Id Trinity | TRINITY_DN45511_c0_g1_i17 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_426500 |
Sequence | GATAGTTTGGATAGATTTTACACTCTTCTAAATTGCATTTTGATGTTGATGACCTTCTTTAATCGTGCATGTCATAATATAACCTTTTTATAAGAAAGAA AATCCAAAACAAAAAAATAACAGAAGAAGGTAGTGATTGAGTGGTGGTTGTGGTTGGTAAAGGGAAGAAGAAATGTTAGGACAGATAATGGGTGCAAACG TGGGACTCATATCCCCTTCACTTCTTCCACCTTCTCTCTCCAAAACCAAATCCAAACTATCACCAAGTAACTCATATTAATCTTTTTGTACTTTTATTTC AATCCATTCCAGTTTGTCACAGAACTCAGTACTAGGTTTTTGAGATATTACCATGAATGATGTATATTAATAATATTTGAAGTAATGTCTATGGATTTTT ATTTGTCATTTCCTATAGACTTGCTTTGGTTTGAGATGTTTCCCATCCATGAATTTTTGGGTCATGAATTATGGCTTATTTCCTGTAGAAAAAATTATCT GTGAACAAATTTTATGCAATGTTGCATTCAATTTCATGATTTTTAATGTCTCTATATGTATGGGCTTTTCTTAGATTGTGGGTAATTTGAGTTGTAATGG TGAAAAGTTATTGAGTTGCAGTTAATCTGTTGTGTGCTTATGTAGTTCTTAATTCTTAGGGTATGGTAAGAGCCCTTTGTTAAGATTTTTTTTTATTAAA AAAATCTGAATTTCTTGTTTGGTTGGACTTTTACTAAAAAGATTGATTTTTTCAGCCTCTTACAAAACTGTTTCTACCAAAATTGATTCTAGAGAATCAC TCTTTCGAAACAAAAACAAACGGGGATTATTGAAATCTTAGTTTGACGATCGATAAATGGACTATATAGCAGGATTGCAATATGAGGCCTATGACTTTGT GCAGAATTTGTATCCTGCTTGAGCTATTTAATGTCATTGACTTATAGCTTGTTGAAAGATATGCAAGGTTTAGGTTCTTTTAAGCTTATAATTCTATGGC AGTGGCCAGTATGAGCGTGAGTCAAGATCCAGTTCGTGAGTGGATTCTTTCTGAAGGGCAAGCTACAAAGATAACCAAAATTAGTCCTGTTGGTGGTGGT TGTATCAATCTCGCTAGTCGCTATGACACCGATGCTGGTTCTTTTTTTGTGAAAACAAACAGGTATGTCTATGTTATAACACATTCAAACTTCTGTTCCG GCTTGATGATTGAATTGTCCTTCACCTTTGGGGTTGAAACTGGAAAATTCCATGTTGAATGTATTGGATTGTTTCGATTATCTTTGAGTAAAAGCTTCAT TCCCTCTGCATCTTATATATGACAATTTCAATGCTGATGAAACTTGAAACTCTATATCAGAAGTATTGGACCGTCCATGTTTGAAGCAGAGGCTATCGGT TTAGAAGCTATGTATGAAACTGGGACCATTCGTGTGCCTAAGCCACATAAGGTTGGAAGACTTAACATTAATTTTGTGAAAGCTGCAACTATTTGCTAGC TATAGCAAGCTGGAGAGAACATGAGAGTTAACTTGTTTCTAGGAAATTGTAGGTTGGACCGCTACCTACGGGTGGTTCATTCATTGTTATGGAATTCATA GAATTTGGTGCATCTAGAGGCAATCAGGTCAGTTACCTAGAACTAACTGCTAATTAGGAAAGCTTTTGAAGCTTAATTGTAATTTATTGTTCCCAGTCTG CTCTAGGGAGGAAGCTTGGTGAAATGCATAAAGCCGGAAAATCTAGTAAAGGATATGGTTTCGATGTTAATAACACCATTGGCAGCACTCCGCAAATAAA CACTTGGTCATCAGATTGGATTCAATTTTATGGAGAGTGTAGATTGGGTTACCAGTTAAAGCTTGCATTAGATCAGTATGGTGACAAAACCATTTACGAA AAGGGACAGAGACTAGTTAAAAGCATGGGGCCCCTTTTTGACAATGTAGTAATAGAACCATGCTTACTACATGGAGACCTTTGGAGTGGAAACATCAGCT CTGACAAAAATGGAGAGCCTGTCATACTGGACCCTGCATGTTACTATGGACACAGTGAAGCAGAATTTGGAATGTCTTGGTGTGCAGGCTTTGGAGGATC ATTCTATAATTCTTATTTTGAGGCATGTAGTTCTTATCTCTCTCTCTTCCGGATTTCCTTTCTCTTTTTGTTGTTTGTTTCAAATTAAAGGAAAGTTTTG CCTGAGAGTTTATCGGTGCATTCTATTTCTTCCCCCTTTTACTCTTAGAATCTTGGTTGAATATGGCATCTGTGAGTTAGATAATATTTGAGGATTTATC ATCTATATTTGTTTGTGTAAGATCAAATTGCATGAAACCAAATAAACAATAATTCCAAAAGTCATTGGGTCCATCCAATTTGCATTACATCAATATATAG AACTATCAAAACAGCAAGATGGTTTTCATCAACAATGTGACTACTTGCTTAGCTTCTCAGTATACTTCTTAAAATAGCTTATAATAGATTTACTTGCCGT GTTTCAACGAAACCAATCGTGCCAACGGCTGGCATGTCAAATGTCAGTTTCACACATTAATATTGTTACGTTCATAATTGCATATGATTTTTCCAGGTGA TACCTAAACAGCCAGGCTTTGAGCAGAGGAGAGACCTTTATATGCTGTATCACTATTTAAATCATTATAATCTCTTTGGTTCCGGATACCGGTCATCATC GATGTCTATAATTGATGACTATCTGGCAATTTTAAAAGCTTAGGATTGTAAGCATAATTGGCAAGCATGCTTGAAAGAGGTTCTCTTCTTGAACATTTCA CTACTTTCATTTCCCTGCTCAGCTCTCAATGAATTGAAGATATAATTCATTCCAATGCAAAGTCAATTAGTTTTGTTTGAAAGTTAGACTAGACTATGTT TTACCCTATATATATAAGAGTCAAATTTAATACAATCATGCAAGATAAGTCATCAAGACATGAAACATGTTATATATCTCAAATAGGCATTGTCATGTTA TATATCAAGACATGGTTCACACTTCAAGTTAGAGGTGCACCATGGCAGGAATCCTGCTATGCTAGTTAGACTTGTAGTGATGTATGATTTTAGGCTTTAA TAATTTAAGCTTCTGTCATCATTCATGTATTTATAGTGTTTTTCTTCTAGTATTGAAATGACTACAAATTTTGATATTCACCTTAATCTTGTTATTTGAA GTGCTTTTCTTCTAGTGTTTAAGACTTCTTATTTTGGGGTGTACTATTGATATCCATGGGAAATGTAAGAAAAATTAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_139809; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_426500
Blastp | Protein-ribulosamine 3-kinase, chloroplastic from Arabidopsis with 73.51% of identity |
---|---|
Blastx | Protein-ribulosamine 3-kinase, chloroplastic from Arabidopsis with 69.63% of identity |
Eggnog | Fructosamine(COG3001) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G61080) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461137.1) |
Pfam | Fructosamine kinase (PF03881.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |