| Id Trinity | TRINITY_DN45058_c0_g1_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_412100 |
| Sequence | GAGAAATCGATGGAGAGGTTTCGGTTTGATGCGGTGATGTCGTTGTTGATTACGGTGCACCCTCACGAGATCTCAATTGTTCTTCATTCTTTCTTCACAT TCTTCTTCATCTTGAGTTCCTATTTCGTTGTTCTTCCTTTGCGTGATGATGGTGCTATCTCTTTAGGCTTATCCAATCTCCCTTCTCTCTTCCTCGCTTC CTTGTTCCTCACTCTCTTTGCTGCTCCTCTTTCTTCTCTCCTCTTCTCCCTCCATTCCCTCTCCAAAAACAAGGTTCTTTGGTGTATCACTCATATTGTT CTTTATTTTGTGGCACACTTCATCATCTGGTTATTCAACGCCAAAATTGACACAAGAAGGAAAAACTGGTGACCATGGCAGTCTTGCATCTTCGTTGAGT TGGGATAACCATGGATGGTTCTATATCTCTGTCCGGATAGGATTGTTTCTATGGGTTGCTTTGCTTAATCTAATTACAATTTCTTCAACTTGGGCAAGGA TAATTGATGTGATGGATAGTGAGTCAGGTTCAAGATTATTCGGGTTTATTGGTGCTGGTGCCACACTTGGACAACTTTTTGGGTCACTGTTTGCGACAGG AATGGCTTTTCTTGGTCCATTCTTGCTACTGTTTGCTGCTTTCTTGATGGAACTTGGGGCACAAACATCAAGAGGAATAAATCGTGATACATCTCATGTG GAAGAAGAATTGTCCCCAATTAGGTCATTCTGAATTTTCTTTTCCATTGTTTTATCAATGAAAGTAGAGATACATTTCAGGTTTCACGGTTATTGTGGTA TATGCCTCATTTTCATTAAGGGGGATGAGTCATAAGCATCGACCTTTAAGAAGTGTACACCTTCTAGAACTAGACATTCCTAATTCCTTGAACTACCGAC GATATATTCTGTGGTACAAAGTTTATAGTTTATTCATGGAGCATGCTCACAATAAGATTCTGAAATTGAACTTATCCTTTCTCGCAATAAATGTCGTGGT GTTGCTGCAATTCTATATTACTAGGGTGCTTATGTTCTGTTTTGATCTTCTTTCTGGATAGATTCTATGCCAAAAACTTTTAATTAGCTATGAGGCATGG GTATGTCGTCCTTTCTGCCATTCGACCAGGTATGTGTTGGTACATACCAGGTGTGCACCCTTTTTAAAACAACAAAATTTGGGTAATGTTAGTGAATACG GTTACCTACCTATTTCATATCCGTATCCATACTGGGTGTGGGTATCATACCAGAATCCGTGCAACATAGTTAATTAGTTATGACAGAACACCAGAATGAA ATTGAATAGTTTTATTGATGAACATGTAAATTACATAATGTTCAACAATAGACTTGCGGCCCCAGAGACCTAAGTCTCCTAGACTCCTACTATGCGCAAA CGCAATACAGAAATGACTTGCTGTCCCAGAGTGGCAGAGTTCCAAGAACAACTAGAGAGAATATCTCTGCCCAAAAAATATATATTAACTCCTACCTGAC TGGTCCTACATAGCTGCTTCTAACATATCTATCCCTACAGACATATACCTATAGGCTATTCCTACAAATCTGTCACAGTCAGATTTCCGTCTCAGAGTCA CACCGATTTCTAGAATAAACCTTGTAGATACGAGGTTCGTATCAAGTTATGTAATTTGAAATGCTAAAGTGTGGTGGTTTATGTAATATGGCAGCATGAG TCACAGTCACCACAGACATGGATAGATAGATGGACACACTTAAACGACACAGATGCACATAAAGAAAAATGTTTAGTATGGATATCTTCAATTGAAATTA CTTCTTTAAATCTAACTAGTCATTTTTCAGAAAATGTTAAGTGCTAGGAAACAGGATGGATTAGATCATAATAATTTTTTTATTTTGAATTTAGAGGGTC TGATTCCAACCATGAAAATGGGGCTGATGAGAAGGCTAAATATACTCCCAGAGGTTCTCCAAAGTCATCTACTTCTTTAGGGAAGGTTTGGCCCATATTA