Ll_transcript_426488

• Id Trinity: TRINITY_DN45511_c0_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_426488
• Sequence: GATAGTTTGGATAGATTTTACACTCTTCTAAATTGCATTTTGATGTTGATGACCTTCTTTAATCGTGCATGTCATAATATAACCTTTTTATAAGAAAGAA AATCCAAAACAAAAAAATAACAGAAGAAGGTAGTGATTGAGTGGTGGTTGTGGTTGGTAAAGGGAAGAAGAAATGTTAGGACAGATAATGGGTGCAAACG TGGGACTCATATCCCCTTCACTTCTTCCACCTTCTCTCTCCAAAACCAAATCCAAACTATCACCAAGTAACTCATATTAATCTTTTTGTACTTTTATTTC AATCCATTCCAGTTTGTCACAGAACTCAGTACTAGGTTTTTGAGATATTACCATGAATGATGTATATTAATAATATTTGAAGTAATGTCTATGGATTTTT ATTTGTCATTTCCTATAGACTTGCTTTGGTTTGAGATGTTTCCCATCCATGAATTTTTGGGTCATGAATTATGGCTTATTTCCTGTAGAAAAAATTATCT GTGAACAAATTTTATGCAATGTTGCATTCAATTTCATGATTTTTAATGTCTCTATATGTATGGGCTTTTCTTAGATTGTGGGTAATTTGAGTTGTAATGG TGAAAAGTTATTGAGTTGCAGTTAATCTGTTGTGTGCTTATGTAGTTCTTAATTCTTAGGGTATGGTAAGAGCCCTTTGTTAAGATTTTTTTTTATTAAA AAAATCTGAATTTCTTGTTTGGTTGGACTTTTACTAAAAAGATTGATTTTTTCAGCCTCTTACAAAACTGTTTCTACCAAAATTGATTCTAGAGAATCAC TCTTTCGAAACAAAAACAAACGGGGATTATTGAAATCTTAGTTTGACGATCGATAAATGGACTATATAGCAGGATTGCAATATGAGGCCTATGACTTTGT GCAGAATTTGTATCCTGCTTGAGCTATTTAATGTCATTGACTTATAGCTTGTTGAAAGATATGCAAGGTTTAGGTTCTTTTAAGCTTATAATTCTATGGC AGTGGCCAGTATGAGCGTGAGTCAAGATCCAGTTCGTGAGTGGATTCTTTCTGAAGGGCAAGCTACAAAGATAACCAAAATTAGTCCTGTTGGTGGTGGT TGTATCAATCTCGCTAGTCGCTATGACACCGATGCTGGTTCTTTTTTTGTGAAAACAAACAGAAGTATTGGACCGTCCATGTTTGAAGCAGAGGCTATCG GTTTAGAAGCTATGTATGAAACTGGGACCATTCGTGTGCCTAAGCCACATAAGGAAATTGTAGGTTGGACCGCTACCTACGGGTGGTTCATTCATTGTTA TGGAATTCATAGAATTTGGTGCATCTAGAGGCAATCAGGTCAGTTACCTAGAACTAACTGCTAATTAGGAAAGCTTTTGAAGCTTAATTGTAATTTATTG TTCCCAGTCTGCTCTAGGGAGGAAGCTTGGTGAAATGCATAAAGCCGGAAAATCTAGTAAAGGATATGGTTTCGATGTTAATAACACCATTGGCAGCACT CCGCAAATAAACACTTGGTCATCAGATTGGATTCAATTTTATGGAGAGTGTAGATTGGGTTACCAGTTAAAGCTTGCATTAGATCAGTATGGTGACAAAA CCATTTACGAAAAGGGACAGAGACTAGTTAAAAGCATGGGGCCCCTTTTTGACAATGTAGTAATAGAACCATGCTTACTACATGGAGACCTTTGGAGTGG AAACATCAGCTCTGACAAAAATGGAGAGCCTGTCATACTGGACCCTGCATGTTACTATGGACACAGTGAAGCAGAATTTGGAATGTCTTGGTGTGCAGGC TTTGGAGGATCATTCTATAATTCTTATTTTGAGGCATGTAGTTCTTATCTCTCTCTCTTCCGGATTTCCTTTCTCTTTTTGTTGTTTGTTTCAAATTAAA GGAAAGTTTTGCCTGAGAGTTTATCGGTGCATTCTATTTCTTCCCCCTTTTACTCTTAGAATCTTGGTTGAATATGGCATCTGTGAGTTAGATAATATTT GAGGATTTATCATCTATATTTGTTTGTGTAAGATCAAATTGCATGAAACCAAATAAACAATAATTCCAAAAGTCATTGGGTCCATCCAATTTGCATTACA TCAATATATAGAACTATCAAAACAGCAAGATGGTTTTCATCAACAATGTGACTACTTGCTTAGCTTCTCAGTATACTTCTTAAAATAGCTTATAATAGAT TTACTTGCCGTGTTTCAACGAAACCAATCGTGCCAACGGCTGGCATGTCAAATGTCAGTTTCACACATTAATATTGTTACGTTCATAATTGCATATGATT TTTCCAGGTGATACCTAAACAGCCAGGCTTTGAGCAGAGGAGAGACCTTTATATGCTGTATCACTATTTAAATCATTATAATCTCTTTGGTTCCGGATAC CGGTCATCATCGATGTCTATAATTGATGACTATCTGGCAATTTTAAAAGCTTAGGATTGTAAGCATAATTGGCAAGCATGCTTGAAAGAGGTTCTCTTCT TGAACATTTCACTACTTTCATTTCCCTGCTCAGCTCTCAATGAATTGAAGATATAATTCATTCCAATGCAAAGTCAATTAGTTTTGTTTGAAAGTTAGAC TAGACTATGTTTTACCCTATATATATAAGAGTCAAATTTAATACAATCATGCAAGATAAGTCATCAAGACATGAAACATGTTATATATCTCAAATAGGCA TTGTCATGTTATATATCAAGACATGGTTCACACTTCAAGTTAGAGGTGCACCATGGCAGGAATCCTGCTATGCTAGTTAGACTTGTAGTGATGTATGATT TTAGGCTTTAATAATTTAAGCTTCTGTCATCATTCATGTATTTATAGTGTTTTTCTTCTAGTATTGAAATGACTACAAATTTTGATATTCACCTTAATCT TGTTATTTGAAGTGCTTTTCTTCTAGTGTTTAAGACTTCTTATTTTGGGGTGTACTATTGATATCCATGGGAAATGTAAGAAAAATTAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_139809;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_426488

FPKM

• PAB: 0.5
• PNAB: 0
• PS1: 0.3
• PS2: 0.4
• PS3: 1.2
• PW1: 0.5
• PW2: 0.5
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_426488

• Blastp: Protein-ribulosamine 3-kinase, chloroplastic from Arabidopsis with 73.51% of identity
• Blastx: Protein-ribulosamine 3-kinase, chloroplastic from Arabidopsis with 69.63% of identity
• Eggnog: Fructosamine(COG3001)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G61080)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_017442285.1)
• Pfam: Fructosamine kinase (PF03881.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;