Ll_transcript_357808

• Id Trinity: TRINITY_DN45180_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_357808
• Sequence: AAAGAGAATAAAAGAGTTGAATTGAAACCTAAACATTTGAACCTCTTCTTCTCCGCGAAACCCTAACAATGGCTACCTCCATAGCCTCTCAGCTCCAAGC TATCAGATCACTCGTCCAATCCGACTCTCACTCTCTCAAGAGACCTTTCTCTCGCCCTTCCATCCTGTTCGATCCTAAGGAAGCTGCTGATATCGATCTC CAATCTATTTTCAACATCGCACTCGAAGGTTTGGAGGTTCTTATAAGCGCAGATGAGCGGTTCAGGAACTATAAGAACGATTTGTTCAGCCACCGAAGTA AAGAGTTGGATAGAGAGTTGATGGGCATAGAGCAGAACAATCAACTCAATTCATCCATTGCTTCATATTTAAAGTTACTTTCAGGCTATTTTCATCTTCC GTCAGCTCTTAAAACAATTGAGTACTTGATACGTAGACACAAGGTTCATGTATACAACACCGAAGAGTTGATTCTATGTGCTCTGCCTTTCCATGACACA CATGAATTTGTTCGAATAGTACAGATACTTGACACAAGGAATAATACCAAATGGGGGTTTCTCGATGGTGTGAAAGTCTCTGGTGCACCACCACCTAGAA CTGTCATAGTGCAGCAGTGTATACGTGACAAGGGTATCTTAGAAGTTCTAAGTAACTATGCATCCCCGTCAAAAAAGTTTCAACCTTCAAGGCATGTAAT AGGTTTCTGTACTGCTGTTTTTGTTGAAGTTTTGGGTAGTTCTGTAACGGTTAATGATGATGTAGTCAAGAGAATACTTCCTTACGTGGTCTCTGGTCTT CAGTCTGGCATTAAGGGCATTTCAGACCACAAGGCTGGTTCTTTAATGATTGTTGGTTTACTTGGAAATAGAGCTGCATTAGCTCCCAAACTTCTGAACA GTCTGATACGTTCAGTCGCTGAGGTTGCTCGTGAGGAGGCAAAAGAGTTAACTGATCTTCAGTGGTTTCGGCTGTCCATAATTGCCTTGATAAATCTTGT TCAGTCACAAAATGTTGACATACTTCCTACCAAGGCATTGGAGATTCTAAAAGAAATAAGGGACTTGGCAGAGGTTTTGTTAGAATTGTCTAGGGAGTTC AATATTGAAAAATTTCTTCTTGTGCTTTTGGACTCCCTGATTAACTGCAGTTCTTCTGATGAATACTGTCAACGGGCTTTGCTATCTATAATAGAAAAAG TCCCCATCAGTGGATCTGTTTATCATGTGGTCACTAAGATCCTATCAACTTGTGTGAAATTATCACAAAAAACTGGTGACTCAGCATCTTCCGTGTCAGC TGGGTGGGCAAAAAAAATTATGATAATTGTTAATACGAAGTATCCTTCTGCACTACGTGGAGCAGTTCAGCATTTCCTTCAGGATAATAAAGCGCATTCT ATGAAAGATGACAAACTATATAAGGTTTTATGTAAGATGTTGGATGGCAATTTGGACTCATCACATGGTATATCAGATTCAAAAATTTGGTTTGCCTTGC ATCATCCGAAGGCTGATGTTAGACGTGCTACATTGCTTGATTTAAATTCATCTGGCATGCTGAAGACCAAAGCAGTTGCTTCAGAGAGTCTTATAGACAT CGAAGAGGCAATATTGAGACAGCTTGATGATAAAGATCTAACAGTTGTTCAAGCAGCATTATCTATTGATGGCTTGCAAAATGCAATAGATTCTTCTAAG CTTCTTGATGCACTGCAGAAGGTGCTAAGAAAATGTTTTGGCATGCTGGTGTCTGGTTCAACTGAAAACATTAGTTTAACCGTCAATGTTTGTGTCATTT GTCTAAAGAATGCCATTTCATACTTCCATGATCTTAGTGGTTACTTGAACAAAGTTGCTTCCATGATTTTTCCTTTACTCCTTGTTTTACTACAGACACA ACACTTGAATTTGAAGGCTCTTGGTTTAGTTGAAAAAATAAACTGGCCACTTTATCAGAACATTGCTGTTTCTTCCCCTGGAGAATTGACATCAATACCT GGAAGTTTATCTTCAATTAACTTGAGAACTATCAATAACATGGCCGAGAATTTCATGGTCCAACCTGAAGATCATATTGCTTGGTTTGTTGACAACTGCA GTGATTTGGAATTGTCGAAGACATTGTTCTTTTTTGTTGTATTGCAATCTCTTTTGATCAAACCAAAAGGCGATGACTTCTCTGCACTTTTTGAAAGTGT ATTTCCTATTCTAAAGGCTGAGTGGAAATCCTTAGTGACTGCTGGTGATGTTCCCTTGGAAGAGTTTAATTCGGAAATGTTAGACTGGGATTGCAGTGCA TTCTTTGATCATCTTTCGGTTGCTAGTCTTGGACCTTTAAATACAAAACTATTGGTTTGCATATTTTGGAGGCTGCTATCAGCACTAATATCAGTAGTTC CTTCAGATATTATACTGGATGATGATAATAAGTGGGTCAGCAGGATAAAGGACCTGTTTGTATTTTTTGCAACCTCACAATTCAAGAATTCTTTCAATGA ACACCTCCATTACTTAGCGGCACATTGCAAAATATCACCTGCCCGCCTCTTATCTAAGTTCTTCACAGGGGAAGGTGTTCCTGTTGCAGTCCAGGTTGAA AGTCTGCAGTGCTATACTTTTCTCTGTAGTTTGTCACAAGATAGATGGCAAATTGAACTTTTAGCCGAATTTCCTTCCGTGCTTGTTCCATTGGCTGGTG ATAACCAGACTATAAGGATTGCTGCCATGAACTGTATCGATGGGCTACATGCATTGTGGTGTCGTATCGAACCTCCTGGCAAGAAAAATGGTAGCAATTT TCTTGGTGAATGCAATTTTCTCGGTGAACTTCTACGGTTGATGGATGAGCAAAAAACACTTATATTGTCTGACAGGAAATTTCTTCCTTCTCTGTTTGCA TCCATGCTGAGCTTATCCTGTCATAACATCTTAGTACCTCAAAATATAGAAAACAGGTTTGATCAGCCTGCAAAAGAAAAAATTCTTGGATTCATATTGC GTTCTGTTCCGAAATTCTCTAACTATGGGAAGCTAATGATTTTATCCTTGCTCAAAGGAATTGGGAGTGTTATTATGCACGTCAAAGAATACTGTGATGT GCTAGATACATCTTGTCAGAAATTGTCAAAAACTGAAATTCAGATAAAGTGCCTTTTGCTGGAGAGCTGTGTTATGTCATATTCTTCTGGTGGAAATGAT CTGCAAGGTCATTTACTGAAGGCTTTGCAGTTGGATGCTACGACTTCAGATGACCCTGCGTATGTAGAGCCATGTATCACTGTCTTAAACAAACTTCACA ACGAATTCTATAAGGGGTTGAAGAATGAAGTGAAGGAGCTTTTATTTTGTGAGCTTGTATTTTTGTGCCGCAATGCTAATGGTGCCATACAGAGTGCAAC CAGAGATGCCATAATGCGTATAGATATTGATTTCTCGACTGTTGGTCACATGCTTGATCTCATAATTAAACATGAAAATTTTGTGGGTAGTTCAATGTAT GAAAAGACGGCGAAGAAACAGAAATTGACAGTAAATCAAGACGCAGACCTTCCCCCAAGTGACATATGTGGAGGAGTTGATCCAGTCTACGTCATTAGTT CTCTTCTTGATGTTTTGCTGCTAAAGAAAGACATAACATCCAGAGATTTGCTTTTAGGCCCCTTATTTAAGCTGCTTAGCACAGTATTTTCAAAAGAATG GGTAAACAATGCACTTTCCCTCGAGACAACGTTAAGTCAACCTTTGTCAAGTTCATCTGAAGCCCACACTGCCATAATCTGTCATATTCAACAGACACTG TTGATTATCCTCGAGGATATAGTTAGGTCATTTAAGAGCATAGCTCCACTAAAAGGAAAAATAGCAAATGTAATTGACATTAAGCTACTGATAGAGTGTG CACGTACTTCAAACGATGTGGCCACCCGCAACCATGTATTTTCTCTTCTTGCTACCGTTACCAGAGTCTTACCAGAAGAAGTTTTGGGGCATATACTTGA TATTATTGAAATTATTGGACAATCAGCAGTCATACAGATTGACACCCATTCAAAGCATGTTTTTGAGGATCTTATATCTGCGATTGTTCCTTGTTGGTTG TCTAAGACAGACGACGTGGAGAAGCTACTGAAGATTTTTGTAGATATATTGCCTGAAATTGTTGAGCACAGAAGACTCTCAATTGTTTTATATTTGTTAA GAACTTTGGGTGAGGGTAAAAGCTTGGCCTCATTGCTTAGCCTGCTTCTCTCTTCGTTAGTTTCAAGGAAAGCTACCTCTTTCCTTAACAGCGAGACTAC AGATGCTTTAGCATTTTATACCAGAGAGTGGGAATTTAATTTTGCAGTGCAAATTTGCGAACAATATACAAGTATTAACTGGCTTCCTGCTTTAGTTGCG GTTTTTGAGCAGAATGGAATTAGTAACATTGGCCAGGGACAGTTTCTGGAGTTGTTTCTTGCAATGCAATTGACGCTGCAAAAATTCCAAGAACCAGAAT TTGTGTTGAAGTTGGAATCAGGAGAGGACACGGATGTGATCCAGAGAGCATTGGGACAACTGATGGAACAGATCGTTTTCCTCTTGCATGTTGTAGATGC AAGAAAAAAGCAACTCAATTTGCCTGTCATTGTGAGGAAAGAGTTAAAGGAAATTATGCGTGCTGTTGTGAGGAATATAACCTTGGTCATGACACCGTCG GCATACTTTAAAAGCATAATTAATTTGCTCCAGCATGCTGATAAAAATGTTGGGAAAAAGGCTCTTGGTTTGTTATGTGAGACTGCAAGAAGTCATAAAA ATGTCAGTTTAAAGCTGAAAGACAAGAAAGGTTCAAGGTCAAATCCAAGTTTTAGTTGGCTTCATATGAATGAAAGTTCTCAAGAATCACTTAATAATAT GTGTTTAGAAATTATTCGAGTACTTGATGATTCGTCTGATGTCTCTTTGAAAGTGGCTGCTGTTTCAGCATTAGAAATTTTGGCAGACAGATTTTCTTCA AATAGTTCCATCTTTAGTGTTTGCCTTGGACCTGTTACCAGATGTATCACATCTAACATCCCGGTTGTTACTTCTAGCTGCCTTCGAGCAACTGCTGCCT TGGTCAATGTTTTAGGTCCTAAAGCACTGGCAGAACTTCCTCAGATTATGGACAGTGTGATGAAGTCCTCTCGTCAAGTGTTGTCTAAATCTGATACAAA ACCCAAAACTAATGAGGTTTTATCAGCCTCCAATGAGTCCCATTTGTTTTCAGTTCTCATCACTTTGGAAGCAGTTGTGGACAAGCTTGGTGGATTTCTA AATCCATATCTGACTAATATCATGGAGCTTCTGGTGCTTCATCCCGAGTATGTCTCAGGAATAGATGCAAAGTTGGAGTCTAGAGCTCATGGAGTACGAA AGCTTCTAGCTGAAAAAATTCCTGTTCGACTTGTGCTGCCACCATTGTTAAAATTATACTCTGCTGCCATTGAGGCTGGGGATAATAGCTTGACAATTGT ATTTGATATGTTGGCAACCTTGGTTGGTACAATGGACAGATCATCTATTGTGGCGTTCCATGCTAAAGTTTTTGAATTTTGTTTGGTTGCTCTTGATCTT