Ll_transcript_478173

• Id Trinity: TRINITY_DN44435_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_478173
• Sequence: ATTCACAATTCCGTATCACGTTTCTGTTGTAGTTTTCACTCATTATTCAGCCACGAAATTTTACATTGATTCATGATTCACTTGGCATTCACTATTGTGA ACAGATTAACAGGCGTGCAGTTGCTACTGATGAATGGTTGAGAGTTGAAGGAACCGACAATGTGTATGCGCTTGGTGATTGTGCTACGATAAACCAGAGG AAAGTCATGGTACCTAATACTATTTCTCCTTTCTTCATTTAATAAAACATTGAGCATTCTTAATTTCATAGTAGCGTGCATGTTCTTGCACATGTATATG AGTGTGACACTCACGCTATTCCATTTTTATGGATAGACTTTATAGTCTCTTTATATTTGCAGTTTCTTTGTTGTCTTTCAATATAATAATACATTTATCT TCTTCTGATGAAATAGTAAAATCTCCATCATTAGACACTTTCGGCAGAATGCACATATTTCTTAATAACTTTGTGTTCGCCAGTATTTTGCCTTGTTAAA CTAGCTGAATGTATTATAAAGATACATCTATTGACGACTTGCAACATGTATGAAGCATGGCATTTATTTGTTTTTCAAATGCTATCTTTCTTCCTATTAA TTTGGAAATTGGGATTTGACATTATAGGAAGACATTTCTGCTATCTTTAAGAAGGCTGACACAGACAACTCAGGAAAACTTACAGTCAAAGAATTCCAAG CTGCATTGGAAGACATCTGTGAAAGATACCCACAGGTGGAGCTATATCTTAAGAGTAATCACATGCACAACATTGCTGATCTGTTGAAGGAATCCAAGGG AGATGTTCAAAAAGAATCTATTGAACTTAACATTGAAGAACTGAAAACCTTACTTTCTAAAGTGGATTCTCAGATGAAATTTCTTCCCGCAACCGCGCAG GTACAATCACGTCGTGTTATTCGCCTGCTCAATCTCTTTAATGGTACCTACCTGATGTCTCCTCTGTGATATGACTTTGAAACTACTTATCAGGTTGCAT CTCAACAAGGCACCTACCTGGCCAAGTGTTTTAACCGGATGGAAGAATGTGAAAAGAATCCAGAGGGTCCTCTCAGGTACAGGGGAGAAGGGCGCCACAG ATTCAAACCCTTTAGGTACAGGACCATATTACCTTACTAGCTTTTTGCTTTTAATCATTAATACATGATACTTGATATAGTGATGAATGGCTCCAAGTTT TTCATTAGTTGGTCAAGATATACCTCATTATTACATTGTTGACTGTTCCTCCAGGTACAGGCATTTAGGTCAGTTCGCTCCTTTGGGAGGAGAACAAACA GCTGCACAGCTTCCTGGAGATTGGGTTTCAATTGGACAGAGCAGTCAATGGCTGTGGTATTCTGTCTACGCAAGGTATGGTGTTCCTTTTGTTGTCCCAC GTCCGGTCTCAAGTCATGTCCCGGAACAATGACAATGAAACAAATATTTAAATTTTTTATTAGTGTGAGACATGATCAAGATCTATGTTTGTTCATTTTC TTAGTTGTATTCCTAAAACTGACAGACTGGAGAGAGAATTTAGAAGAACTTGTACAAAGCTTATTTGGACTTACAAGAACATATTGAGAAATTAAATCTA TAAAAATAATTTATAGAAATAGCTTGTGAGTTTATGATAAGCTCAGTAACAAAACCTATGGAAAAAAAAGTTTTTTAGCATATTTTCAAATTTCTTATTG AATAAACATTTAATTAAGGTGTTTAGAGATGCATGCTTATAATGCATTATGATCACCAAGTTATTAAGGCTTTATTTAATGTGTTGAACAGCAAGCAAGT GAGTTGGCGCACAAGGGCATTAGTAGTAACAGACTGGACAAGACGTTTTATTTTTGGGAGGGACTCAAGTCAGATCTAAAGGAGTTTTAACACGTTGCAG AGTCTTGCCATAGCAACAATGCAGAGCTCGTCGAACCTAAGTTTATTTTAATACAAGAAAATTTTGTTTCAGTTCATGATTCTTTGAATAAGTACAACAG ACTCCTATTGTGGATGTCACAATTGCATTGGGATATGTATTATCATGTTCTACCACTTTCAACTATCAAGTGTGAATTTCTTACATTCCCCTTTCCCTTA TCTTTTCCTGCTTTTGGTGTTAGAGTTGCAAATCTATGAATCTAGGAGATGTTTAGTAATGTTAGCTTCTAATGCCTAATCATTTATGTTATTTTTGAAT AGTTTTGTTATTTTCCTATAAATATGTTAAGATATGATCATAACTTCACATATAAAGCTTGTTTGCAAAACATTGGAAATAATTATATAATTGAGGTTGA TGAATGGAGTGTTGGCAGACAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_137696;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_478173

FPKM

• PAB: 1
• PNAB: 0
• PS1: 0.5
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0.3
• PW2: 0.8
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_478173

• Blastp: -
• Blastx: External alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B2, mitochondrial from Arabidopsis with 60.84% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G05020)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019431453.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;