTTGCAATTGGCAATGGAGGGGCTAATGCAATTATTGTGTCAGCTTCAGAGGATTGGACCTGCAAGGT ATGGAGCTTAGCTACGGGAACACTGCTAAGAAATATAGTATTCCCTGAGGTCGTAATTGATAACATTGTATTGGATCCTGCTGAACATGTCTTCTACGCT GGCGGCAGAAATGGAAAAATATATATTGCTGCACTCAACACTGAAAGCATTCCGACTAATAATTATGGGAAGCATATTCTTGGTTCATTTTCTAACCAAA GCAAAGCAGTTACTTGCTTAGCATATGGAACCAGTGGAGATTTGCTAATATCTGGAGCAGAGGATGGAATAGTTCGTGTTTGGGATTTGAGAACTCGTAA CATTGTCCGTGTGTTTAAACATGCTAAAGGACCTATAAATAATGTTGTTGTTGTTAGGCGGGAATTGGACTCGAGCAATCCCACGTCTTTTAATGCACAA ACTTCCTCAAGAAAGCACGGCTCTTCGTTACCCCCTCCGTTAGAAAAATATCCAGCAGGCTACGAACCCTCAGATACAGTTCTTGTCAGCCTCGGAGGCG GCGAGAGACATGAGGACGTTAAATACGTCAGTCACGATGTGTTAATGAATAGCCTTAAGGAACTTCAGAATCAAGGTTCTACTGCTGCTTCTGAAATGGA GATGGAGAAACTAAAACATGATTCACAAAGGTCAATGCAAATGGTTAACCAATGGAAGAAAATGTATGAAAACTTGCATGAATTTTGTGTGAAGGAGCTC TTGGATGGTAGCAAGCAACAAATTTAGAATAAATTGACAAATAAGACATTGTTTTGCATATTGATATTGATTCTACTTAAGCACACTAGTACACAAGACT CTCTAGGTATAAATTAAGTGTTTTCGACAAGTGTCGACAAATTTGTTACTCGAGTATTTATATTAACAAATGCGTATACGTTGTTAAGTATACATTGTTA ACCAAGTCTTTCCAAACTCGATGTTGAAGCTTCTTTGCCAAACTAAGGTTCTACGGACTCGTTGTCTATTATTTTTTTAAGTGGATCTCTCCATTCTTAT TGTTTGATTACTTTTCATTAATTTCTCACTACAAGCTTCTCACAAGTTTGTATAAGATTTGTAATCTTTACAAGTTTACAACCAAATATGAATCTAGATC CACA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_130033;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_324805

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.3
• PS2: 0.3
• PS3: 0.1
• PW1: 0.2
• PW2: 0.1
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_324805

• Blastp: Protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3 from Arabidopsis with 48.11% of identity
• Blastx: Protein ROOT INITIATION DEFECTIVE 3 from Arabidopsis with 50% of identity
• Eggnog: wd repeat(COG2319)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G49180)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454514.1)
• Pfam: WD domain, G-beta repeat (PF00400.31)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;