CGGTTCCAAAGTCCTCCTTCAGTTCAAAACATTGATGCAGTAGAGAAGAATGTCATTAATGCAATGGTTGCTCTGACCCTAAAACTTACTGAGAGCATGT TCAAGCCTCTTTTTGTTAAAAGTATTGAGTGGGCAGAATCCGAAGTGGATGAAACTGCATCTGCAGGAAACGTTGATAGGGCCATATCATTCTATGCCAT GGTAAATAAACTTGCGGAGAGCCACAGGTCATTATTTGTTCCATACTTTAAACACTTGCTTGGTAACTGTGTTCATCATCTTGATGATGGTGGAGATGTG AAAGCATCCGGATTGAATAGGAAGAAAAAGAAGGCCAAGACTCAGGAAGGGGACAGTGTGTCTATAAAGAGCTGGCATCTCAGGACATTAGTTCTGTCAT CCTTACACAAGTGTTTCCTCTATGACACTGGGAATTTGAAATTTCTTGACTCCTCAAATTTCCAGGTGCTTTTGAAACCTACAGTCTCACAACTTATCGT AGATCCACCAGCTTCGCTGGAAGACAGCACGAATATACCTAGCGTGAAGGAAGTCGATGACCTACTAGTTGTGAGCATTGGTCAAATGGCTGTGACTGCT GGATCTGATCTTTTGTGGAAACCCTTAAACCATGAGGTGCTGATGCATACAAGGAGTGAAAAGTTGAGACCTAGAATATTGGGACTCAGAATAGTGAAAT ATCTAGTGGAGAACTTGAAAGAAGAGTATCTGGTATTATTGGCCGAAACAATACCCTTCCTTGGTGAACTGCTTGAGGATGTGGATCTTTCAGTTAAAAC TCTTGCTCAGGAAATTCTCCAAGAAATGGAATCTATGAGTGGGGAAAGCCTTCGCCAATATCTGTGATGTATCTTATGAATCTATTACTTTTACTGCTAA TTGTATTTTGTCATCTAATGTGTACTATGCTTATGTTTTTTAAGGAAGAGAAGCATTTTTGGTAGTATAAGGGTGATAAATTTATTCTTATTTATAAACC GAGAGTCCAAAGAAGATTACAAATAAACTGTTGTTTTTATATAGCTTCGTGAAAGAGACATTATGTTAAGAAATGAAATCAACAAGAGAATTGACCACTA GATTGCAGATCCGTAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_139086;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_357808

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 8.5
• PS1: 7
• PS2: 7.5
• PS3: 9.1
• PW1: 5.7
• PW2: 4.7
• PW3: 3.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_357808

• Blastp: Uncharacterized protein At3g06530 from Arabidopsis with 46.64% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein At3g06530 from Arabidopsis with 46.57% of identity
• Eggnog: U3 small nucleolar RNA-associated protein 10(ENOG410XNQQ)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G06530)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001374)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019435540.1)
• Pfam: U3 small nucleolar RNA-associated protein 10 (PF12397.7)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;