Ll_transcript_452205

• Id Trinity: TRINITY_DN43226_c1_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_452205
• Sequence: GTGCATGCTAGCTAGCCTAAGTATCAAACCACAACAGGGAATGTGTATATATAATAAGGTAAAGACTAGAGCACAAACACACAATATTCTACATTAAATT AAACAATACTATTCTTTTCTTTGGTCAAATACCATGGAAACCTATGTCCAAAAAGCTCAACCTTTTCCTCAAGACCTAAAAGTGACCATTCACAAAACCT CCATGATTTTTCCATCCAAAAGAACTGAGAAGAAGTCCTTGTTCTTATCAAACATAGACAAGGTCCTAAATTTCGACGTGGAAACGGTTCATTTTTTTGT TGCAAACAATGATTTTCCTCCCAAAATAGTTGCTGAGAAGTTTAAGAAAGCCTTAGAAGATGCACTAGTGGTTTATGATTTCCTTGCTGGAAGATTGAAG GTGAACACAGAAACAAACAGGTTAGAGATAGATTGTAATGCAGAGGGTGCTGGGTTTGTGGAGGCTTCAAGTGAGTACAAGTTGAATCAGATTGGTGACT TGGTTTATCCAAATCCAGCTTTTGGACAATTTGTTCATAAGAATAAGCACTTTCTTAAACCAGGTGATGTGCCACTATGTGTTTTTCAGGTACAATAAAT TACTCCCATTTTTTAAAATAATAAAAAAAAATCATATACTTGCTTAACTGAAAAGATCATCTATCCTAAAAAAATCATGTTCAATATTAGTTTTTATGAT TTTTCTTTTTAATTAAATTGTATTATCCTCAAAAAAATATATCTCGATGTATCTATTTAATTAAATTTCATAAAATAATATAAAAATTTCCTCAACATTT ACTAAAGTGGATGATTCATGTTTTCACACCTTCTTTCTACGGTACCATTGAACACATTAAGATATTCCATTGTATTTGTCATCCATTTTGACGTCATGAT TTTGTAAATTGGTGACTACTTGATTGAACGTATTCACATGTTGTTGCAAATAAGAACCATCTTACATATTAAAGTTATAGAGTCTCTATTTTCACCAACA AATATCTTGCTCACATGGTAATGCGTATGGCCTTGTGTTACACAGTGCTTCTTTATCTTGTGATTTGGTATGGTCGTGTTGTGTTGGCATATTTTCAACT ACACATTTCTGTTGTTTGGTGTTGCTACATGACTTTAAAGTTGTTGAATTGAATGCATTTTCTTTTCTTCACAAATGGAAATAGACTTTACAGCCATGCA CTGTTCAAAGTTCAAACAGGACATATATAGGCACTGTCACATAACTTAAACAGCCACAATAAAGAATGGTATCTCTACATCTTTTAGTAAAGAAATTAAT TTCTTTCAAGATGCATGATTGTCTCTCTCAATAAGTGTGATTCTCATAAATCAAACCCTAGATCTTTTTATCATCTTAGGGATCTAGTGGGGACAATAAA AATGCACCTAGCTACAAGCTTACTATATTTACAGTATTCTTTTAATAGCTTTTCCTGTGCAATAATGTATAAGTTTTCTTTTCTCTCATTCAAGTGCTTT TAAATGTTGTTGGTTCCACTCCTCTTACCTTTTCTTTTCTTTTTCTATTCTTACGTGCTCTCTATTCTTATAGTAAAAACATTTCAAACTAAAGTGTATT AAAACATTTCATATTTCTAGTTATTTATCTATCCAAAATTCTGAAGTCCATGCTTAGATAGTTTCTCCACCAAGTTTATACAAATTTTTAATAGTATTTA ATACCGTATATGGTAATTATTTATTTTCCTTTATGAGAGTCTCTTCCAAATAGTAATTTTTGACATATACATAAGGATCAACCAGGTTTCACTATATCCT TATAAGATATAACTGCTAAAATGTTAAAATTTTGATTCTTGAGAATAATATTTGGTGAGAGAGGTAATTACGAACTTAAAAGAGATTAATTCCTTAACAT AAGATGATAGTACTTCGGGTAATACCAATATATATATAAAAGTATGAAATTCAAAACTTCGTGCTAACCAATTCAATTCAAGTCATTTGCATTTGGACAA AGACATATTAGTTATGATATTTTTTACATGCATATATGTTATTTTAAAGATTATCAGTTTAATCATAAAAAAACTATTTTTTAAATCGTGTAGCTTTGAT TTAATAAGATAACTCTAAAATATCAATTTGCTTATTAAAAAATAATATTCATTAATTATTCTTTATAACTTGAAATGCAGATAATGTATATAGGAGACAA CGTCCAACCAAATAAATATGTAAATAAGTTGAGATGATATTCTTTTTTTAAAAAGAGAAAAAGTGTATGCATAACGGTATATAAATTTTATATATTATCA CTACATTATTCACTATTCATATTTAATTGTTATTAACTCTTTCAAAAAATTTAAATGAATAATATATAATATAATGATTGTATATAAATATTTATATTGA CAATACATAGAAATTACATTATTTAAAAAAAAAAAGCAAAAGCAAGTGAGTGTGCTTAATGCATCATTGACTTTTTTGTCTATGTCATTGATTACAGAAT AATTTCAGTTTGTATGAAGTTAGGTAGCCGAAAAAACAGTTTTACACTAAGTTCAACCTGGACCAATGGGGACTTATTATAAACAACTTGTATTGAGAGT ATATGTTAATCAGAATTAAAATAGAAGAGGATCATTTAACATCTAGTGTCCTAGTCCTTGTCTTGAAGTGACATATCAAAGCAATTGGATTGCATCAATT CTTTTTTTACTAATCAGTGCAAACTTTTATTGGAAAACAAAAATATGTAACTAAAGATACTCTCTATTAATAAAAATATAAATATATTTAATGGTTTTGA AGTCTTTCCCTTCCATCTATTCTCCTTCATAAACTTAGTTGCAAAGAAACTCTAACTGACTCAAGTTAATTACTATACGGTATAACAATGATTATTTGGT TGATTAATGCATATAGCTTATGTTGGATTTGCTTCAATTCAGTTCACATCCTTGAAGTGTGGTGGCTTTGTAATTGGCATCTCAACCAGTCACACAATCT TTGATGGGCTTAGCTTCAAAATTTTCTTAGACAACATTGCTGCATTGGCTGCTAACAAGCCCTTGGCTGTGACACCATTCCATGACAGACAACTCCTCGC CGCACGATCCCCTCCACATGTCACCTTCTCCCACCCTGAGTTGATCAACCTTGGTAACATCCCTACAGGCCTTGAGTCTGGGGTTTGCATGGACTCCACA GAAGAACTTGACTTCAGGATTTTCGGATTAACATCGGACGATATCAACCGCCTTAAGGAGAAGGCTAAGGCCGGCGACACGACCCTTAAGGAGAAGGCTA AGGCCGGCGGCACGACCCGTATCACCGGATTTAATGTCATCACCACCCATATCTGGAGGTGCAAGGCTTTATCTGGACCATATGACCCTAATAGGTCATC AACTATACTATATGCAGTGGACATACGTTCGAGGTTGAACCCTGCGTTGCCAAAATCGTACACTGGCAACGCAGTGTTAACCGCGTACGCCACTGCAAAA TGTAAGGAAATTGAGGAAGGATCATTCTCAAAGTTGGTGGAGATGGTGAGAGAGGGTGCAACTAGAATCAATGATGAATATGCAAGGTCTATTATAGATT GGGGAGAGTTACATAATGGTTTTCCAAATGGGGAAGTTTTGGTTTCTTCATGGTGGAGATTAGGGCTTGAAAAAGTTGAATATCCATGGGGAAAACCAAA GTATTGTTGTCCTGCAGTGCATCATAGGAAGGATATTATATTGCTTTTTTCACCTATTGGTGGAGATGGTGATGATGGTGTAAATGTTATAGTGGCTCTT CCTCCTAAGGAAATGGAAAAATTCCAAAGTCTCTTTTACAAGTTCCTCATTTGAGATTGAAGGAAAGTACATATCTCTTATGAGTTATTGGTGTCTCTAT AAGTGTATTGGTATTTTAATATGGATGATGCATTAAATTGTAATTGATTATATATACCTATACGTATATATGTGTGTATATTTATTTATATGATCAAACA GTTATGAAAGAAGACTGAACATGTCGTTGTATCTTGCTAGCTAGCTTAAACCAAGGCATATTTTCTTTAAAGGAGTTGATCTACCTGAAAACACAGTAAA CTGAATGTAGTGTTATTATGAGAAAAAATGCATGTACTCTTAAATAATGTAAGAATTTTATATACTGTTATTTACTATTCATATTTAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_135719;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_452205

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 1.3
• PS1: 2.1
• PS2: 0.7
• PS3: 2.5
• PW1: 2.2
• PW2: 2.1
• PW3: 1.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_452205

• Blastp: Fatty alcohol:caffeoyl-CoA acyltransferase from Arabidopsis with 33% of identity
• Blastx: Fatty alcohol:caffeoyl-CoA acyltransferase from Arabidopsis with 32.67% of identity
• Eggnog: shikimate quinate hydroxycinnamoyltransferase-like(ENOG410YUQM)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G63560)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019438014.1)
• Pfam: Transferase family (PF02458.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;