Ll_transcript_426439

• Id Trinity: TRINITY_DN45545_c0_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_426439
• Sequence: GTTCGTTTTGAAGGACACGTGGTAAACAAAATTGTGGCTGAAATCCACATGAAATTAAACGACAAACCACGAAGAAACAACCAAGAAAAAGGACACAAAA TGCACACTTAGGTTTGGAAGTTTGATTAGATAATTGTTGTGAGACTCTTTTGAGCCACCTGCCCCTTTCTTATTCTTCATCCCCATCAAAGGAAGCTAAG ATTATCAAAGTCGATTTTCACCACTTCATCTGTATAGACGATATTGAATTGTGTTCAAGTCTGCAATAGTATAAAATATTGTTTCTACACGTCCTTCGGC TGCTTGTGAGACCCCTTGGCTATCCATTTGGATACTATGATGGCTCTTCCCGGCTCTTTGCAGATGTCCCATGGACTGGGACTTTGCTATAATATGGGCT GCAATAAACACCCGGGGGCAACAGGAAGAGGAAAGATATATTTATTGAGTGCAGGTCCTTCATATCCTGTTTCGTTCATGAAACAGGGTTGCTGGGGTTT CCAACACTTCCATCAAATAGGCAGGCCGACACGTACATTATCTTATAAATCTCGCTCTTTTAGGTGCCATTCTTTTTTAGTGCCAGGCCAACCAAGTGAG CTACCTGTTGTCAAGGTGGCTGCTACCATGTTGGTGAGGTCCTATAATACGCTACAAAGCAGTCCTGTCGTAGTAAAGTTGATTCCTGCAGTTGGTATTA TCATTTTTGCACTGTGGGGTTTAGGCCCATTTATGTGTCAGACAAGGAAACTTTTTTTTCAGAGGAGTGATAATGGTTGGAAGAAGAGTACCACACATTA TATAGTAACTTCTTACATTCGGCCATTACTGTTATGGACTGGAGCAATACTTATTTGCAGAGCATTGGAGCCAGTAGTTCTACCTACAGAAACTGGCCAG GTTGTTAAGGAAAGGCTTTTGCACTTTGTAAGATCATTGTCAACTGTACTGGCCTTCGCCTATTGTTTATCAAGGTAAGCCTATTTCCTTGCCTTCACAT GATCTCTAGAAACTGGTCAGGGTGTTGGTCTCTTGAGTTAATGATGCACTTAATAACCTCCATTTGAAATAATTTGTGCTTAAACTCTTGGTTTTTCTTC CTTTTTTATTAGAGAATTCAACTATCATCACAAACTGTGATTCCTTGAATATTTAGTTTCACTTTTTCTTATATTCTTTATTGGACCCTTCACCTGTATT TTTTATGAAACAACATTTTTGTAGCTAGCTTGAGTACTTCAATCTGATTTTTAATTCCTTACAGTGATTACTAAGTTTTACTTCCATATGTGCAATACTC TTCTGCAGTGTGATTCAACAAGCACAGAAATTCTTAATGGATAACACTGATGCAAGTGAGACAAGAAATGTATGTATGTTTTCTTTATGTAACGGAAACT AACATTCTCTTCAAAAAAAGAAACTACTGTTATAGTCTAGTTTGAAGTTCAAACATGAAAAATATACTATCAATTCCATTTATTACCCTTCCACTGTCAT AAATTTAATTGCTAGAATGTCTCAGTTAAAGTTTGATATTCGGACCAATTAGCTGGCAATATTGGGCAAAATGGCCAAGTAGATGGTGTGTAATTTTTCA GCTTTTGGATAACAATTTCTCCTTATCAATCTACTAGGTCAATTTTTATTTGCAGGAAATCTTTTGAACTGGTAGTACTTGAGTACACGAGGGCTATATA ATTTGCATGTTTATTGGCTAAAGGCATTCATTATGGTCGTGCATGTATTTATATAATACTCATTTATGGAAGACACATAGCTTGGCAACTGCAATGTAGT GAAGAGAATACTTGTAAAATCCTGGATTCAGTATAATGACTGGTTTTACTTGTGGTTCAAATTTGAAGATATAATAAATTGTCTGTGTTTTATTTCCAGA TGGGATTCCAATTTGCAGGCAAAGCTGTTTACTCTGCAGTATGGATTGCTGCTTTTTCACTGTTCATGGAATTGCTGGGCTTCTCTACCCAGAAATGGGT GACTGCAGGAGGTCTTGGGACAGTTCTGTTGACTCTCGCTGGTCGTGAGATATTTACAAATTTCCTTTCGAGTGCGATGATTCATGCAACTCGACCTTTT GTGGTTAATGAATGGATTCAAACAAAGATCGAAGGATATGAGGTTTCCGGTACTGTTGAGGTGTGTTAAATTGCACATTTTAACTATCTAATTTAGAATT ATATATTAAATGTGTACAGTGTAGTTTTTATATACATAATAACTTAACAGAAAGAAATTACAGAATTTGGTGTAGTGCTTTTGATATCTGAGGCTTTGAT GTTTTCTTGCTATGCAGCATGTTGGGTGGTGGTCACCAACAATTATAAGAGGTGAAGACCGTGAAGCTATCCATATTCCAAACCACAAATTTACAGTTAA TGTTGTACGAAACCTCAGCCAGAAAACACATTGGCGGGTCAAAACCCACTTAGCCATTAGTCATTTGGATGTAAATAAGATTAATGTGAGTAGTAGTGTT GTTCTTTATATTTAACTGGCTTTTCACGATAGTTCTGCCTTTTAGATAATTTTCCCTGTAACAGTTGGTTTGGTGCTTCTGCAGAACATAGTTGCTGACA TGCGGAAAGTATTATCCAAAAATCCTCAAGTTGAGCAGCAGAGGTTGCATAGGAGAGTATTTTTGGAAAACATAAATCCTGAAAATCAGGCTCTTTTGGT TAGTATTAAATGGCTAGAATATCGTGCAATTCAATGATTCTGTGATTGTTGACAGGGATCTTAAATGAGATTTTATTCTTTGTTCCTCTTTTCTTTAAGT AGATCCTTGTGCCGTAAACAAGATAGAGGCAAGCATATTATGTATTAGTCTATGCTTGCATATATTTATATATAAGGTGTAATGTTTTTTCTATTATTTT CACAGATTCTGGTGTCTTGTTTTGTCA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_139943;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_426439

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0.5
• PW2: 0.2
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_426439

• Blastp: Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 48.58% of identity
• Blastx: Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 48.58% of identity
• Eggnog: Mechanosensitive ion channel(COG0668)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G10490)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421403.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;