Ll_transcript_495416

• Id Trinity: TRINITY_DN43128_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_495416
• Sequence: AAAAAACGTATTATTGCTGAAACTGGAGCTGGTCAGCATGGAGTTGCCACTGCTACTGTCTGTGCTCGATTTGGCTTAGAGTGCATTATTTATATGGGTG CACAAGATATGGAAAGGCAGGCACTTAATGTTTTCAGAATGCGTCTTCTTGGTGCCGAGGTATATCAGTTGTTATTGTTGTTCTATTTGGTTAAGCAGAT ATATCCTATATCTAGTGTCTGGGAAAGATACCTTGTTTCTCTTAAACTTTTTTCCTTTTGTGGCTTTTGTCATACTTATGTTTAATTTGCACATAATAAC CTTCTGAACTTGTGTTATGGATAAAATACGCTTCTTTCATCTCAGTACCCTATTGAATGTGCTATAATTGCAATTACGGCTTGAACTATTTCATAGCAGG ATTATCTATGAAAAAGTCTATGGCAGGTTAAATTTTGAAAATGTTGCTACTATTTATACATACCTAAGTTTGAAACTTTTTGGTGTTATTTTTTCTATCC GATGGTTATAATGATTTATATATAGAAGACAGTTACTCCTATTGTGGTGGGACCACTTTTTACGAAATTGGTTGAAGTTACTAATGAGCTCGAAGAAAAT TTGGAGTAGCATAGGGTGATTCGTGCTTGTGGATATGTATGAATTTGTTCTTGAAAGTCAATTTTACTTCATGCTTGATATATGCCATTTTCTGTAGAAG AATTTGTGTACTGGTGGTGGTACATCCATAGATGCATGATACTATAAGACGTGACAAAAACACAGAGTAGTGAGATTTAAGGAAGGGACAAAATAATGAC ATGAGAGTATTCTTAACAAATAATGACATGATATATACATTGTTCATCATGCAAATTGTGTTCTTTTAATTTGCATCAGAGGTGGTAACGTGGTATTGTG ATGTGACCATCATTTGTGTCCAAACCTAGTTGCTATATGAACATGTGATCTAGTTATTGGTCTATGATCTATCTATTAGATAATCCTGTAATGTAGGTCA GACCAGTTCATTCTGGAACTGCTACACTGAAGGATGCTACATCAGAGGCTATAAGGGACTGGGTGACTAATGTAGAGACGACTCATTATATTTTGGGCTC TGTTGCTGGGCCACATCCATATCCAATGATGGTAAGAGAGTTCCATGCTGTCATCGGCAAGGAAACCAGAAAGCAAGCTTTGGAAAAGTGGGGAGGGAAA CCAGATGTTCTGATTGCATGTGTCGGTGGAGGTTCAAATGCCATGGGACTTTTCCATGAATTCGTTGACGATAAAGATGTCAGGCTAATTGGTGTGGAAG CTGCTGGATTTGGCCTGGATAGTGGTAAGCATGCTGCAACATTAACGAAAGGAGAAGTCGGGGTTTTGCATGGAGCTATGAGCTATCTGTTGCAGGATGA TGATGGACAAATTATTGAACCACACTCTATTAGTGCAGGTTTGGACTATCCTGGTGTTGGACCTGAACATAGCTTTTTGAAAGATCTTGGGCGTGCTGAA TATTACAGCATCACTGATGAAGAAGCACTGGATGCTTTTAAGCGAGTTTCGCGACTTGAAGGCATAATTCCAGCATTGGAGACATCACATGCATTGGCAT ATTTGGAGAAAGTGTGTCCAACCCTTCCTAATGGAACCAAGGTTGTGGTTAACTTCAGTGGCAGAGGTGATAAAGATGTTCAAACTGTCATCAAGCACTT GAAGCTTTAAGGGACTTGTGTTCTTGTGTAGAACCAATGGTTTGGCTGCTGAATGGGCTTCATTTTCTTACTTAGACACAGAATTTGCTCAACTTAATGT TAAACCAAGTTCTAGTTAAAGAACCATTCATATAAGGGAAGGGGTGAAATTTTTTTAATATCTTGTATTGTTTTTTATGATAATCTAAAATAAGGTGAGG AGTTAAATCTTTGTTTTCCTTCTTCATCAGAATATTAGAGGCCTAGACTAAAATGTGATAAAAATAGTGTAAACTACTCTTGAGGTTTGTTCAAATGGTA CTACACCCTATTTGTTAATGAAAATGACATTCGTCTGCATTTGATTTTGATCTATTGGCTACCAAAAATGTTAGAGAATCATAACATAATATGCTTCAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_135581;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_495416

FPKM

• PAB: 1.2
• PNAB: 3.8
• PS1: 0.6
• PS2: 0
• PS3: 1.3
• PW1: 8.9
• PW2: 3.4
• PW3: 2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_495416

• Blastp: Tryptophan synthase beta chain 2, chloroplastic from Camptotheca with 92.27% of identity
• Blastx: Tryptophan synthase beta chain 2, chloroplastic from Camptotheca with 92.83% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425870.1)
• Pfam: Pyridoxal-phosphate dependent enzyme (PF00291.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;