Id Trinity | TRINITY_DN43967_c0_g1_i3 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_425258 |
Sequence | AAAACCCATTAGCATAAAACGTGTCCCCTTCTCGCTCTAGATATCTAACGAAACGACGCCGTAAAAGACAATTCACATGTTATAGGCGGTGACATAGTTC ACTATTTGCATGACATTATTATTACATTCAACAAAATTTTACTCTCCTTCCTTCTCATGGATCCAATTACAAACAAACCTCTCAATATGCACCTAGTTTC CTCCACCGACTCGCCCGAGTTCACTCTCTTCACTCAGACATTGACTCAGACCTCACTCGTTGGCCTCGATGCCGAGTGGAAACCCGTCCGCACTCACCAA ACGGCGTCGTTTCCCACCGTGTCGCTGCTCCAAATTGCGTGCCAGCTCCACGACGGTGACTCCGTTGTTTTTCTACTTGACCTGTTTTCCATTCCTCTCT CTTCGCTCTGGGAACCGCTTCGAGAAATGTTCGTTTCACCTGATATATTGAAATTGGGATTCATATTCAAGCAGGATTTGATTTATCTCTCATCCACTTT CTGCTCCCTAGGCTGCGAACCCGGATTTGATACGGTTGAGCCGTATTTGGATATCATGAGCGTGTACAATCATCTGCAGCAGCAGAAGAAACATGGAAGG AATGTGTCGAAGCAAAGTAAGAGCTTATCAACTATATGTGGAGAAGTGTTGGGTTTTCCTCTGTCAAAGGTTTTGTTTTATAACCTATTCAACAATCTTT TTTATTATACATTTTTTCATTAAGAAGACTAGCAGTGGCGTTGGAGCACCGTGTATGATTTGAATTTTATCATTTGGTCTGTGTGTTGCTTCTATGCTCA ACCGGATTTTAATTTTAGACGTTTGTGAATAAATTACAAGAATCATTGTGTATAATTTTGTTTTAGGTAAAATGAGTTTTTTGTTTGCATTTGGGGAAGT TAGTTTTATAATATTATGGCGGTTAGGCTCTTAGCTTCCTGCCTTCCATCCGCATCTTATCATCCATCTGTAAAATCGACATTTATTTGTCAAAAATCAA GCATCTTAGGAAATTAAGGAGGCACATGGATATTTTTTAATCTCTATCATGCCCCCTCACACCAGAATCAGTTAAGCTTGAAGCATAGACAATGCTTAGG TTTACTTTTACCCTATGATAAAATTTAGTTTAATTATGAAAGTAAGTTTAGCAAGGGCCCAAGAACTGACCGCTGAAGCTTGGATTGGGTTATGTGTGAA GAACCAACCATCTTCAAAGCTCTCGGTGGAAGCACATAAATTGTTTTGAATCTTCATACTAGTATTTTATTCATGACATCATAATTAGGTGCTTCTTCTC TGGTCAGTATAACGAATGTTAGGGTTGTGTTCTGCATCTAGAAGATTCCCAGATTCTGGTCTTAATTGAATTCTCAGCCTTACATTACTGATCGTTGACG TTGTTTTAATTCTACCAGACCTTATCTTTTTTATGTTGTGAGTTGTCTTCAATTAGAAGTGATAGGTGCATATTAAATTATGGCTTTAAGATTTACATTT ATATCTAATAACAAAACATGTTTGCTCTCCTATTTTCAAGACTATATCAATCAAAATATTTTAGCATTGCATACTGATTTCTAAATGGATCAGTATGTTT TGTCACAAAACAGATATTGCAAGTTACTCAAATTATGTTAATTAACTGATCCACCAAATGGGAAAAGGATCTGGATGTTGTTGTAGTATATCCAGTTATG TTTATTGAGTACTTAAGCAATAATAGGATTGAGCTGAACACAATTAAATGGTGATACTGTAGATAATTTTGTATTTTTATAGAAACAGGAGGCCTATTAT GAGACATGAAGGTGAATCTCTTCCTCACACGAGGGTGTGTTTTGTTCACTTGGATTTCAAGATCCAGACTTGCTCCAAGTGGCATTATTCAATCACTATA AGGTGTTAACCAAAGTTATGTATGCTTTAGGAACTCCAATGTAGTGACTGGTCACACCGTCCGCTCACAGAAGAGCAGATGAAATATGCAGCTATGGATG CTCATTGCTTGCTTGAAATATTTAAGTTCTTCCAGGAAAATGTTGCCAAAGAAGGTTTGTAATGCCTGGAAATTTTATGCCCCCAACTCTGGACAAACCA CCAGCCTTTAATTATGTTATTTTTTAATTGCAACTTCAAACTTATGCTTTATTGCTTAATTGAGTTTTTTTGGCATCCTACATTGCAAAAGGTTGCAAAT TCATAATCGAACTTCACTTGTAGCAATGTCTTCCTCACAATTTCTGACCTTAACCCTTGCTAAAGGGATGCGCTGGTAGCCTGATATGGCACTAGCAAAA GCTGACAAAGGATGTAGTGCGACAGGTGGGGGTGTGCAGTCATTATTTTATGACTAGAGCCTATGTATATTGCTCTACATGTCAACCCACTTGTATTCTC CTTGTAAAAAAAGTATTTCACTGTTATTTGGTTGGGCTTGTACTAGTTGTACTAACAGATACTTTATGCGTGTTAGTACTAAAAATGATAGTGATTTTTA TCCGTCGGTTACATCTCATGTAGTCAGCATGATTTGGCATATTATACTATCACCAAAGGTTTTCAATATAAAAAAGGAAAACGAAAAATTGGAAGTGTCA AGACCAACTAACATCAAAATTATGACCACTTGGTCGTTGAGGCTCTTATACCATGCTTAGGATCAATTCTCCTAAAAGGTTAAGTGGCTCATAGTTGTGA GATTGTAGCATATAGTTGTGATGTTAGATGAAAGCTTATAATTGTGCACCTAGGTGATGATTTTATTAAAGCTGTTGGCAAACAAGTTGTGCAACTAGCT AAAAGTTGTTAAATGACTTGAGGGACATAATATTATATTTGATGTAATATTGATATAATTTGTCATTGGATACATTATTGGTGGCTCCAATGGTAGCTTT TGGAAAGCTAGCTTTTAAAAGTTACACTCTCCCTTTATTGGCAGCTCACTAAAGAACTCCAAAGGTTTGTTGACTAAGTTAATAAGACATAATACACTGA ATAAGACAAGCTGTTTTACCAAACACAGTCGAAGGCTTACGAATAGTTTTTCGCCTATCAGGAATTTAAATTGATATTTTATGGGTTGGCCCGCTCTTCT TAAACATCTTGATATTTTGTATCACTTGTAGTTCTAAGAACCCTGCCTTTTCATGTGGTAGTTTTTGTTTCCTCACATCCGTGTCCAGACATAATTTATT TAAGTGCAAGAAATATGGAAAATTTTCTCTATATATTTTGTGATCTTTAATATCAGAGGATATTCATTTTGTTCACATCTGTCCTTTTAGATTTAAAACA AATTTGTATTTTCTCATTCTTACCGTGCTGCTTTATACAGAGACGTTTGGTTATCACATTTTTCTGAATTCTTCACTGCAGGAGACTTGGTTGTCACAAC TGAATTATCTAATCTGGATGCAAATCTTGGGTTAAAAGTGGTTTTTGGGAAGCATGATGTGTGTGATAGAGTCTTAAGAACACAATTTGGTGAAGCTTTA GCAATAGTCCAAGCCACTACTTCTGATGTTTCTCAGGTATCACCTTCAACGGGGGGAATGATACAGAAATCCTCATGTAAGGTTACCAGCCCGATGGATG AAGTTTTGTTGAAGGTGGTAAAAACGTATAGTGATAGGATTTTGCTAAAGGGTTCAGACAAAAAGCCCAAAACCTCTAAAAAGAAGGGGAAGAAGCAATT ATCAATTAATGGAATTTGCAAAGAAAAAGGTTCAGAGCAGTTTGATGATTGGCAAGGCACCTCACCTTGGGATCCTTCGGTGGGGGGAGATGGGTATCCA AAGTTCCTTTGTGACGTTATGATTGAAGGCTTGGCAAAACATTTACGGTGTGTTGGGATAGATGCTGCAACACCTTATTCAAAGAAGCCCGAACCAAGGG AATTGATAGAGCAAGCACAAAAAGAGAAAAGAGTTCTTTTGACACGAGATGCCAAGATGTTAAGACATGAGTATCTAATAAACAACCAAATATATAGAGT GAAGACTCTTCTAAAAAACGAACAGCTACTTGAGGTTATTGAAACTTTTCAACTAAAAATTAGTGAGGATAGACTAATGTCAAGGTGCACAAAATGCAAT GGGAGATTTATTCAGAAGCCATTGTCAGCTGAAGAGGCTATTGAAGCTGCAAAGGGTTTTCAAAGAATCCCAAGTTGCTTATTTGACAAGAATTTAGAAT TCTGGCAGTGCATGGACTGTCACCAACTTTACTGGGAGGGAACCCAATACCATAATGCAGTACAGAAGTTCGTTGATATATGCAAATTGGTTACTAATTA GAGCTTCATTTTGTGCCATTTGAATAGGTTTTGATATAGAAGAGAAAAATATATATTCGGTAGTGTGTTTGTTTCTATGCAATTTATTCATGTAATGTAT CATATTTATGCATCAACTTTGATATCACAAACGTTGTAGACTCTTGTAGCCGTGTATTGTAATGAGTGGAGTCTCTGAATCCAAAAGCCAAAGCTGCAAA ATCTTTAAAAATGCCATGGAGAGAGACCGCGTATGTTTTGTATAGGTGTTGAGAAATATAAATCTGGTCTGAATCATAAGATGTCATTTTAGTGCTAGTG ATAAACACCTGCAGCCAGCCTCATTGTGAAGGCAATAGACCTCAGCTGGGGGTTGTCGGAAGTATATCTTCTG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_136887; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_425258
Blastp | Exonuclease mut-7 homolog from Homo with 29.41% of identity |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | exonuclease 3'-5' domain containing 3(ENOG410YV3M) |
Kegg | Link to kegg annotations (54932) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430744.1) |
Pfam | Mut7-C RNAse domain (PF01927.15) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |