Id Trinity | TRINITY_DN42915_c0_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_334079 |
Sequence | CAAACACTTAAACTCAGACACAAAGGTAAGAGAATTGCACTACACAACTCATCATCTTAGACATGTCTAGTCCTCAGTGTTTTGAGAATCCACCAAACTT GAACTCAGTTATCCATCTAGCAGGCACTACCCAACAATTTGGAGGCCTTAAATCCTATGTTACTGGACCTTCTGATTCCAAATCAGCACTTATCCTTATT TCTGATGTATTTGGTAAGATAACTATATCTCTAATGAAAGTTTAGTTTTTTCAAGATTCAGTCTGAAACTTGCAACTTGCTTTGAAATTATTTCAGGGTA TGAATCACCAAATCTAAGGTAACCGAAATTTTTATTGCAATGCTTCCTTTGTACCATCGTGTGTAATATCCGGTGTTATTAGTACCGTACTGGTATATTG GTACTGTTAAGGCGAAATTAGATATACATGTATAATATATTAAAAATCAACAAAAACTAATATTTTTTATTTTCATTAAAAATTAATTTTAAATAAAACC AGCCCATATGACCGGTACGGTTTAATTGAAAACCGGCCGGTATCACTGATTTTGATTGGTCTTGGCCGGTTTTGACCGATATAATTGCATGACCAGTTTA ATTACTGTACCATACTGGTATTGGGACCGGTTCATCGATTGAACCGGCCGGCACAAACCGGTTTTTACAACACAACTAATATAAACTCTAATAGGATTGT ATATTGAGGATGCATGATTTTTTGGATAAATTACAAAAATGACATGACAACTAACCCAATTAGTGGTGAAGGCTTGTATCAATAAATCTTAAGATGGTTT GTGTAGTTTACCTTAATTTTGAAGTAGTTGAACTTACATGGTGCCATAAAATTGATAGAAGTTGAACCTTCTAAGTATATAATTGTAAGTTTAATGTGAC AAGCCTCTCAAGTTAGATTCTGTTAGGCTTAATTGCTGCATCAAGTTTACTGCCTCTGAAATGATTTGCAATTAGCTTTGACATTCCCTCACTATAAAGG AAACTCGCGGACAAAGTGGCTGCAGCTGGATTCTTGGTTGTTGTTCCCGATCTTCTTTATGGTGAATATGTCGATCTTGACAACCCTCAATTTGATCGAG ATTCATGGCGTAAGGCACATGCACCGGAAAAGGCAAGTGAAGATACCAAACCTCTAATTGCTGCTCTAAAGAGTAAAGGTGTTACAGCCATAGGGGCTGC AGGGTTCTGCTGGGGAGGGGTTGTGGTTGTGAAATTGGCACTTTCAAGTTCCAGTGATATTCAGGCTGCAGTTATTCTGCATCCTGGACCAGTCACAGAT GATGAACTTAACGGTAAATTCGTGCTTTTCGGCTTTGTGGTTCGACATTAGTACAGCAATTATTGACAAACTTTATTTACTTTGATCAGAGGTTAGTGTT CCTCTAGCAATATTGGGAGCTGAAATTGACACTCATTTCCCACCATCAAAGTTGAAGCAAGTTGAGGAGTTGTTGTCTGCAAAATCAGAGGTGAGAAATT CTTAGTTTATCCTTTGTTGCTTCTTCTGATTAGATTTCCTTTATGATGATTTTGGTTTGTTTACTCAGCAGAAATGGTTAAAACAAGAAACAAATTTTGT TCACTATTTTTTTGTCGAAAGTTAAAATATAATAAGCAGACTAAAAAATGAGATAATGCCATGATATTTTCATCTTCCCTAGAAGAGGAGTGTCATCACA TACTCAAATTTCTATAACTACCTTAGTCAAAATATCTGAGGTTGAGTTTATCGCAACGTTAATATTTTTGCTTGCTTAGTCATAGGTTTAAATTCTGGAA ACAGTCTTTCCACTTTAAGGGATAAGGTTGCGTATATTTACCCTGTCTAAATTCCACTAAGTGAGAGCCTTGTATATTGGACCGACTTTTTTACCTTAGT GAAAATATCCATAGGTGCACTATTGACTCCAAGTTGCTTATGCTTTTTTTTCAATCAGTTTAACAGCTTTGTGAAGATATACCCTGGTGTGAGTCATGGA TGGACAGTGAGGTACAATGTTGATGATGAAGCAGCTGTTAAAAGTGCAGAAGAGGCTCATGAGGACATGTTGAATTGGTTTATCAAACATGTCAAGTGAA CATTGTTTGCACAACAAAAGATGTCTGTTACTGAAATCAAGTGTGAACAGAAATCTGGTTGTTTAAAGTGATTCAGCTTTGGCTTATGTGTTTAGGATTT GTGATTTTATCTTCAACATATCATTAAAGAGTTGTTTAAATTTGTATTGTCTTGTATTCATAATTTGTCTTTTTTTACTTCAAATATTTCAGTGATGTGG TGTGTTCATGACTTAAAATATTGCTCACATAGTCACATATAATATTATGTTGTTTAGTCATACAATTAGATTCATAGCCAAATTACTTTAAAAAGGTCAA AATAGAGâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_135273; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_334079
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Endo-1,3;1,4-beta-D-glucanase from Zea with 43.75% of identity |
Eggnog | dienelactone hydrolase(COG0412) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019439774.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |