Ll_transcript_333770

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• Name Transcript: Ll_transcript_333770
• Sequence: CGGTTTTTTTGTTGGCGCGGTTTAATGGCCGAAACATATCAGACACCAGTTTAATAGTTGAACCGACTAATCTTATCCAGTTTTTAAAACACCGTATAAT AAGCACTAGTACATTAGTGTCATCCACACATTTTTTTTGTTTTTGCATAGATGAATTCTCTGATGATAAACCAAAACATTGCACCATCTTTTCCACATTT ACAAGTCCCACAAATCAGATTATGCAAAAACATGCGAGAATTGAAGCAAGTTCATGCCTTTTTTATCAAAACTGGTGAAACCCATAACCCCAAAGTGGCA ACAGAGCTCCTTAAGTTCTCTGCAACCTCAGATTTTCGTGATACTGATTATGCCCTCTCACTGTTCGACCAAATGCCTGAACCAAATTGCTTTGCTTGGA ACACTTTGATCAGGTCATTTTCTGAAAGCAAGGATAGGCCACTTGATGCCTTGTTGCTTTTCTGTAAGATGGTGTGTGATGGAATTGTGGAACCTAATGG TTTTACCTTCCCTTCTGTGTTAAAGGCATGCTCTGTTGTGGCTAGGTTGGAAGAAGGGAAGCAGGTTCATGGTTTGGTTGTTAAGTTTGGATTGGGTGAT GATGAGTTTGTAGTGACCAATCTTCTGAGGATGTATGTGATGTGTGGGAATATGGAGGATGCACATGTTTTGTTTTATAGGATTGTTAATGGCGTAGATG ATATTAACAGATTGGTGAGAGATAAAAGGAAACAAGATGGTGATGTGGTTATGTGCAATGTGATGATTGATGGGTATGTTAGGCTTGGGAAACTTAAGGC TGCTAGGGAATTGTTTGACAAGATGCACCGCAGAAGTGTGGTTTCTTGGAATTCGATCATTTCTGGTTATGCACAAAATGGATTCTTCGTGGAGGCTGTG GAAATGTTTCATAATATGCAAATGGGAGACGTGTCACCGAACAGGGTCACTCTGGTCAGTGTGCTGCCTGCCATTTCACGTCTTGGAGCACTTGAGTTGG GGAAATGGGTGCATTTGTATGCAGAGAAGAATAAGGTTCAGATTGATGATGTGCTTGGTTCTGCTTTGGTGGATATGTATGCAAAGTGTGGGAACATTGA GAAGGCAATTCAGGTCTTTGAGACACTTCCGAAGAAAAATGTTATAACTTGGAATGCTATAATTGGTGGTCTTGCCATGCACGGCAGATCCAATGATTTG TTTAATTTTTTTTCTAGGATGAAAAGAAGTGGAGTAACCCCTAGTGATGTCACATACATAGCCATCTTAAGCGCTTGCAGCCACACAGGTTTAGTCGACG AGGGTAGATCATTCTTTAACCACATGGTGAATGTGGTAGGATTAGAGCCGAGGGTAGAACACTATGGGTGCATGGTTGACCTCCTTGGTCGTGCTGGCTA TCTAGAAGAAGCCGAACAGCTTATATCAAACATGCCAATAAGATCAGATGATGTGATATGGAAGGCCTTGCTTGGAGCTTGTAAGAAGCAAAAAAATATT GAAATCGGAAGGCGTGCAGCTGAGGTTTTAATGCAATTGGCTCCACACGATAGTGGGGCATATGTGGCTCTCTCAAACATGTATGCCTCAGCAGGAGATT GGGACGCAGTGGCAGAGGTGAGGTTAATGATGAAAGACATGAACATAAGGAAAGACCCGGGGTGTAGTTGGATTGAGATTGATGGTATTATTCATGAATT TCTTGTTGAAGATGATTCCCATCCTAGAGCCAAAGATATACACTCAATGTTAGAGGAAATTTCCGAAAAGTTGAATTTGGAAGGTTACAGGCTAGACACC ACACAAGTCTTGCTTAAGATGGATGACAAAAGTAAAGAAAATGTGCTGCACTATCACAGTGAGAAGATTGCAGTTGCCTTTGGCTTAATTAGTACATCCC CAAATACACCACTTCAGATTGTTAAGAACTTGAGAATCTGTGAAGATTGCCATTCTTCAATGAAATTAATCTCAAAAATTTATGAGCGTAAGATAACTGT TAGGGACAGAAAGCGCTTTCACCATTTCAAGCATGGATCATGTTCTTGTATGGACTACTGGTAGCTTGTCAACTAGTTAGCTGGTACTTGACACGGTACG GGTATGTAGTTCAATCGAGTTTGCAGTTTGTCAATCTTATGATACATTTTTTATGATGAATCTGATACATGGTACGGTGAATTATACTTATGGTTTCGGT ACTGGTAGAGTTTTTCTATAGATAACTACAGATATTATGATCTATCAACTTTTTAACATGTGAGCATTTCTGGAATTTATTAAGTGTAGTTATTATTATT ATTTTTCCTTCTCCGGCTCCTATTTTCGGACACCACAGTGAAGCTTCAATCATGTGCTTGAAGACCTTCTTCAGAACACCACATTTTGCATTGCTCAACC CTCTAATCATATCATTTTTTTGTTATATGGGTCATCCAACAACTCTTGTGACATGAATCATCAGTTTTCTGTGTTGGTATAATCTTCAACTCTTGTGACA TGAATCCTATCATTTGTTCTTCTCCTGACATTCTATCGGTTTATCCGCAAAATGCAGAAATTGTTTTCCTAACCCTTAAGCTATCCTTTGTATATATGAT CACTTTTTTGTATGTAATACTCAGGTTATGGTCGTTTTGCATTTCAGTACCACTCTAATTATGATTACTTCAATGTCGAATATGGCCTCATCTCACTCGC TTTTACGGCTATCGGTTAGCCGTACCTATCATTCTCTCTCTCTATTCATCTTCCCGCTATTTTATGTAACTCTTTTACAGAGTTAGAACGCTACTCATGC TCTTCATGTTTCCGAAAGTACATTCAAGGTTCAAGTTTGGATTTTAATAAACATGTACATGATCTTAAGGCCACATCTGTAACAACAGAGCAAAAGTACC TTGACCTTAAAATCAACAACGTTTTTACCTTGTATGTTTTTCAATCCGCTACTTAGAATTGAATTTATAACTCTTTTAACGCTATTGTTTGTGGTTATTG CAGCAATGGTGAGAACGAAGAACCCGAGTGCTCATTCGAGAGATGACATCAAGCAGGAAAGCTCGGGTTCTTGAACATGGTGCCTTACAGTCTCAGCCAC CACTTGAGTCAAGTTCCTCATTTGCGGATGATATCGAGAATGGTGGTGCGTCTGATATCGGAATTAGATTGCTGACTATCAAAACATATAATTGTTGCGA TCTCATCTGAATCATGTTGCCCGAAAAATTGGCAAAGCATAGAAAGTTGATTGTGGAGACATTGTTTTAGTAACGTAAACCTTTTTATTTATAGTTATGA ATAGCCATCGACTCAGGTAAATGTTGGTAAGAAGAGAATGGGACATCCTAGACATTTTATGGCCTATCTTAATTTTAAACATGGTCACAAGGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_135355;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_333770

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.3
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 0.1
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_333770

• Blastp: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48910 from Arabidopsis with 65.86% of identity
• Blastx: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48910 from Arabidopsis with 65.86% of identity
• Eggnog: Pentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G48910)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019463731.1)
• Pfam: PPR repeat (PF01535.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;