Id Trinity | TRINITY_DN45513_c0_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_426558 |
Sequence | AAGCAATTTAATACTTACGCGTGGTGGTTAACTAACCCAAATTAATGATCCATCCAAAACAACACAGTTTTAGATACCATTATTATTATTATTACATGTC TTAGGATCCCCTTTTCCCATTTCTCTGCTTCTTGAACTCATCTATAAGCTTTCTCCCCACACACACAAAACATGATATGAGGTTCTAAGAAACAACCACT TTGTCTTTTTTACAAGAAAGAAAAGAGAAGACATCAAAACCAAACATCAAAGAAAATACTTGAAAACAAAGCAAAGCAAAGAAAAGGGTAGTGGTATTGT ATTGTTGGGGGTGGTTATGGAGAGTTATCTAAATGAGAATTTTGGAGGAGTTAAGGCTAAGAACTCATCTGAAGAGGCTCTTCAAAGATGGAGGAAACTA TGTGGGCTTGTCAAGAACCCCAAAAGACGCTTTCGTTTCACTGCCAATCTTTCCAAAAGGGAAGAAGCTGCTGCTATGCGTCGAACCAATCAGGTACCCA TTCTAAGCTTTTTCCCTTTAATTTCAACATGTTTTGACGCTTCAATGAAATTTTAGATAATGGGTATACTTGACACACACAAAAGATAAGGGCTTTTCTT CCTACTCGCATGTCAGAAACACTATGAGACTAATGAGAGTCACAGATTTAACAGATTAACCATGTTCTTTGTATCTCATGTCTCTAAAGAGTAACTAAAA AATGGTTCTTGCCATATGGGTATCTTGGTTATGGTTAAGGAATCGTTAAAATTTCTTGATGCTGAATTCTTGTTTTTCTATACCGCCCTTGACTTCGTTT TTAACACACCAACCAAATAAATAAATGAATGAATGAATGTGATAGGACATATTTCTGTTTCTATTTCTATTTGTTTCATAATGTTTTGGAGACATTTTGT 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TTATTGGTTGGATTTCTAGGCATGCCTATTGCTGCACAATTAAAGAAGATCCCAGTTTGAAGCACTTTAACGGGCAACTTTTATCTCGAAAAACAATTGG TTTGTTAACTTAGCTGTTATGGTGCTTTGAGGTCCTTTATTTCTATAGTTTCAGTAATTCTGGTATTGCTGGAGGCTTTTTTGGGTTATAATCAGAAATG GCGCAGATAACTGATAATTTGCAGTCTCCTAAGCAGTTATCGACAAGCCTTTAACCAATTTATTTATTAGTTTATTTTCAAGGCCTGTAGAATGATGGAT GAAAGTAGAAACCTGATTTGGTTGCTGTAGACAATGGTGACTCTTTTAATGTCATTGGTTGAAAATGGTTGTACATCAGTGCTGTCAAACGTTCTACCTT ATTTCAATTTAGCACTGACATGTTCAACAGAAAAATGGTTAACAAATTCCGCCATCCATCAAGAGCTTCAAATCTTCGATGCTCTTGTCTTCGAAAACAG AGCGAATGCCTCTGAAGCATGTACGCTCTACACATCTAATACAATATCTACTGAATGGTCATGTGATATTATTAAGGAGTATTACATAATTTTCCAACTT CCACATTCTTCATAGAAAGACTCAATCGAAGAAGAAAAAACCAAATCCGATTCAAACATGATTAAACTATCAAGCAGCAATTGAACAAAGATGCAACTTG AGACAATTAATTAATGTCTCTTCCCTAAAGCTAGTTTTGTCCACAATTCATATGTCACGCAAATGAGACAACTAATTAATGTCCAATCCAGAGAAAGAAA CGAAAATAAGACAATAACGTTTTTCTTATGACATACATAAGAGCAAATAAGACAATAATGTTTGTGGTCCAACTACAATGAACATATCTCTGCAACCCAT TCCTTGACAATTATGTAAATGGAAAAAACATTTAGACATTTAAACCTTATGACATCAAATGTGATTGATAATTGATAGGATTTATTATACACATTGTTAA ACGATTCTGTAGTTATCTATTGAAAAAATGTGAACACTGTAACAAGAGTAAATGTACTTGTTTGTCAAATGTATATTTTTCAACATGCAACGATTTATTA GTGGGTGAACCTTTTCACTCATGATGTAGTTGTAAATTATTCAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_139822; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_426558
Blastp | Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type from Arabidopsis with 83.99% of identity |
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Blastx | Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type from Arabidopsis with 82.24% of identity |
Eggnog | ATPase, Ca transporting, plasma membrane(ENOG410XNNC) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G37640) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019444917.1) |
Pfam | E1-E2 ATPase (PF00122.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |