| Id Trinity | TRINITY_DN45511_c0_g1_i20 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_426503 |
| Sequence | GATAGTTTGGATAGATTTTACACTCTTCTAAATTGCATTTTGATGTTGATGACCTTCTTTAATCGTGCATGTCATAATATAACCTTTTTATAAGAAAGAA AATCCAAAACAAAAAAATAACAGAAGAAGGTAGTGATTGAGTGGTGGTTGTGGTTGGTAAAGGGAAGAAGAAATGTTAGGACAGATAATGGGTGCAAACG TGGGACTCATATCCCCTTCACTTCTTCCACCTTCTCTCTCCAAAACCAAATCCAAACTATCACCAAGTAACTCATATTAATCTTTTTGTACTTTTATTTC AATCCATTCCAGTTTGTCACAGAACTCAGTACTAGGTTTTTGAGATATTACCATGAATGATGTATATTAATAATATTTGAAGTAATGTCTATGGATTTTT ATTTGTCATTTCCTATAGACTTGCTTTGGTTTGAGATGTTTCCCATCCATGAATTTTTGGGTCATGAATTATGGCTTATTTCCTGTAGAAAAAATTATCT GTGAACAAATTTTATGCAATGTTGCATTCAATTTCATGATTTTTAATGTCTCTATATGTATGGGCTTTTCTTAGATTGTGGGTAATTTGAGTTGTAATGG TGAAAAGTTATTGAGTTGCAGTTAATCTGTTGTGTGCTTATGTAGTTCTTAATTCTTAGGGTATGGTAAGAGCCCTTTGTTAAGATTTTTTTTTATTAAA AAAATCTGAATTTCTTGTTTGGTTGGACTTTTACTAAAAAGATTGATTTTTTCAGCCTCTTACAAAACTGTTTCTACCAAAATTGATTCTAGAGAATCAC TCTTTCGAAACAAAAACAAACGGGGATTATTGAAATCTTAGTTTGACGATCGATAAATGGACTATATAGCAGGATTGCAATATGAGGCCTATGACTTTGT GCAGAATTTGTATCCTGCTTGAGCTATTTAATGTCATTGACTTATAGCTTGTTGAAAGATATGCAAGGTTTAGGTTCTTTTAAGCTTATAATTCTATGGC AGTGGCCAGTATGAGCGTGAGTCAAGATCCAGTTCGTGAGTGGATTCTTTCTGAAGGGCAAGCTACAAAGATAACCAAAATTAGTCCTGTTGGTGGTGGT TGTATCAATCTCGCTAGTCGCTATGACACCGATGCTGGTTCTTTTTTTGTGAAAACAAACAGGTATGTCTATGTTATAACACATTCAAACTTCTGTTCCG GCTTGATGATTGAATTGTCCTTCACCTTTGGGGTTGAAACTGGAAAATTCCATGTTGAATGTATTGGATTGTTTCGATTATCTTTGAGTAAAAGCTTCAT TCCCTCTGCATCTTATATATGACAATTTCAATGCTGATGAAACTTGAAACTCTATATCAGAAGTATTGGACCGTCCATGTTTGAAGCAGAGGCTATCGGT TTAGAAGCTATGTATGAAACTGGGACCATTCGTGTGCCTAAGCCACATAAGGTTGGAAGACTTAACATTAATTTTGTGAAAGCTGCAACTATTTGCTAGC TATAGCAAGCTGGAGAGAACATGAGAGTTAACTTGTTTCTAGGAAATTGTAGGTTGGACCGCTACCTACGGGTGGTTCATTCATTGTTATGGAATTCATA GAATTTGGTGCATCTAGAGGCAATCAGGTCAGTTACCTAGAACTAACTGCTAATTAGGAAAGCTTTTGAAGCTTAATTGTAATTTATTGTTCCCAGTCTG CTCTAGGGAGGAAGCTTGGTGAAATGCATAAAGCCGGAAAATCTAGTAAAGGATATGGTTTCGATGTTAATAACACCATTGGCAGGTATTATATGCCTTC ATCTTGAAAGTTACCATTTCTGTTTCAATTGATATTCCTATAATTATTGTGCCTCTTTATATTTTACCGAGACATGTGTTGCATGTTAGATATATCCACA GAACAGTACAAGCTGATGTTTATAAACATTTAGAAGGGATGTTTGGTAACTAATTCATTTCCTGTGATGTTATGCATATTATGCCGTAGCACTCCGCAAA TAAACACTTGGTCATCAGATTGGATTCAATTTTATGGAGAGTGTAGATTGGGTTACCAGTTAAAGCTTGCATTAGATCAGTATGGTGACAAAACCATTTA CGAAAAGGGTAATTTTTATATGGTATTACTGCTCTTCCCATCAATTATTTTTTTGCCCGAAATCATATTCTGGTGTATGGGTATATTTAGATTGAATAAA ATGAACAAGTCAATTGAAACTTGAACACACAGACAGATTGGATCCATGAAAGAATTCATTAAGTTCATTGAAATCGGGAGAATAGGAGGCTACGAATAGT CGCATCTATCTTCACCTTTCATATATTGGATTCTTTCTAATTGCTATTAGATTTGTCACACTTGTCCCTAGTTCAAGATTTTCGCTCATTATGTATTGCA TTACGTAGTTTAATAATGTTCCGAGATTACTAAAACGAGTGCTATTTATATCTGATTTACTTCATCAACAGGACAGAGACTAGTTAAAAGCATGGGGCCC CTTTTTGACAATGTAGTAATAGAACCATGCTTACTACATGGAGACCTTTGGAGTGGAAACATCAGCTCTGACAAAAATGGAGAGCCTGTCATACTGGACC CTGCATGTTACTATGGACACAGTGAAGCAGAATTTGGAATGTCTTGGTGTGCAGGCTTTGGAGGATCATTCTATAATTCTTATTTTGAGGCATGTAGTTC TTATCTCTCTCTCTTCCGGATTTCCTTTCTCTTTTTGTTGTTTGTTTCAAATTAAAGGAAAGTTTTGCCTGAGAGTTTATCGGTGCATTCTATTTCTTCC CCCTTTTACTCTTAGAATCTTGGTTGAATATGGCATCTGTGAGTTAGATAATATTTGAGGATTTATCATCTATATTTGTTTGTGTAAGATCAAATTGCAT GAAACCAAATAAACAATAATTCCAAAAGTCATTGGGTCCATCCAATTTGCATTACATCAATATATAGAACTATCAAAACAGCAAGATGGTTTTCATCAAC AATGTGACTACTTGCTTAGCTTCTCAGTATACTTCTTAAAATAGCTTATAATAGATTTACTTGCCGTGTTTCAACGAAACCAATCGTGCCAACGGCTGGC ATGTCAAATGTCAGTTTCACACATTAATATTGTTACGTTCATAATTGCATATGATTTTTCCAGGTGATACCTAAACAGCCAGGCTTTGAGCAGAGGAGAG ACCTTTATATGCTGTATCACTATTTAAATCATTATAATCTCTTTGGTTCCGGATACCGGTCATCATCGATGTCTATAATTGATGACTATCTGGCAATTTT AAAAGCTTAGGATTGTAAGCATAATTGGCAAGCATGCTTGAAAGAGGTTCTCTTCTTGAACATTTCACTACTTTCATTTCCCTGCTCAGCTCTCAATGAA TTGAAGATATAATTCATTCCAATGCAAAGTCAATTAGTTTTGTTTGAAAGTTAGACTAGACTATGTTTTACCCTATATATATAAGAGTCAAATTTAATAC AATCATGCAAGATAAGTCATCAAGACATGAAACATGTTATATATCTCAAATAGGCATTGTCATGTTATATATCAAGACATGGTTCACACTTCAAGTTAGA GGTGCACCATGGCAGGAATCCTGCTATGCTAGTTAGACTTGTAGTGATGTATGATTTTAGGCTTTAATAATTTAAGCTTCTGTCATCATTCATGTATTTA TAGTGTTTTTCTTCTAGTATTGAAATGACTACAAATTTTGATATTCACCTTAATCTTGTTATTTGAAGTGCTTTTCTTCTAGTGTTTAAGACTTCTTATT TTGGGGTGTACTATTGATATCCATGGGAAATGTAAGAAAAATTAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_139809; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_426503
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein-ribulosamine 3-kinase, chloroplastic from Oryza sativa with 76.47% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461137.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |