| Id Trinity | TRINITY_DN42915_c0_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_334086 |
| Sequence | ATCCTTATTTCTGATGTATTTGGGTATGAATCACCAAATCTAAGGTAACCGAAATTTTTATTGCAATGCTTCCTTTGTACCATCGTGTGTAATATCCGGT GTTATTAGTACCGTACTGGTATATTGGTACTGTTAAGGCGAAATTAGATATACATGTATAATATATTAAAAATCAACAAAAACTAATATTTTTTATTTTC ATTAAAAATTAATTTTAAATAAAACCAGCCCATATGACCGGTACGGTTTAATTGAAAACCGGCCGGTATCACTGATTTTGATTGGTCTTGGCCGGTTTTG ACCGATATAATTGCATGACCAGTTTAATTACTGTACCATACTGGTATTGGGACCGGTTCATCGATTGAACCGGCCGGCACAAACCGGTTTTTACAACACA ACTAATATAAACTCTAATAGGATTGTATATTGAGGATGCATGATTTTTTGGATAAATTACAAAAATGACATGACAACTAACCCAATTAGTGGTGAAGGCT TGTATCAATAAATCTTAAGATGGTTTGTGTAGTTTACCTTAATTTTGAAGTAGTTGAACTTACATGGTGCCATAAAATTGATAGAAGTTGAACCTTCTAA GTATATAATTGTAAGTTTAATGTGACAAGCCTCTCAAGTTAGATTCTGTTAGGCTTAATTGCTGCATCAAGTTTACTGCCTCTGAAATGATTTGCAATTA GCTTTGACATTCCCTCACTATAAAGGAAACTCGCGGACAAAGTGGCTGCAGCTGGATTCTTGGTTGTTGTTCCCGATCTTCTTTATGGTGAATATGTCGA TCTTGACAACCCTCAATTTGATCGAGATTCATGGCGTAAGGCACATGCACCGGAAAAGGCAAGTGAAGATACCAAACCTCTAATTGCTGCTCTAAAGAGT AAAGGTGTTACAGCCATAGGGGCTGCAGGGTTCTGCTGGGGAGGGGTTGTGGTTGTGAAATTGGCACTTTCAAGTTCCAGTGATATTCAGGCTGCAGTTA TTCTGCATCCTGGACCAGTCACAGATGATGAACTTAACGGTAAATTCGTGCTTTTCGGCTTTGTGGTTCGACATTAGTACAGCAATTATTGACAAACTTT ATTTACTTTGATCAGAGGTTAGTGTTCCTCTAGCAATATTGGGAGCTGAAATTGACACTCATTTCCCACCATCAAAGTTGAAGCAAGTTGAGGAGTTGTT GTCTGCAAAATCAGAGGTGAGAAATTCTTAGTTTATCCTTTGTTGCTTCTTCTGATTAGATTTCCTTTATGATGATTTTGGTTTGTTTACTCAGCAGAAA TGGTTAAAACAAGAAACAAATTTTGTTCACTATTTTTTTGTCGAAAGTTAAAATATAATAAGCAGACTAAAAAATGAGATAATGCCATGATATTTTCATC TTCCCTAGAAGAGGAGTGTCATCACATACTCAAATTTCTATAACTACCTTAGTCAAAATATCTGAGGTTGAGTTTATCGCAACGTTAATATTTTTGCTTG CTTAGTCATAGGTTTAAATTCTGGAAACAGTCTTTCCACTTTAAGGGATAAGGTTGCGTATATTTACCCTGTCTAAATTCCACTAAGTGAGAGCCTTGTA TATTGGACCGACTTTTTTACCTTAGTGAAAATATCCATAGGTGCACTATTGACTCCAAGTTGCTTATGCTTTTTTTTCAATCAGTTTAACAGCTTTGTGA AGATATACCCTGGTGTGAGTCATGGATGGACAGTGAGGTACAATGTTGATGATGAAGCAGCTGTTAAAAGTGCAGAAGAGGCTCATGAGGACATGTTGAA TTGGTTTATCAAACATGTCAAGTGAACATTGTTTGCACAACAAAAGATGTCTGTTACTGAAATCAAGTGTGAACAGAAATCTGGTTGTTTAAAGTGATTC AGCTTTGGCTTATGTGTTTAGGATTTGTGATTTTATCTTCAACATATCATTAAAGAGTTGTTTAAATTTGTATTGTCTTGTATTCATAATTTGTCTTTTT TTACTTCAAATATTTCAGTGATGTGGTGTGTTCATGACTTAAAATATTGCTCACATAGTCACATATAATATTATGTTGTTTAGTCATACAATTAGATTCA TAGCCAAATTACTTTAAAAAGGTCAAAATAGAG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_135273; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_334086
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Endo-1,3;1,4-beta-D-glucanase from Zea with 43.75% of identity |
| Eggnog | dienelactone hydrolase(COG0412) |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019439774.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |