Id Trinity | TRINITY_DN44160_c1_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_340056 |
Sequence | CAAAATCTTAATCCTTTGATGTTTTAAGATTTAACAATGTGTTGCACCACTAAACAAATACTTTGTGGATTATTGTCACTGCAATTTACCCTAATATTCA TTGCTAATGACTCAATATTACCAATTGAATATCCTTCCCGATTGTAATATCACCGGAGAATTTTAGGTGAAGCATATGACACGGTTGGCTTCTCTCTCTC CCCTAATGCCAAAGATGTGGCGCACATTAGACACCACCACCACCCAACTAACCCTCACCGTCAGAGCCTTGCGCCTCCGTTCCCACCACCTCTTCTCTTC ATCTTCTTCATCCACTCACCCCAAATTCTCCCACTCTTCTTATTCTCCTTCATCATTCCGTACAATCGTTACTCTCACACACTCTCACTCTTTTCTTTCA TCCGCTCCTAAAAACACACGGTATCATGATTTTGGGTCTAAATTCGTTTTCTCTGTTAAACGGTGCGTTTCGTCTTCTTTTTCTTCGTCTCCTTCGTTAG ACTGGAACGACGCCGTTTCGTGCTCTGAGGTTGATGATGGCATTGACGATGTTGGTGGTGATGACCATGATGTAAAGCCTTCTTCTATTCCTGTTAGAGC GTTCTTTTTCTCTACAAGGTGTGTCGTTTCTTCTATAATTTTGTCGTTTTGGATAAAATGGAATTTGTTGTACTTTTTTGTGGACTTGTTTGAATTGAAA TTTAATTGGTTAGTGTGTAATGGTTTTGGTTTCAAGGTAATAATAATTATAGTGCTGGAACGCTCGAATTTTGAGGCCTGTTTTCAACTTTTCTTATTAT TACTATTAATCAGTTCTTTTAAGCTGTGGTGTTATGTTGCATTTACCACAATTGCGAGAGAAAAATGAGGCCCAATTCTCGTTGCGGAGATTCCTGAAAC GGAAATATTGCAGCCACAATTGAGGGGAGCCACGTCTTCTGTCACAAACATTGTATTACTCCATATACCCTGTTTTTTTCATTGATGGGAAGAGTAAAAC ATAAATTAAAAGTATATTAGCTTTATATTTTCCGACCAATGAAAAACAGTACAACGGGCAAATGGAGTGTAGTACAATATTTGGGACAGACCCCAATTGA GGTTGCCCACTGCAATTTAAAACACTGGATTATTTGTTGAATTAAGAGTTAAATAAACAAGTTAAGGTGAATACACCCTCACTTCATTTGTTTACTTTGC ACATTTGCTCATTTTAGAGGAGCTATTTCTGAATTGTTACCTTTATGATCACATGACTCTTGGAGTATTCCATCTCTAACATTATGATAATCCATTTCCT TTATATAGAAGGCAACAAGTGCATTCAGAAAATTGAAAATTGAAATGGATCTTGTAGTTGCATGAATGATCAAGATTAAAAGTTACTCGATGGTCACATC ATCACTTTGTAAAAGTACAATTATCTGCTAATCTTGACCATTCATGTAAGATACAATGATCAAAGTTCATTGTTTTTGTTTTTCACAGTTAGTGTTCTCA CCTGTTATGGAGATATACGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGATACTATGGTGATGCATCCCCATTGCTGCAAGAAAAGCAATCTGGTTATGCATCC TTGAAGAGTTTCTTGATTACGTATAATCCTATTGTCATACATAGGCAGTCCGATTTTGAGAAATGGACACCAAAGAATTTATGTTTCTTCACTTACACTT GGGAAAATTTCGGATGTGATTGGGCAAAGTCATTATGTTTTTCATAATCAGATAATTGATCCGTACTATCTACCTGCTACCTTGCTTTTTCACATATGGA TATATTGATTTATATATCTCACTCTTCTTTGTATGGATATAGTGTTGATTTGAAAAGCTTAGTGGAACAGAACAAACCAAACTTTGTCACACCATCATCA CGAATGACTAATTATGTAGTTCTCAGGTTTGGCAATCTTTCTGATTCCAGGGTATGTCTCTCTTGGGCTATGTTCTTGTTTTCCCTTATCTGTTATTTAC TCATGTTCTGCCCTATCTTATTTTATTTTATTTCGTGGACATGTTATTGAACATATCTTATTTAGGCAGTTGCATTTCCATAGGTTGAGGAATGAGTGAT TTTACCACTTTGTCCTTTTCATGTATCTTTATCATGAGTTCTTCATCAAAATAGAAGAAGTTAAAGAGGACATAAAGTATAAGGTTTCTTGTTGACAGTG GACATACATGAATGCATATCAATCCATCTGTTTTGCTGTGATTTTTATATGGAAGAAACATATATAATATAGAATTTTTGCAACCTAATATAAGTATTGG TTAAGATTTTTTAGTTTTCTTTCTTAGTTAAATTTTTCTTGTATATAAAAAGCACCATGAAATCAAATTAGTGTCCGAGGCATATAATTTAGTATAGATA TAGATTTGTGAATCCTTTTAGGATGAAGTTTAGAAAAAAGTTGATGCATGAGAAATCGTTCATCCTCTTCACATATTGCTGTTTGCAGAAGATGCAGTGC CCGTGTGTGATTACTGATAATATAAAGTTATAAACACGTTTACAATGTACTGAATTAAATTGGTTGTAGCCTTGGTCCCTTGGACCTGGTTTATCATGCC CATGCTTTTTATGGATGGGGATATTCAGTTCATGCAACTAAAGGATTGAGGAAGGGAAATATATATACACTCATATAGTCTTCAGGTTGGGATTGAAAAA ACTATAAATAGAATTTGTAGGATTCATTTTGCTTGGTTTGGCTACTTATAAAATGTGGGTTTTATTAGCTACAAACACTGAATTGAGTTCTATGAGGTGT TGAATTTAGTTTCTTCGCATAGAGTAAGAACTTGGAGCTTTTAAATTGACAGTGCGTAAGATTTAGATGGCTACTAGTTCAACATCTACACTGAGCGTTT AATGATCGCTCAGTCCTCTTTAGAAAATAATTGTTGGATAAAAGACATAAAATAATATAATCTTACTCGTTGGAATAACTTGTATGTAACCTGTGTTGGA GATCTGAATTCCAACTACAACAACAATAGTAATAGTACAATTACAAATAATAAAATAAAAAATCTAGACTATAATTTTGAGGATCTGTGTTTTAAATTTT CAAAAACACAATTTCGTCAATAAAGTCAAGTAACATCATTTCAAATTTATAAACAACTTTGCAAACTAACTAACTATTTCTTCTTTCATTTGCTTTTTCA TCATCCATCCTATTATATAAGTGTTGCTTTACTTCTGTAAGAACTATTACTATGGAACCCCTTTAACAATGCATGAACTGGATGATCAAGTTTATTCTTT GTCTTTGTCAGTTTTTTAAATTTGAATTCATAAAACCAGCGACAGTAACTGCTAACTACTTTTTCTTTCAGGGTCTGGGTACCGCTTTCTTGAGTGGAAA CAGTGGCTGTTATATGGTGGTTTTTCAGTATGGCTCTATTGTATTGTTTAATGTCCCTGAGCATGAGGTTGATAGCTATTTGAAAATTGTTAAAACGCAC GCATCTGGTTTGCTTCCTGAAATGAGAAAGGATGAGTACGAGGTTAGAGAAAAACAAGCATTAAGCACGTGGATGCAAGGTGGGCTAGATTACATAATGT TACAATACTTGAATATTGATGGAATTCGTACTATTGGTAGCGTTCTGGGTCAAAGTATTGCTCTTGATTACTACGGACGGCAGGTCGACGGAATGGTTGC AGAATTTACTGACATAAACCGTGAGATGGAAGCAACTGGAAAATTCAAAATGCAAAGGAAAAAGCTTTTCCAGTTGGTGGGCAAGGCAAATTCAAATCTT GCTGATGTGATTCTTAAGCTTGGACTATTTGAGAGATCAGATATTGCTTGGAAAGATGCAAAATATGCTCAGATATGGGAATATCTCCGGGACGAATTTG AATTAACACAGAGATTTGCAAGTCTTGATTTTAAGTTAAAATTTGTGGAGCATAATATCCGCTTTCTTCAAGAAATTCTTCAAAACAGGAAATCAGATTT CTTAGAGTGGCTCATTATTGCATTGATTGGTGCTGAAATTCTTCTGTCTCTTTATGACATAATCCACCGTGGTGCAATGCAACTTTAGCAAAATTTCTGT TTTGTGGCACATAAGACCAACATTCTTCTGAAGGGCAAATGGGTAGCCAAGTAAAGGTCTTTTGCAGCTTATTTTGGTTGTGGTTGTGATTGAGACAGCT TAGTATCTTCATAAAATTGGATGTGAAAAATCTAAGAATTAGTTGTTTGAGGAACATTTTATGTGACGTTTATCTTCGAAATTTACCCCAATTTTATCTT GAAGGAAGAATAGAATATTAAACATTTTTCATAACAAAATGATCACAAATGTAACTAAAGTAGAAACAGATGGAGTGCATTTTATTAAAGATGATTTAAG TGTGTAATTGACATTTCGACATATTTCCT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_137212; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_340056
Blastp | Sporulation protein RMD1 from Saccharomyces with 21.94% of identity |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (YDL001W) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462187.1) |
Pfam | Uncharacterised ACR, YagE family COG1723 (PF02582.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |