Ll_transcript_283471

• Id Trinity: TRINITY_DN44601_c0_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_283471
• Sequence: CCCGTGTACTGCCGTTTAAAGAGTGAAACGACAACAATTGCATGAGAAATACACCGAAGAACCAAAGAATCCTGATATCGTTTTTGAGGGGAGAGAGAAA TTGTGAGAAGAGGAAAAATGGCGGGTGGTGGAAAGGTGTCGTTCAAAGTGACTCTCACCTCTGATCCAAAATTACCTTTTAAAGTGTTTAGCGTTCCAGA GGCTGCACCTTTCACCGCCGTTCTCAAATTTGCTGCCGAAGAATTCAAAGTCCCTCCTCAGACCAGTGCTATCATCACAAACGGTAATTTCAATTTCCAC TTTCCTTTACGTTTTGGTAGATCTGTCTTTGATTTTTCGTTCGATTTGATCGTTCATTGGATAAATTTGTGAGGTTCATTTTTCAAGTTTTATTTTAGGT TTACTCAGTGTATGTTAAGACCTTTTTGTTTGTTTTTTCAACCAAAAATGATTATGTTTGACTTATGGCATTTGCATGGTTGTTTGATTGAGATTTTAAA AAAAAGCATAAGCTGCAAAAAATAACTGCAATTCAGATTTCAGTTTTTGAGATTTTTTGAGAAGCTGCAATTTACGGAGAAGAAGATATTTTGATTTGGG AATTGTAATTTGATATTGTATTGGATATTGAGTACAATGTCTCTTCAACATATATCTCATGTTTTTCCTTCCCTCAATCAGTTTTTGGGGGACAAATTAC AAAATCTAAGACTTACCAGCTATTTTTTGGGCTAATCACCAAACCACCCTTCAAAAAAAATGGAGAGAGAAGCACCTAAACAATAAAGTAAGGAAGTAAA ACGGAATGGTGGGGGTTTAAGTAGATAGGTTAATGAAAACTTTGTATATCTCATTTCTCTGAGACATTGACCTCTTTCCTCTTCACACTCAATGGTTTTC TCCTTTACTGGGGGCAATTTTTTAATTATTAGACTCATTAAATTGTTAAAATATGTAGTCTTACTTAGTAATTTGGTAGACTTAGAGATATACATGATGC TCCTTGCTGGCGTGATAGTGGCAATGTTTTTGCCGATTGATTACCTGGTTGAATGAGGTGTTCTTTGGTAGTTTATTAAGATGCTGGTTCATATTGTCAA ACCTCACATGATTTGTAGTGGTTGGATATCTGATAAATGTATCCTCATTACTCAGCTGCTTTGTCCACTGCGATCTTAAATTACAGTGAAAATAAGATCT GCCTTCCAAAATAATCAAAAAGATTGAAAATTTGAAATTTCATTGGGGCAACTACACTAGTTTGTGTTTGAACTGATTAGTTGCGACAATCATATGGGAA AGCTAAGCTATCAATACGGCCATGGACATTGGACCCCATGAATGGTAATTTAGGAGTATTGTTCTGTATGTATATTTGGGCAATTGGGTCAGTGAACTTC AGTATTTTTTTCCCTATTGATTGTCAACCTGAGTATGAAATCCTATCTATCTACTTATCTAGTATTGTTCATCTTGGATTTTCTAAATTAAATATTAATT TTTTGTATGCATGCAGATGGTGTTGGCATAAATCCCCAGCAGAGTGCAGGTAATGTTTTCCTGAAGCATGGTTCAGAACTGCGCCTTATTCCGCGTGATC GGGTTGGTGCCTGTTAAGATGTTATGGGGTGTTTGAGTGGATTTTGACACTGTTTTGTAATAAATCTCAGCTATTGTAGTTTAATAGTAATACTAAACAC CAGTGTTACTGATTTCATATAATTGAGACCAGAGGTGTCTTTAACCGATAAAGTTTATTTCAGTAATGGATTTTTTTGGAAAAATTATGTAGTTAACTAC TATAGTCTTGTCTTCTTTGAATGGGAGCTACTCTTTCATATCGCAGAGGCGTTGTTGAAAATTGAAAGGAAGCCATATATACTGGACCTTGGAAGCAATG TACTGGTTGATTGTGTTGCACTGGGAAAAATAAAAGTGGTCTGATCCACTTCTTTTTAAAACTTAGTAGAAAAAGTGAATTTTGATTTTATTTGCAAACT TATACGTTAGTAGACTTAAATACAAATTGACGTTAATAAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_137982;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_283471

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.2
• PS1: 0
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.1
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_283471

• Blastp: -
• Blastx: Ubiquitin-fold modifier 1 from Arabidopsis with 86.89% of identity
• Eggnog: Ubiquitin-fold modifier 1(ENOG4111TVI)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G77710)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_014631827.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;