Id Trinity | TRINITY_DN42002_c0_g1_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_428622 |
Sequence | AGACTAAGTAGTGCAATCATATCATCTTATTATAGTGGTTGATTCATCATCATAAATTTTGTTGTGACTTTCACAGAATGCTGAAGATAACCAGTACTTT GAAGGAGTGAGTCCAAAACTTGAGTTCATCATAACATCTAAGGACATTACAGACACTGGTGCTCCAGCCACATTGCTCATTTTCAACAATGAAAAGGGTT TTTCTCCTAGAAACATTGAATCTATCTGCAGTGTTGGACGGTCCACAAAGAAAGGAAACAGGAGCAGCGGTTACATAGGCGAGAAAGGAATTGGTTTCAA AAGTGTATTTCTAGTAACTGCTCAACCTTATATTTTCAGCAACGGATATCAAATGCGGCTAAATGAGATGCCTTGTCCACATTGTGGTCTAGGGTATATA GTTCCTGAATGGGTTGAGGAAAATCCAACCCCTCTTGACATAAAGCAAATATATGGTGATACTCTTCCGACTACAACAATTATCTTACCATTGAAGGCTG ACAAGGTCCAACCTGTGAAACAACAACTCTCGAGCATTCATCCAGAAGTTCTGCTGTTCCTTTCCAAAATCAAACATCTTTCTATAAGAGAAGATAATGA GGATCCCAACCTGAATACTGTTACTGCTGTAGCTATCTCAAGTGAGGTTAACTTTGTGACAAGGAAGAACATGAATGCCGAATCTTACATTCTCCATCTC TCCGCGGAGGAAAAGGGTGATTCTGGAAAAGAATGCAGCTACCATATGTGGAAGCAAAGGTTTCCGGTCAGAGTAGAAAATGTAGTGGAAAGGAGAATGG ATGTTGAGGAATGGGTTATCACATTAGCCTTCCCAAATCAGGAGAGGCTCCATAGGGGAATGAGCTTACCAGGTGTCTATGCATTTCTTCCCACCGAGAT GGTCACTAACTTTCCCTTCATAATTCAAGCAGATTTTGTCCTAGCTTCATCAAGGGAGACAATTCTCTTGGATGATAAATGGAATCAAGGGATACTAGAA TGTGTTCCATCAGCTTTTATGGATGCATTCAAAACACTTGTCATAACATCAACAAATCAAGCTCCTATATCTAATTTGCCTCCGATGTTCAAGTTCCTTC CCATTGATAGTTCCCCCTATGAGAAGTTAAATTATGTGAGGGAGAAAATCAAAGAAAAAATGCTTGAAGAAAATATTGTTCCTATTGAGACATACAGTGA GCAGAAGCACTTCTACAAGCCTCGTGAAGTTGGCAGGCTACTGCCTGAATTCTGGAACATTTTGACCAAGGCTCGGGAACAAGGAGTATACTTGCTTAAT CTTTCATCTCATGATGGAAGAAAAATCTTGAGTTCTGCTTTTGATAAAAATGAGTATGATAACATACTCAATTTTTTAGGTGTACAACAAGTCAATGTTG ATTGGTATGCAAAGTGCATTCAGAGTTCTAATCTTGTGGATGGAGTATTAGAAGATGTCTATTTGGAGCTTTTACTGTTTGTTTCCACTAACTGGACGTT GAGATTCCGTGGAACCAACATGACGAGCATTCCATTGATTAAATATGTTGGTTCTGATGGGAGTATGGCCCACTTCAGTCTTGATGAGTGCACACAACAC CATGGCGCCAAGCGAGTAATCCTAGCAGATCCAAATCAATCTTGTCCATGCTCTTGGCTGATTGATTGGAACAAAGAGTTTGGATGTGCTTCCAACCAGT TTTTTATGCCTGAAATGACACAAAAAGCTATCCAGCTATTCCCCCGGAAACAGATTTTGTTGGAGTGGCTACAAAATCATGTTAGTGTTGCTACATCCAA