Id Trinity | TRINITY_DN45325_c0_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_324251 |
Sequence | GAAAAAGTGAATAGATATTAGATAGGGTTTGGGCGAGTCTATAGTTTTCTACTACTATTCCCTTTCCTCATTTTCCCGCCGTTTCTCTCTCTCAAATTTA CCATTTTCCCGCCGCACCGATCCATCGCCGCCGCCGTCACAACCACCGTAACACACTGACACCGACACCGAAACGCTGCGTTTAAGAGAAGACAATGAGT GCTTCTACTAGAAAGAAGGTTCAGAGAAAGAGCAAGATCAGAGGCTACAATCTCAAAGTTGATGCTCTCGATGAGATCCTCTCCTTCGTTTCTCGTTTCC CTAATTCAGATCATGATGAAGCAATTGATCTTCTCCTCGATCAACTCGATCACGAATCTCTGAAATCTACTATAGTGGACAAGGAGCTAGTGCAGCGTTT AGTTAGTCTGTTATGGGAAACCGATGAAGCGGTCGGTGAAACATCGGTTTCATTCGGTTCTAGTTCTCGTTCCTCCATTTGTGTCGTTGATGCCTTCGAC ATTCCAAGATTTCACTATGACCCTATCAGAAAGCAATTCTATGAGCACACAAGCAGCTTACCTGTTCATGGAGAAGCATCAGCAAAAGAATCTTTGTACA GGGATAGGTTTCTTTTGTTATCCCAGAGGCTCTCTCGTGACCAGCATTTTTCAAAGCCTGCTTTTGATTCTGAATTTTCACACTTTGGGAGTTGTGAGAT ATCTCCTATTCAATCTCTTGTGGGGCAAACAGGTAGAAGATGGGTAATGGGATTAATATCCCAGCTAGAAGATGGGCATTTTTATTTGGAAGACCTTACT GCTTCAGTTGAAATCAATTTATCTAATGCTATATCCTTTTGTCTCTTGACAATAATTATTTTGTTATTTTATGTGTTGCAAGAGCTCTACAATCTTATTA AAGGTTTTAATTAGTTTTACTTGAGGATAAAACAATAATGAAAGGAGAGTTCAAATTGGGTTTGCCTTCAGTAAGTTTATTTATTTTAGTGACAATTTTT TTGTCTGGGCTGTACTAATTCAGTGTCTGGATGTTCACTTGCAACTTGTTTTCCCAGTAAGCTGCCTTGCATGCCATGTTTTGGCTTCTTCCAGTGGATT AGTTTTCTGCTCTAAAATCTATCTATAATTATTATTGTACACTTTTCAGATTCGACCACCGGTTTGATGCTGCACAACTATATTCAAATACTAAAAAAAA AAGATGAAAATATATTACTCATTAACCTTAGGATCATTTCGTCCATGATGGGCTTACTTGAGATTTGACCATGTGCATAACTTGTCCATGTGGTTTTTAG ATTTTAATTTTTTAATATTCCACTCATATTATGGTGAACAATAACATCAGCCATCTTGAGTAGATCGAAATTAATAATAGTTTGGTTAAGATTATTAGAT ATATCTAAGTGATTGAAGGATTTCGGTACAAAGTGCTTGAGATGCATTTGCTCTATCTTCATACTTTTTATACTATAACTCTTACATTTCAAATATCATA TTAGCATGGATATATTTCATCGGTTTCTTTGACTAGCAATACAAGATAACTACAGGATTCTTTTCAGAGAACACCATAGTTGTGGCCGAAGGCGAGATGC TTGTAGAGGGTATTTTTCAGGTTATTCTTAGCATGCCCTTCTCTATATATTTCTTTTTGGATTTTTTATATGCTTTTATCGAGAAAGTCAATTTATTCCA GATGAAGATTACTAAAGATACAGTAACAGCTTTTAAGACTTCTAAGTTTAGTGCTCCTTTACAACATCCTTTTTTCATCACACACCGAATGTCATGCATT CTCTTAAAAAGGAACCCAGAGCTAATATAAATTAATAGTAGTGGAGAACCTTTTTTAGATACCTTTTTTCACTGCACCTTACCTATGGTGGTGGTATAAT GCTATTTCTGCAAGAACACAAGTGGTTGCATGTGTCTATTACAATTTTTTTTAAGTGGGCCTGCTTGTTCAACTGGAATGACTTCTTGGCTTGTGAAGGT GAGTTTTTTTGTAATCAGCTTCACTTGTTGTTACAGTGTTGCTTGCAAGGAGGGAGGTTTAGTGTATTACTACTTTTTTAAAGGAAAAATTGAAGTAGAG ATATATATGAGATAAGAATGCTACTGTTTTTAACTTACTAGTACGCAATTAAAAGTCGTTATATTTAGAGACAGAATTTCACACATAAATGTCAGGAAAA TATCAAACTGGATAAGTTTATAGTTCTTATACTTGAAACTGCTTCACATGTATAATAAGATTAATAGGATGGGATAGCCTTTAGGTTTCTTTTTGTGTCC TGTTGGCTGTTGCTAAGTTGTAAATTAAATCATGTGCTATAGTTTTTTGTTTTCTTTCTTCGATGAGTAGAAAGAAGGAAGATTGATTTTACCTGAGGGC TGAGGCCTGCTTTAAGTTTTTACCCTGCTGTTTAGAAAATGTCAATTTTGTCTTCTCCATGTTATGTTTTGCCAATATTGTCTTTACCTTTGAATGATGC ACATGCCTTGAGAAGAAGAATTGTTGCAACAAACCACCTTAAAGGAGGCTTATTGCTATGAAGGGAGCAACTTTAACTTACATTGTCAAATGCCTTCTTT CTTAAACCGGTTTAGAGGCTTAGAGAATTGATGCGAATTTGGCTTGATAATTGTTGATAAAATTTGCTTAAAATCTAGGACTTGTTGGAGTTGATTTAAT CATGACAGCATACAGCCCACTTTTTTTGGCAGGTTTTAACATGTGGATTTCCCCCATTGGAGGATAGAGATAAGTCACTTAAACAACTTTCAGGGCAGGA CTTTTTTGGTGGTGGTACTTTCACGATAGAAGAAACTATTAAACTGGAAGAGATGGAAAGAAGAGCAGTGAATGACATGTTTGTTATTCTATCCGATATT TGGGTAGACAATGAAGAAGCTATGGGAAAGCTAGAAACTGTTTTGGATGGCTTTGAGAGTGTGGAAGTGGTTCCTTCCTTATTTGTTTTCATGGGAAATT TCTCTTCTCACCCATGTAACCTTTCTTTTCATACTTATTCGACCCTTAGGTTGCAGTTTGGCAAGCTGGGGCAAATTATTGCTGCCCATTCACGGCTAAT AGAGCACAGTCGATTTCTGTTTATTCCAGGTCCTGATGATGCAGGTCCTTCAACATCTCTTCCTAGGTGTGCTCTACCAAAATATTTAACTGAGGAGCTC CAAAAGCATATTCCGAATGCCATATTTTCAAGTAATCCCTGCAGGGTCAAGTTTTATAGCCAAGAAATTGTATTTTTCCGACAAGATATGCTTTATAGAA TGCGCCGTTCTTGTTTAATGCCACCTTCTGAGGAAGAAACTGATGATCCTTTTCAGCATCTTGTTGCTACAATAACCCATCAGAGTCATCTCTGTCCACT ACCTCTAACTGTGCAACCCATCATCTGGACTTATGATCACTGCCTCTATCTTTATCCAACTCCACACACGATAGTCTTGGGAGATAGTAGTCAACAGAAG GCATTCAAGTACACAGGAATCACTTGTTTCAATACTGGTTCCTTCTCAATTGACAGCACCTTTGTTGTGTACCGTCCTTGCTCTCAGGAAGTTGAATTAT CAGCCTTGTAAGAACTTCAGAATGAATTCACTTGGTTTGTTATCCTCTAACCATAAGCTTATCAGGCCTATTAGCTTTGGTGCTCTTTATTTGATATACA TACCAATGAACATGAAATTTGTGATTCATTTCTTTTTCTCTCTTGGGAGGGTCAGAATGTTGAGTATTTTTGTATTATATGCTTAATGCTTTGTAAACAA GTGATTATTGTTTTATAGTAGAATCTGTAAGTCTAGTTGAGAATATTTATTTTTTAAAGTTATGAGGCAGTTTCTTGTTTATTGGGTAAAATTTGTAAGC GTGTACTACACAAAATGTTCCTTTTCTTTGATAAGTTATTACTGAGCCACATTAAGTAAAAACCCG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_139385; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_324251
Blastp | DNA polymerase epsilon subunit B from Arabidopsis with 61.42% of identity |
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Blastx | DNA polymerase epsilon subunit B from Arabidopsis with 78.57% of identity |
Eggnog | DNA polymerase epsilon subunit(ENOG410XP7N) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G22110) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002418) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019436766.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |