Ll_transcript_411492

• Id Trinity: TRINITY_DN44951_c0_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_411492
• Sequence: GCCATGTTTATTGCTCCATTAATTTCTCAAGGGATTTGTTTCACTCTTGGCCGCCTGTGGGGGCTGTGTATCAAGCGTGGGACGCATGACACTTCTCCAT TGGTTCGTGCTTGCACGTTTCCAAGCTTTAATATGGGTGGAAGACAACTGCTTGAACGTTGGAGGGAAGGAATCAGTTGAAAATATTTTATATTCCTGAT TATATTGGTTTTGGAACCCATTTTAAAATTTCCTCTTGCATTAAATTAATTTGGAATCCAAAAAATGATATTTTTATCCATCAAGTTAAATTTCCTCTCG TAACTTCATTTTTCTCACAAGTTCATTGTTTACTTCCAAACTTGAAGTTGTTTGGTCACTATTGGTCTTCTCCACTGGAAACATTTTTCACTTTCTTCCA TCTTAATACCCACTGGTATTTCTAAAACATTTTCTTCTTTGTTCTCCTTGTTCCCCGAATTTTCAAAAACATTGTTTCCTTCCTCTGAAACTTGTAATAG TTGAGAAATAGTGCTAGTGGGAGGGATCCCCAAAATGGTCTAAGCTTTAAAAATGAAAAAACGGGTGGACTTGAAAACTTTCTAGAAATGCGAGTTCATA TGCCACCATACCAACACATCGGAGAATCTGATAGGGCCCACAAAAACATTTGCTCAACTTCTGGGTTTCCTCTCTGAACTACAATGTGATGGCTGTACAG TTGCAATTTCAACCACACTCATTCCCCGACTGTAAAGTTGTGGTCCCCTTTATTATTATCACTTTGTTCCTTCATTATATGTTGGGAACTCGACCGAAAG TATAATTCAACATAGTCGGAGGAATTCTGTTATAAAAAGCCTGTAAGAGAGTCATATTTGTGGAAGAACGTTTAGAAGTGTTGTACCAATACTCAACAAG AGACAAAAAATTGAACCGGTTTTTGGGATGGTCACTAGTAAAGAAACAAAGTTTTGTACCATGCAGGCGGAAGAACTCCTTCTAAAAGCCACTCAAGAAC ATTTTATCTCGATTTGAGACAATGGTCTTTGGGATCCCATGAAGTCGAAAAATCTCTGTGTTGAAACGCCCTACCAGTTGGGCTGTTGTAAAAAGGTTCG GCAACACCACAAAACGGGTGTACTTTGCAATATTTCCATAACGACCCATATGACTGTATTCCCTTCAGATGAGGGAAGGGAAGTTATGAAATCTATGGAA ATGTCCTCCCAAACTTGTTGAGGCCAAAAGAATGAAGCGGTTAGCCTTGCCATGGTTGGTTTGAGCCTTGAAGAATGCCTTGCAGTTGGGGTCGAGTGAT ATTCAGCAAGCAAAATAACACACAACCTGATTTCAACAGGTATATACAACCAACATTTGTAATAGAAAAACCAATTTTTATTTGTTAGTGTCTTCTGAAG ATGTTTGTAACAGTTTTTGTAATAATTGTTTGCCCTCTTTTGTTGTGCAAAAATTTGTGAGCTGAGTGCACATGGCTGGAATTGGAGACCTGAGTGAGAC TGATTCAGTCGAATAACATCGAGATAGAGCACTAACAACTTTGTTTTCTCGCCCAGGTAGAAGCATCACTCTCAACATTGAAGACAACATTGAAGCCTTG AAGTACTAACACTGGAGTTTTAGTTATTATCTCTTTCATTTGTGTAAAGGCTTCTAGTGCCATAGTTGACCATATAAACTTTGAATGCTTTAATAAATTC ATGAGTGGAACGGTGTGAGTGCACATAATTATGTCAAAAAGCATGGAATTGGCCACTCGACTATGTCTTGGAGTTTTTCAGGGTTAGGTTGAACCCCATT GGTTGATAAAATATGGCCAAGTAAGTAATTGATTCAACACTAAAAATGCACTTAGACATCTTGGCATAAAATTGATTGTTAAACAACAACTCCCAAATCA ACTTAAGGTGGCTAACATGCTCTATTAGTGTAGAGCTATAAACCAGAATATCATCAAAAAACACTAACACAAGCTTGCATAGATAGGGTTGTTGAAGGTC AATCATAATTGACTGAAACGTTGATGGGGCATTGGTAAGACCAAATGACATTACCAAGAATTTATATGCCCATTAAATGTTCAGAAAGCAGTTGTATCTT CCAATTTTACTTGAATATGATGATATCCAGATCGCAAATCAACTTTTGAAAAATGTTATGGTAATAGCGTTGACGCTACAGTAATCCATACAGAAATGCT AACTCCCACCTTTATTCGCACCAATAAGATCGACG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_138637;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_411492

FPKM

• PAB: 2.4
• PNAB: 1.8
• PS1: 1.4
• PS2: 0.2
• PS3: 1
• PW1: 2.8
• PW2: 3.8
• PW3: 1.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_411492

• Blastp: -
• Blastx: Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 from Sophophora with 41.76% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019450597.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;