Ll_transcript_451666

• Id Trinity: TRINITY_DN42738_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_451666
• Sequence: TATGATCCTTTTGAATGATTTATACCTTTAATTACTATAATTTTCAAAAGGGTATTTTAAAAATTTCAACTTTTTTTCACCCTTTTTGAATAGCTTAAGA TGGGTTTATTATATTTGTAACCATAATTCTTCAGGGATATGTTGCTGTGAAATGTTAATCAAAATTTGTTATTTTTCATTTTGGTATCGTGGATCATTGA TTGTGTAAAATAAATTGTGCATTATTATTATTTTATGATTTTATATTAATTGAGCATGGCTGTTGCATATGTAACCCTAACTAATGGACAATTTTAATTT GTGTATTGTTTGATTCAGTTTTTGATTGTTGAGGATGGTGTTGGTTTTAGCCCTAGGGGATTTGCACATACCTCACAGGGCGGCGGATCTTCCTGCGAAG TTCAAATCGATGCTCGTCCCCGGAAAGATCCAACATATCATTTGTACTGGAAATTTATGTATTAAAGTATGACCATTTTTTTGAATAAGTATTACTGGTT CAGTTTAACTGTTGCCATTCTATTTTGGTCATTTTCATTTGCCTCTACTTTATAGTTCTCGACTATGGTAGATTATGAAATCACAAGGGTGTGGTGGTCT GAATTATATTTTTCTTGCCTTCTGTTTTCTGTAAAATCAAATTATTTTCCTCTTAAAATATTATGGTTGTAACTTGTGTACCTTGTGAGATTCAAGTTCA TTGGAAAGGTAAATTGTAGCCGACTCCACCGGATGGTATTAAGGCTTAGTTGTTGTTGATCGTTGTTGTAGAAAGGTAAACTCTCTGTACAAGCTATAGG CTTTTACTTGAACATTTAGATGTTGGATGCATAACATTTTGTTGTAGAAAGGTAAACTCTCTTTACAAGCTAATGTCTTTGCCACTGTTCACGCTTCTTA GGTAGAAAATTGATGACTATTGAACAACTAGTGAAATTGGGTAGTCATGGGAACTTGTAAGGAACGTGTGTATTGATGTATGTGACCAGTGGCATAGCCA TGGTGGGTTACTCCATGGTTTTGTGTAATAAGTAAGACGCATATCCTCCAGTTTGGAAGAGCAAGTTGAAACACTGTTCATTTCACTCCCCATTATTTCT CGTTTATATTATGAAAATTGTCCATTTTTGAAGAGCAAGCTGAAATGTTGTGTTGCTTTGTAAAAAAAATTAATCGATGCACATTAATGGGGATCAATTA TGAATGTGAGTTGTTTTAATGTTTTGTCTTCTGTAGCACAGGTAATTTTCACCTTACAATAGCAGTTATTCTGTTCTATGTTATTTGTGCCACGTATTGC ACCAATTATCTAGTTGCAACTATTGAAAATAATTCAGTACATTCCCTGTGGTTCTTTTTTATATATATGAAAATAGTTATTTTAAGCACATTAAGTTGTA GGATGTGGAATTAGACGAGTTCTCTTAATGCTTTACCTTGTTAGCTAACTTTTATGTCATTTATATTCAGGAAGTTCATGACTACTTAAAAACACTTTGT CCAGACTTGCATATAACTCGCGGTGAGTATGATGAAGAGACGAAGTATCCAGAAACCAAAACACTAACCATTGGCCAATTTAAGCTGGGACTATGCCATG GTCATCAGGTCTGATTTTGTTTTGATTCTTCGATATTGTTCCCCCGCAGTTAAGCTGGGTTTATATAGGATTTCATGATCAAGGGTCAATAAGTTTAAGC AAGAGTAAAAGGTTTGATCAAAGTCATTACTATAGGTTACCCGACACCAGCTTCAATCCGAGTTTTATTTTTTTTCCGTTGGGTAGTTTAGGTTGCATCC ATAAAGGTGTGGCTGTATAAGAAATTGTTGATTCAGTCAAGTTGAAACTAAAAACTGTATATACATTATGCAGTTATATTATGATGCAGTTATATTATGA TGCAGTTATATGATGATCGTGTTCTTCTTAACGTTTGTTAAGGTTATTCCATGGGGAGACCTAGACTCGCTGGCAATGCTACAGAGGCAGCTTGATGTAG ACATCCTTGTCACAGGTCACACTCATCAATTTACAGCTTACAAACACGAAGGCGGCGTGGTTATAAATCCGGGTTCTGCAACAGGTGCCTACAGTAGCAT GACTTATGATGTGAACCCAAGTTTCGTCCTTATGGACATCGATGGTCTGCGTGTTGTGGTCTATGTATATGAACTTATTGATGGAGAGGTTAAGGTTGAC AAGATTGACTTTAAGAAAACAACCACAACCCAATCTGCTCCTTGAACACTTTGTTTTTTGGGTCTTAGTCTTTTGTATCTTCTTTTTATCTTATCTGGTT TAGATTTTCTTCTCTTTCAAACATTACAAGTGTGTACTGATTTTAGCTTTGTTTTGATTTGAACTCTTGTATTTGACCATATCATAGGATCTTATGATTT CATCAATTTGCCTTCTATGCCAAACACATAACTCATTTCATAAGCAGGTGGTTATAGCTTCTACCATCTGCACCATAATCAATTATGAGTAAATCTCTAT TGCAAGCTTGTTAGAAATTTGTAACTGAGTGATTGATGATGTATTCATCTTTGATTTAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_135002;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_451666

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.3
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_451666

• Blastp: Vacuolar protein sorting-associated protein 29 from Arabidopsis with 88.12% of identity
• Blastx: Vacuolar protein sorting-associated protein 29 from Arabidopsis with 88.12% of identity
• Eggnog: Phosphodiesterase, mj0936 family(COG0622)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G47810)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425714.1)
• Pfam: Calcineurin-like phosphoesterase superfamily domain (PF12850.6)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;