Ll_transcript_432746

• Id Trinity: TRINITY_DN44512_c0_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_432746
• Sequence: GGCCATTTCCAATGCAGCAATATCTACACAGCGTGGAAGCAGAACCACCATATACAACTCTTCTGACTTTGTTGCTCTCTTCTTCTAATGAATTAGCGAT ATAAACCCTAAACCAATTCAACTACACTTACAGCTACCACTACTCTCTCACAATGTCACCCATTGCTCTAACTGCGTCAGCCACAACATCCCTCCTCGCT TTTCACCGAGGGGCAAAGCAATGGAACAAGGTAATTCCGAGTTATTGGAGAAGAACCAGTGGAATTAATTCATCCTTATTCGCTAATTCTCAGAGGAAAC CCTTGCAATTGCGATTCTCAACTTCAGCGGCGAATGGAAGCAATGGAGGTGTTTCGGAAGAGATAAGTGGAAGTGAAAAATTGCCGATCAATTTCGTATG GTCTGATAATAAGAAGCCTAGGGTTTGTATATTAGGCGGTGGATTTGGTGGTTTGTATACTGCTTTAAGGTTGGAATCACTTGAGTGGCCTGATGACAAA AAACCACAGATTGTTCTTGTCGATCAGTCTGAACGCTTTGTTTTTAAGCCAATGTTGTATGAGCTTCTCTCTGGAGAAGTGGAGGAATGGGAAATAGCTC CTCGTTTCTCGGATTTGCTGGCAAACACTAGTGTGCAGTTTTTCAAAGACAGGGTAAAACTTTTGCAACCCTCTGATCATTTGGGAACCAATGGATCCAA CGCTTCTAGCTCTGGCGGAACTGTTCATCTTGATAGTGGCCTTCTTATTGAATATGACTGGCTGGTTCTTGCATTGGGAGCTGAAGCTAAACTGGATGTT GTACCAGGTGCAGCAGAGTTTGCATTTCCATTCACAACACTAGAGAATGCACGAAAAGTTAATGATAAATTAACAACATTAGAGAGAACGACCTTTGGAA AGGACTTCCAAATTAGTGTGGCCATTGTTGGTTGTGGATACTCTGGAGTTGAGTTAGCTGCAACAGTAGCAGAGCGATTACAGAATAAGGGAATTGTTAG AGCAATTAATGTTGATCCAATTATTTGCCCAAATGCCCCACCCAGCAATAGAGAAGCTGCACTGAAAGTAAGTTGTTAAGACCTTTAAATTTATGTTTAC CGGAACTTGAATATCTTTCTTGTAAAACTCATGAAGACACATGCAATTAGGATTATGGTCCACTAAGATTTTGACTTTGTTTTACTTTCTATGGCGAGGC AGTGAGATATATTAGCTCTATTTAAGCATTTATTTTAGAACTTATACTATCTCATGGTTGTAAGATTTAACAGAGTGGAATCAAATGTTTTAAGTTGTCT ATAACCACTGTTGATGATCTTAAAAAAATTAAATTAGCAAGTTTAACGAATTAGTGCATAGATTTAATTATGATTGTTCATTTTTTAAGTTGAAATTGTG TAACCTTGGTTATGTATAAGGCAAGATTATCCTTAAATTATGTTTGTTGAATTTGAAAGCTCTGTCCTTCTCTGAGCAGGACTAAGAGTGCGTTGCCTTC TAATTCTAGTTGGACTAAGATTGTTGTTTGAGATTCATACTGATTTTTTCATAAGCTTGGTGGTGCCTAAGGAAAGATATTTAGCCCTTGTAGAAGGACT AGGTGACATTTTGTCTGTTTTTTTTTCTTTCCGGAAGAACTCAAATAGGTCCCGAAAATTTTCCATTTCACATTTGTAATCAGGTGCTTAAAATTTGAAA AATTATTTTAATTTGATCTTTGAATCTACCGTACGGGTTATATCACAGCACGGGTACCCAATTAAAAAAAATTTAAAAAACTTTTGAAGCTATAGTGATT ATATCACAATATTAATAGGGGATCTATTTGAATTTTTCCCAAAAAATAGAGACCTTGATACCTATGTTGTAATTCAGCCTATTTTTTTCATAAAGTGTTC TGAAGAAATAAATAGTGAACAGTTTAAAATCATAATTTTTCCTTCCTGGTAACTTCAATAAACCTTATTCTCTATTTTAACTAAAGATCAAGTTTAAATG GATTTCAAATGAACTTAAAACTTTGAAACCATGAGTATCAATTATTAACTATATTCAAATTCCCTGAGGGTGCTACTCCATGAAATTGAAAAGCTGAATT TCTGAAACCATGAAGTTGACGACCTGCTTTGGATGTTAAAAGCTTCTTCTCCAGCATGCAGCTAACCTATTTCTTCAACTATGGATAGCTCTGGTTCTTT CATCCAGGAAGGTTGAACTTTTGTTGGGTTATTTTGTTCGTTGTATTCGGAGGGTGAGTGAATCAGACTCATCAGATACCTTGGCCGGGGTAGATGAAAA TCACATTGAAGTAGCACATAATTTGGAGAAATATATATTGGAGCTGCAACCTGCTGAAAGGGGGATACAAAGTAAAATCATTGAAGCAGATCTAGTGTTA TGGACTGTTGGATCTAAGCCTCCTCTCCCTCAGCTGGAACCTTCAGATTTTCCATTTGTACTTCCACTTAATGCCCGGGGACAAGCTGAAACAGATGAAA CCCTACGTGTTAAGGGTCACCCACGAATATTTGCCCTTGGCGACTCTTCTGCGTTGAGGGATTCAAATGGAAGGATCCTTCCCGCCACTGCACAGGTTGC TTTTCAGCAAGCTGATTTTACGGGTTGGAATCTGTGGGCTGCAATCAATGGACGACCCCTTTTACCATTTAGGTTTCAAAATTTAGGAGAGATGATGACC CTCGGTAGATATGACGCTGTCATTTCTCCTAGTTTTGTTGAGGGGCTAACCCTGGAAGGTCCTATTGGCCATACTGCCAGGAAGCTAGCATATTTGATCA GGTTACCAACAGATGAACATAAGCTTAAAGTGGGGATTAGCTGGCTCACAAAATCTGCTATTGATTCAGTGTCATTGCTGCAAAGTACCTTAACCAAGGT CCTCTCCAACTCATAGCTCATTCAAATCGGAGGGATTTGTGTTATAACTACCAATTGTGATGAACATTTCAAACATTTGATCATTTGTCTTTTCTAGAAT CAATTATCAGACAGTAAGGAGTCTCATTAAACTGGTCATATATTTTTATATATAAAATCATGACTCCAAACTATTTTCTCGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_137833;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_432746

FPKM

• PAB: 0.7
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.1
• PS3: 0.3
• PW1: 0.3
• PW2: 0.2
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_432746

• Blastp: Alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase C1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 63.76% of identity
• Blastx: Alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase C1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 75.42% of identity
• Eggnog: Nadh dehydrogenase(COG1252)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G08740)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019458586.1)
• Pfam: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (PF07992.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;