TATTTACACTTTTGCAAGTGCCATTTGCAGTTCTATTAGAAGTAACCGCAGGCTCGCCATTGTGTATGCTCATTTCTTATACCACTCTTACTCAAGGTGT TATTTATTAAACCGGGAGGTTGATGGTCTGTGCAGTTGTTTGCCACTTGTTGACAACTACGGATGTGTGACTGACAGCAGAAAAGGAGTTCTTGTACCTG CAAATGTGAGCAAATGGGCAGATTTAATTGTTTCCAATCCTTGGAGAAGTGAAGGTTATGTTGAGCTTGGAGAGGAGTACTTGCATCCATGTCATTATGC AGGCCAATATACACGGAATGGGGAGCTTATTGCATTCCTTAAAACTCATGCTAATGCTTCTGATATACCTCATATATCCCCTCCAAATGCTGGATTTTCT GCTGTAGATACACCACTTACCAAAGACAATGCTTTCTTGCTTTTAGATTGGATTCGGAACCTGAAGTATAGGGGAACACATTTACCACAGAGATTCTTGA AGTGCATAAAGGAAGGCAGCTGGCTAAAGGTTACAGTTAATGGATGGAGGCCACCTTCACAGTCATTTTTAATTCGCTCATCTTTGGGAAAAATTTTGCA AAATGGTTCTGTTCTTGTTGACATACCACTCATCGATGAGAGTTTCTATGAGGACAGAATAAATGAGTATGAGGATGAGTTGAAAACAATTGGGGTGATG TTCAGTTATGAGGAAGCATGTGAATTCATTGGAAGAGAACTCATGTCTCGTGCAGCTTCCTTCACTTTGAGTAGAAGTCACATTCTTTTGATGCTTAACT TCATCCAATATCTGAGGAAAAGTCTTCTTCCCTTAGATAAATTTGTCAACAGCATCAGACAAGGAAGTTGGTTGAAGACATCTCATGGTCCTAGGTCTCC TATAGGATCTGTATTGTACGATTCAGGATGGCGAGTTGCATCACAAATCAGTGATATCCCTTTCATTGATCAGGCTTATTTTGGTGATGAAATATTTCAA TTCCAAGAGGAGCTTAAGTTGTTAGGTGTGATAGTTGGCTTCAGTGAAAACTACCAAGTTGTAATTGACCATTTGAAATCACCATCAAATTTGGTCTCTT TGACAGCTGAGGCCCTTCTTTTGATACTCGAGTGCATTCAACTTCCGCGTACCTCTAGCAAACTAATAAATTCACTCAATGGTACAAACTGCTTCAAGAC AAGCATGGGTTTGAAAGCACCTGCAGAATGTTTCTTGTATGATCCTGTATGGGGTTGTATGTTAGAGGTATTCAATGGTCTTCCAGTGATTGATCATAAA TTCTATGGAGAAAAGATTTTCACTTTTAAAGATGAGTTGAAGCGAATGAAGGTGGTGGTTGATTTTGATGAGGCAATACAAAAATTTGCTGGTCTCTTCA AACAGATGGCATCACATGCTTCCTTTAACCAACAACATGTATATTCATTTCTCTCATGTTGTCGGCGGCTTAAGGGAACTGAATACAGATTTCCTCCAGA TTTCTCAATCATCATACACAACCAGAAGTGGTTGCTTACTCGGGTTGGTGATTATAGGTGTCCAGGACACTGCATTCTATATAGTCCAAAGTGGAAATCA CTCTCTCCAATAACTCTTCTCCCTTTCATTGATGACACTGACACATGTTATGGTGAGGCAATACATGAGTACAAGGAAGAGCTGAAGAGAACTGGTGTTG TTACCGAATTCAAAGATGGGGTGAAGTTTGTGCCTAAATGTCTAAAATTCCCTTCAGATCCCTCCACCATCACTCCTGAAAATGTGTTTTCTTTGTTAGA ATGCATTAGACTTCTAATAAAAGAGAATAATCCTTCCCTTGATGTTGACTTCACAAAAAGATTATCCAAAAATTGGTTGAAGACTCATGCTGGTTATAGG CCTCCAGATAAGTGTTTGTTGTTTGATTCCAAGTGGAATTCTTACCTGAAGCCAAATGATGGGCCTTTCATTGATGAGAATTTTTATGGGCCCAATATTG CAACTTACAGGAAGGAACTTAATGTAATTGGAGTCACTGTTGATGTTGAGAAAGGTTGCTCCTTAGTTGCTAGTCACCTTGACTTTCACTCTGATTATGA CACCATTGTGCAAATATATAGGTATTTAAGTAAACACAACTGGAAACCTGAGGATCAATCTGCCAAAAAGATTTGGATTCCGGATGGAAATAAAGATGGA AAGTGGGTCAATCCTGAGGAATGTGTCATACATGACCAGGATAATCTTTTTGGTTCAATGTTTTATGTTCTAGAAGGTTTCTATGATAAGAAGATACTTC CTTTTTTCTCCTTTGCCATGGATGCCAGGAACAAGCCTTCGGTTGACGATTACATCGACCTTTGGAGTGGTTGGGAGAGTTCAGTGGAACAACTGTCACT TGACAAGTGCTATAAGTTCTGGATGTTTATCTTGCAACATTGGAGCATAAAGACCGAGAAAAAACTTTCTGATAGCTTGAAGAAACTACCTGCAACATCA GGCAACAATGAAATATTTTTGCTAGACAAGGAAGGTGTTTTTATTGCTGATAATCTTCATCTCATGAAGCTTTTTGAAGGGGAGAAAGTTTTTGTCTGGT ATCCTCGGCAGAACTTGGCGCCACTGGAAAGGTGTAAGTTGTTTGACATCTACAGAAACATTGGTGCTCGGAATATCTCTGAATCTCTGTGCAAAGAGGA ATCATCTTTACTAACTAGTGTTGAACTCAATCAGGTGGATCCAAGTAATGTTTTCAACCTTAAGGGGTTGGTTAAGCTTATTCTTGGTTTCCTTGCATGT TCTAGCTTAAACATGGATGTAGACAAGAGGCATGAAGCTGTTCAAGGACTTCTGAACCTGAAGTTGTTCGAGTCAATGGAGCCAATCACTGTAAGCTATA GTTTATCACTATCATCAGGTGACATTATAACCAAGAAAGCAAACAGAATGGTGAGGTGGGAAAAGGAAAGTTTCAAGTTTTTCACTCAGAAGATGGACTG GCTCAGTGGCAATTCAAGTTTGATCAAGTATGCTACATATTTCTCAGAAGCAATATCGGAGGGTGTTTTGTGTGAGAATCATGATCATGTAGCTGAACTA TCTGAGCTGGTTAAATTGGCTTTTGTGCTGAAATTCAACAATGAAGAAATTGAATTCTTAATGGAGTCAAAGAATTTGCAGATTTTCTGTGAGGATGAGG AGTTCCTCAGTTCTGCCTTCCCCTCTAGCTAGGTACTTTGTGCTGATCTCTGTAATATTTCGAAGGTTTGCTTGTTGTTTAATCTGTGTTTGTTTGTTTG TATGATATGCTTTTTATTTCAGTTCATCAGTTGTTACTTTAACTGTGTCATTATCAGTGTTGTGTGGGTGACTATTTAATGATTGTAAAATGCAGTATGT TTACTAAGTTCAAGAGTTGCTTGTAGCTAAATTTCTAGTCCAATTGCTTTCTTATTATTGCATGGTTGAATCCAGTTCTTTAAGGACCA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_134023; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_428622
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421490.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |