Ll_transcript_503575

Id TrinityTRINITY_DN42133_c0_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_503575
SequenceTGTGAAGCTGCTAATTGAAAGGTTTGGTGAAGTATGTGATGATCCTATGGTTGAGCTTATGAATCTAAGACAAAAAGGTTTTGCAGCTGATTTTCATGAG GAATTTGATGCCATAATCACACAGTTGGAGCTATCAGAAGAATACACACTGAGTTGCTTTTTGGGAGGCTTAAAGCAGGAAAAATGATGGTGAGGAGAAA ACTTTTTCTTTGGCTAAATTGTATGAGTCTGCACAAAATTCCAGTTCTATGTTGCCTTTTCCTTTCAAAAACAATAAGGGTTTCACCCCTGCAAAAATTA GTACTAGTGTCAAGCTTGCTCTACCAATGGACCCTGGTATTGATGTGCTTAAACAAAAACCTAAAGCTAATAAGAGATTAACCCCTGCTTACATGAATGA ATGACGAGCAAAAGGATTATGCTATTTTTGTGATACTCCCTACACACCAGAACATAGTTTGACTCACAAGAAATTACAGTTGCATGTGATGGAAATTGAA GACAATGTTGAGGATCATACTGATACATGTGAAGCAAAGAATGAGGCTAGGAGTTTTGGTGAGCCACAAATTTCTGTGAATGCTCTTACGGGTATGGCTA GCTTTAGAACTATGAGGGTTACTAGATACTTTAATAAAAAACCATTGCATATTCTTATTGATAGTGGCAGTACCCACAATTTCTTAGATATTCAAAAAGC TAGAACTTTGGGTTGCAAGACCAGTCCATTAGAGCCTTTAATGGTCATTATGGTTAATGGTAATAAACTACACATTTCAGAAGTGGTTGAGGGTTTTTCT TGGTCACTTCAGCATACCAATTTCACATCTGATATGATGTTGATTCCTCTGGGGTGTTGTGATATTGTATTGGGCATTGAGTGGTTGGTCACTCTTGGAG ACATCACTTGGAATTTTGATAAGTTGACTATGGATTTTGTTGTTCAGGGTAGACGACATGTGCTCAGAGGCTCACCAAACAATGGTGTTAAAACCATAAA AAAAACAATTGGAGAAAGCTTTGTCAGAAAGTGTCCAATTGTCCATGTTGCAGCTATGTCCTAATGAGGGTGGGTTGCTGCAATCTCTCACCACTCATGC ACAACAAGCTGATCTTTCTGAACAACTAGGATAGGTGTTGGACAATTTTGTTGAAGTTTTTGAGGAACCATCACAGCTACCTCCTATGAGAGTTGGTCAC AATCACCAAATTCCACTTTTACAAGGTACCAATCCAGTGAATAAGAGACCCTATAAATATGCTAAACATCAAAAAGACATTATTGATCACCTGGTTCAAG ATATGTTGCAATCTGGTATAATTCAAAATAGTTCTAGTCCTTATGCTAGTCATGTTGTTCTGGTGGGCAAGAAAGATGACTCTTGGAGGTTGTGTGTGGA TTATAGAGACTTGAACAAAGGCATTGTGAAGGATAAATTTCATATTCCCTTGGTTGAAGATCTTATGGATGAGCTACATGGTTCAACAATTTTCTCTAAG TTGGACCTAAGAGTAGGTTATCACCAGGTTAGAATGGACCCTGCAGATATTCAGAAAACTGCTTTTAGAACTCATGCAGGCCATTATGAATACTTGGTCA TGCCCTTTGGTTTGACAAATGCCCCAGCTACCTTTCAAGGGTTCATGAATTTTGTTTTCAGTCAATTCCTTAGGAAGTTCTTGCTAGTCTTTTTTGATGA TATCCTCATCTATAGCAAGTCTTTGAAGGATCATGTGGAGCACCTTACTCAAGTATTGTTACTGATGAAGAACAATTGTTTGTTTGCCAAGAAACCTAAG TGTTTTTTTGGAGTGAAAATGGTGGAATACTTGGGACATTTTATTTCAGCAGAAGGAGTTGCAACAGATCCTGCAAAAGTAGCTGCTGTAAAAGAGTGGC CTCTACCTCAATCCTTAAAACAATTGAGGGTTTTTTTGGGTTTAGCAGGCTACTACAGAAGGTTTGTGAATGGATATGGAGGAGTAGCCAAACCTCTTAC TGAGATGCTCAAAAAAGACAATTTTTGTTGGACACCTGAGGCCAAAGCTGCTTTCATTCATCTCAAGCACTTATTGGTGACAACTCCTGTCCATGCTATG CCTGATTTTTCTAAGGCATTCTTGGTTGAAGTGGATGCATCAGGAGTGGGGTTAGGTGTTGTATTAATGCAAGATCATCATCCTATAGCTTATATCAGTA GAGGCTTGAGTCTTCAGCAGCAATCATTATCTACTTATGAGAAAGAATTGATGACGGTGGTCTTTGCTGTTCAAAAATGGAGACATTACTGGCTTAATAA ACACTTTGTCATTAAGACTAATCATAGCAGCCTCAAGTATATGTTTGATCAAAGGCTAACCACTGCTTTCCAACAAAAGTGGTTAGTCAAACTTATGGAG TTTGACTTTATAATTGAATATAAGCAGGGATAACATAGCAGCTGATGCACTCTCAAGGATGGACACTTGCAATGCATTGTTGGTACACAAAGTGGATGAT GCATTGGTGGATAGAATAAAACAATCATGGATTCATGATGAAGGATTGGTGAGATTAAAGGATCAACTTCAGAAGGATCCTTCTTCTCATAAACATTACA CTTGGTTACATGATGAATTAAGAAGGAAGGGTAAGTTGGTTATTAGTAAAGATGCTCAACTCATGGAAGATATATTACAGTGGTTGCATACCACTGCTGT GGGTGGCCATTCTAGTAAGAATGCTACTATACAAAGGTTCAAGGTTGTGGTGTTTTGGAAGGGATTGAACAGATATGTCAAAGCTTTTATCCTTAGGTGT CCCACATGTCAGAAGTGCAAGTATGAGACAAAGACATCCCCTGGTTTGCTTCAACCATTACCTATTCCAGGTCATGTATGGCAACACATCACCATGGATT TCATAGAAGGTTTACCCCTATCTTCTGGTAAACAGGTCATATTTGTAGTGGTTGATAGATTGAGCAAGGCTGCCCATTTTATGGCTTTATCTCACCCTTA CATTGCTACCAATGTAGCTCAATCCTCTCTGGATAATGTTTTCAAGTTGCATGGTTATCCATATTCCATAACAAGTGATAGGGACCCCATTTTCATCAGT AAATTTTGGTAGGAATTGTTTGCTTTGCAAGGTGTGCAACTCCAACTCTCTTCTTCTTATCACCCTCAGACTGATGGGCAATCCGAGGTGGTGAACAAGT GCTTAGAAACATATCTCAGGTGTATGTGTTATGATTCCCCTCAGCAATGGATGAAGTGGTTGTCTTTGGCTGAACGGTGGTATAACACCATATTTCACAC TTCCATTCAAGTTACACCTTATGAGATAATGCATGGCTAACTCCCTCCAATTTATCTTCCTTACTTGCCAGGTGGCTCTAGCATTGAGTTGGTGGATCGC AGCCTAACTAAGAGGGATGAAATGTTGAGATTGATGAAGTTCCATTTGAGAAAAGCTCAAGACCGAATGAAACAATTCGCAGACAAGCACAGAAGTGAAA GAGAATTTATGGTGGGTGATTTAGTTTATGTGAAGTTGCACCCCTATAGACAAGTTTCAGTTGAGCATAGGATGAATGTCAAGCTTGCTCCTAAGTACTT TGGGCCTTATCCTATTGCTAGCAGAATGGGCAGAGTAGCTTATGCATTGGCTCTTCCCTCTAATTCGAAAATTCACCCTGTGTTCCATGTCTCTCAACTC AAAAAGCATGTGGGTTCAGCTATTACTTCTACTGATCTTCCTAATTCGGATGTTGGCAGTGTTTCATTCAAAGAACCAGAGGCTATTTTGGGTAGGATGA CAGTGAAGAGAAGGGGTCAGGCAGTGACAAAGGTGTTGGTAAAATTGAAGCATCAATTGCCCGAAGAAGCTACTTGGAAGTTCTTCTTTGATCTAAAGCA GAAGTTTTCCTCTTTTAATCCATGAGGTCATGGATGTTCTTGTGGAGGGGGTATTGATAGG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_134198; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_503575

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_503575

BlastpRetrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 from Sophophora with 40% of identity
BlastxTransposon Tf2-6 polyprotein from Schizosaccharomyces with 33.33% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_014490494.1)
PfamReverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) (PF00078.26)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;