GAAGGGCTATGGCTTACGTTGTCATCGACTTACCTGTTGCATGTATCATTGTTCATCTGGCTAAGTGCAGTTGTCTCTTCTTTCTTCTATTTTCAGGTAA GGTAATCTTCTGTCAGTTATACAATCTTCTACTTTTCACTTGTCTCTTTAACTTAATTTTTTGGTGTGGGTTCACAGGTTGGTCGACAAACCTGTGGGAC CAAATCCCGCAGAAGTGGACCAACCCATGTAGGCTCGCATCTAAACGGACCAGGGATTTGCCTAGGCTAAATTGCACGGGCTTGGTAAATTATACCTGGG CTGCTCTGTTTTAGACTCTGGCTAGGATTGACTGAGTTGTCCAATGCTTGGTCTGGCTAATTTGTGAAAGTGTAAGTAGCTTAAAGCTTACTAAGCTAAA GATTGGGGTAGGTTTCAAATATTAGCAATTAGGAAACTTTAAATATGCCAATTAGCTACTGATTGGGCTATTAGTGTGCTTCTAATTAGCCCCTTTATTA CTCCATCCACTCATTGAAGTCAAGTCATAAATTTCAAATAACGATACAAACTTGCTATCAATTCATACAATTTCTTTTCAACAATTCCTTAAACAGTAAT AGTTGTTTGTTTTTGTATGTTCTGCCTTGGCACAACAATAAAATTGTTGCCTTTCAAATCGAAGAAACAGATTATCGGATTGCGGGGAACGACTGTGTAC ATCTACTCTCTTAAGGTGCCACGAGGTGGGAACCTCATGTATTGGGATGTCCCTGCCTTTTACAGTCCAAAGTGGTCTTTATTGCTTATTGCTACATGTT TTAAGATGACTTGTTAAACCCACATATTTTTGTACATCATATTTCTGCTGAAGTTTCTCTCTGTTTGCAGAAAGTGAGTGTGATTGCCACTACGGTTACT AGCTCTCTTGGCAGGAGAAAATTGTTTGCCCAGATAAATAGCTTTATTGCTATTTTTATCCTTGTTGGACAGCTGTCCTTAACGGGGCGCATTCTTACGG TCTCTGGCGTGACTATAGCTATATGCTCAGCACCTTTTGTTGGCTTCTTAAATTTAGTGGCTCTAGCCATTTGGCCACATTGGCTGGTTGTTGCTATTTG TGAGACACTGAGAAAGGTTGTTACATATGTTGTGACCCGGCCCGGAAGAGAACTTTTATTTACTGTTGTTTCAGAGGATGAGAAGTACAAAGCCAAAGTA TGACCAGCCTTTCTTTCCCATGTTCCTTTCCTTTCTGATGGTGGAATAAAATGATCATTGTTGATACCGTCTTATAGGCCATGTGCCATATTTTCATTTT TGAGCTGAAATCAATGGGTTCACTACACTAACATTACAACATTCCAGAGTAAAATCTAAAACGAACTAACTATTCGATCGCCAAAGTTTGTGGATGCAAT ACTTTAAACCGACTTCATGCTGATGCAGGTATGCATAGATGTGTTGGTTCAAAGACTTGGAGATGCTGCAGCAGCTGGAATGTACAAGATACTTTTCGGA ACCCTCCATGGGAAGCCATCAACCGTTTCCCTTTATGCCCTTCCTGTTTGTGTGTTATGGATAGTAACAGCATTCACTTTGGGTCGTCGCCAAACACAAC TTTCAAAGCACCAGGTTTGTTCTACTTAATAGATTATTACTTTTTGTTTGGCTCTACTTCATAGAATTTGAGATTAAATGTACAGTGAAATCATATATGG GATATTCAATCATTTGAATGAGCCATATTTAGTTCTATTCACTTGGGATGTATAAAATCGTATAAGATCTGTTATTCATTAGAAAAATTGGTGCACATAA TTTGTTTTCTAAGTTTTTTGACCAATACTCTAATAGATTATCCTTATAAACAAATATTGCTCGT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_138834; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_412100
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438742.1) |
| Pfam | LacY proton/sugar symporter (PF01306.18) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |