| Id Trinity | TRINITY_DN43967_c0_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_425257 |
| Sequence | AAAACCCATTAGCATAAAACGTGTCCCCTTCTCGCTCTAGATATCTAACGAAACGACGCCGTAAAAGACAATTCACATGTTATAGGCGGTGACATAGTTC ACTATTTGCATGACATTATTATTACATTCAACAAAATTTTACTCTCCTTCCTTCTCATGGATCCAATTACAAACAAACCTCTCAATATGCACCTAGTTTC CTCCACCGACTCGCCCGAGTTCACTCTCTTCACTCAGACATTGACTCAGACCTCACTCGTTGGCCTCGATGCCGAGTGGAAACCCGTCCGCACTCACCAA ACGGCGTCGTTTCCCACCGTGTCGCTGCTCCAAATTGCGTGCCAGCTCCACGACGGTGACTCCGTTGTTTTTCTACTTGACCTGTTTTCCATTCCTCTCT CTTCGCTCTGGGAACCGCTTCGAGAAATGTTCGTTTCACCTGATATATTGAAATTGGGATTCATATTCAAGCAGGATTTGATTTATCTCTCATCCACTTT CTGCTCCCTAGGCTGCGAACCCGGATTTGATACGGTTGAGCCGTATTTGGATATCATGAGCGTGTACAATCATCTGCAGCAGCAGAAGAAACATGGAAGG AATGTGTCGAAGCAAAGTAAGAGCTTATCAACTATATGTGGAGAAGTGTTGGGTTTTCCTCTGTCAAAGGTTTTGTTTTATAACCTATTCAACAATCTTT TTTATTATACATTTTTTCATTAAGAAGACTAGCAGTGGCGTTGGAGCACCGTGTATGATTTGAATTTTATCATTTGGTCTGTGTGTTGCTTCTATGCTCA ACCGGATTTTAATTTTAGACGTTTGTGAATAAATTACAAGAATCATTGTGTATAATTTTGTTTTAGGTAAAATGAGTTTTTTGTTTGCATTTGGGGAAGT TAGTTTTATAATATTATGGCGGTTAGGCTCTTAGCTTCCTGCCTTCCATCCGCATCTTATCATCCATCTGTAAAATCGACATTTATTTGTCAAAAATCAA GCATCTTAGGAAATTAAGGAGGCACATGGATATTTTTTAATCTCTATCATGCCCCCTCACACCAGAATCAGTTAAGCTTGAAGCATAGACAATGCTTAGG TTTACTTTTACCCTATGATAAAATTTAGTTTAATTATGAAAGTAAGTTTAGCAAGGGCCCAAGAACTGACCGCTGAAGCTTGGATTGGGTTATGTGTGAA GAACCAACCATCTTCAAAGCTCTCGGTGGAAGCACATAAATTGTTTTGAATCTTCATACTAGTATTTTATTCATGACATCATAATTAGGTGCTTCTTCTC TGGTCAGTATAACGAATGTTAGGGTTGTGTTCTGCATCTAGAAGATTCCCAGATTCTGGTCTTAATTGAATTCTCAGCCTTACATTACTGATCGTTGACG TTGTTTTAATTCTACCAGACCTTATCTTTTTTATGTTGTGAGTTGTCTTCAATTAGAAGTGATAGGTGCATATTAAATTATGGCTTTAAGATTTACATTT ATATCTAATAACAAAACATGTTTGCTCTCCTATTTTCAAGACTATATCAATCAAAATATTTTAGCATTGCATACTGATTTCTAAATGGATCAGTATGTTT TGTCACAAAACAGATATTGCAAGTTACTCAAATTATGTTAATTAACTGATCCACCAAATGGGAAAAGGATCTGGATGTTGTTGTAGTATATCCAGTTATG TTTATTGAGTACTTAAGCAATAATAGGATTGAGCTGAACACAATTAAATGGTGATACTGTAGATAATTTTGTATTTTTATAGAAACAGGAGGCCTATTAT GAGACATGAAGGTGAATCTCTTCCTCACACGAGGGTGTGTTTTGTTCACTTGGATTTCAAGATCCAGACTTGCTCCAAGTGGCATTATTCAATCACTATA AGGTGTTAACCAAAGTTATGTATGCTTTAGGAACTCCAATGTAGTGACTGGTCACACCGTCCGCTCACAGAAGAGCAGATGAAATATGCAGCTATGGATG CTCATTGCTTGCTTGAAATATTTAAGTTCTTCCAGGAAAATGTTGCCAAAGAAGGAGACTTGGTTGTCACAACTGAATTATCTAATCTGGATGCAAATCT TGGGTTAAAAGTGGTTTTTGGGAAGCATGATGTGTGTGATAGAGTCTTAAGAACACAATTTGGTGAAGCTTTAGCAATAGTCCAAGCCACTACTTCTGAT GTTTCTCAGGTATCACCTTCAACGGGGGGAATGATACAGAAATCCTCATGTAAGGTTACCAGCCCGATGGATGAAGTTTTGTTGAAGGTGGTAAAAACGT ATAGTGATAGGATTTTGCTAAAGGGTTCAGACAAAAAGCCCAAAACCTCTAAAAAGAAGGGGAAGAAGCAATTATCAATTAATGGAATTTGCAAAGAAAA AGGTTCAGAGCAGTTTGATGATTGGCAAGGCACCTCACCTTGGGATCCTTCGGTGGGGGGAGATGGGTATCCAAAGTTCCTTTGTGACGTTATGATTGAA GGCTTGGCAAAACATTTACGGTGTGTTGGGATAGATGCTGCAACACCTTATTCAAAGAAGCCCGAACCAAGGGAATTGATAGAGCAAGCACAAAAAGAGA AAAGAGTTCTTTTGACACGAGATGCCAAGATGTTAAGACATGAGTATCTAATAAACAACCAAATATATAGAGTGAAGACTCTTCTAAAAAACGAACAGCT ACTTGAGGTATGAGTACTTTTCACATATGAAGAGATTGATGATGATAATAATAATGACAATAACACTATACATTTCCTTTGGATGTCTGAAGTTTGTGTA AATTCTCTATCTTTTATGAACTCTTTCATATTCTTGTTTTAAATATGTGATCTTCTATAGATAATGTGAAAGTGATAATAATGAACTCACGAAGTAGATA AAAATATTTTAAGCAAGTCATGACTGTGAAACTGTTGACATGGTATTGCAAAGGCTAAAATTGAAGTATGATTCAGGTTATTGAAACTTTTCAACTAAAA ATTAGTGAGGATAGACTAATGTCAAGGTGCACAAAATGCAATGGGAGATTTATTCAGAAGCCATTGTCAGCTGAAGAGGCTATTGAAGCTGCAAAGGGTT TTCAAAGAATCCCAAGTTGCTTATTTGACAAGAATTTAGAATTCTGGCAGTGCATGGACTGTCACCAACTTTACTGGGAGGGAACCCAATACCATAATGC A BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_136887; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_425257
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430744.1) |
| Pfam | Mut7-C RNAse domain (PF01927.15) |
| Rfam | - |
| GO | - |