Id Trinity | TRINITY_DN45545_c0_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_426441 |
Sequence | GTTCGTTTTGAAGGACACGTGGTAAACAAAATTGTGGCTGAAATCCACATGAAATTAAACGACAAACCACGAAGAAACAACCAAGAAAAAGGACACAAAA TGCACACTTAGGTTTGGAAGTTTGATTAGATAATTGTTGTGAGACTCTTTTGAGCCACCTGCCCCTTTCTTATTCTTCATCCCCATCAAAGGTTGTTTTG AACTTTTGATGCTAAGTTAGATGGCACTGCAAGGGAAACAATAAAAATGGAATTTTGAGTATTGAATAGGTTGATTCATGATGATTTTGTTTCAGTTTAG CTATTAACACAACAGTAGTTGATTTGTGCCGAAAACTTCTACACACAATCTTCCACCAGATGTTTAGACATAATCAGATATGCAGGTTTATATTATATGT GTTGTGATCAGATTTCGGTCATTCGGGAGTCTGGAGATATACAATTTTTCCACCCTTCTAGAATTAAGGCCCATAAAGAAAAACTAAAAATGTACATATT TGATATCCTAACCTTTGACGCTTTCATAATTATTATCAGTTTAACCGCAGGAAGCTAAGATTATCAAAGTCGATTTTCACCACTTCATCTGTATAGACGA TATTGAATTGTGTTCAAGTCTGCAATAGTATAAAATATTGTTTCTACACGTCCTTCGGCTGCTTGTGAGACCCCTTGGCTATCCATTTGGATACTATGAT GGCTCTTCCCGGCTCTTTGCAGATGTCCCATGGACTGGGACTTTGCTATAATATGGGCTGCAATAAACACCCGGGGGCAACAGGAAGAGGAAAGATATAT TTATTGAGTGCAGGTCCTTCATATCCTGTTTCGTTCATGAAACAGGGTTGCTGGGGTTTCCAACACTTCCATCAAATAGGCAGGCCGACACGTACATTAT CTTATAAATCTCGCTCTTTTAGGTGCCATTCTTTTTTAGTGCCAGGCCAACCAAGTGAGCTACCTGTTGTCAAGGTGGCTGCTACCATGTTGGTGAGGTC CTATAATACGCTACAAAGCAGTCCTGTCGTAGTAAAGTTGATTCCTGCAGTTGGTATTATCATTTTTGCACTGTGGGGTTTAGGCCCATTTATGTGTCAG ACAAGGAAACTTTTTTTTCAGAGGAGTGATAATGGTTGGAAGAAGAGTACCACACATTATATAGTAACTTCTTACATTCGGCCATTACTGTTATGGACTG GAGCAATACTTATTTGCAGAGCATTGGAGCCAGTAGTTCTACCTACAGAAACTGGCCAGGTTGTTAAGGAAAGGCTTTTGCACTTTGTAAGATCATTGTC AACTGTACTGGCCTTCGCCTATTGTTTATCAAGGTAAGCCTATTTCCTTGCCTTCACATGATCTCTAGAAACTGGTCAGGGTGTTGGTCTCTTGAGTTAA TGATGCACTTAATAACCTCCATTTGAAATAATTTGTGCTTAAACTCTTGGTTTTTCTTCCTTTTTTATTAGAGAATTCAACTATCATCACAAACTGTGAT TCCTTGAATATTTAGTTTCACTTTTTCTTATATTCTTTATTGGACCCTTCACCTGTATTTTTTATGAAACAACATTTTTGTAGCTAGCTTGAGTACTTCA ATCTGATTTTTAATTCCTTACAGTGATTACTAAGTTTTACTTCCATATGTGCAATACTCTTCTGCAGTGTGATTCAACAAGCACAGAAATTCTTAATGGA TAACACTGATGCAAGTGAGACAAGAAATGTATGTATGTTTTCTTTATGTAACGGAAACTAACATTCTCTTCAAAAAAAGAAACTACTGTTATAGTCTAGT TTGAAGTTCAAACATGAAAAATATACTATCAATTCCATTTATTACCCTTCCACTGTCATAAATTTAATTGCTAGAATGTCTCAGTTAAAGTTTGATATTC GGACCAATTAGCTGGCAATATTGGGCAAAATGGCCAAGTAGATGGTGTGTAATTTTTCAGCTTTTGGATAACAATTTCTCCTTATCAATCTACTAGGTCA ATTTTTATTTGCAGGAAATCTTTTGAACTGGTAGTACTTGAGTACACGAGGGCTATATAATTTGCATGTTTATTGGCTAAAGGCATTCATTATGGTCGTG CATGTATTTATATAATACTCATTTATGGAAGACACATAGCTTGGCAACTGCAATGTAGTGAAGAGAATACTTGTAAAATCCTGGATTCAGTATAATGACT GGTTTTACTTGTGGTTCAAATTTGAAGATATAATAAATTGTCTGTGTTTTATTTCCAGATGGGATTCCAATTTGCAGGCAAAGCTGTTTACTCTGCAGTA TGGATTGCTGCTTTTTCACTGTTCATGGAATTGCTGGGCTTCTCTACCCAGAAATGGGTGACTGCAGGAGGTCTTGGGACAGTTCTGTTGACTCTCGCTG GTCGTGAGATATTTACAAATTTCCTTTCGAGTGCGATGATTCATGCAACTCGACCTTTTGTGGTTAATGAATGGATTCAAACAAAGATCGAAGGATATGA GGTTTCCGGTACTGTTGAGCATGTTGGGTGGTGGTCACCAACAATTATAAGAGGTGAAGACCGTGAAGCTATCCATATTCCAAACCACAAATTTACAGTT AATGTTGTACGAAACCTCAGCCAGAAAACACATTGGCGGGTCAAAACCCACTTAGCCATTAGTCATTTGGATGTAAATAAGATTAATAACATAGTTGCTG ACATGCGGAAAGTATTATCCAAAAATCCTCAAGTTGAGCAGCAGAGGTTGCATAGGAGAGTATTTTTGGAAAACATAAATCCTGAAAATCAGGCTCTTTT GGTTAGTATTAAATGGCTAGAATATCGTGCAATTCAATGATTCTGTGATTGTTGACAGGGATCTTAAATGAGATTTTATTCTTTGTTCCTCTTTTCTTTA AGTAGATCCTTGTGCCGTAAACAAGATAGAGGCAAGCATATTATGTATTAGTCTATGCTTGCATATATTTATATATAAGGTGTAATGTTTTTTCTATTAT TTTCACAGATTCTGGTGTCTTGTTTTGTCAAGACCTCACATATTGAAGAATATTTGTGTGTTAAGGTAAGAATACTTCCTTATTCATCTACAAGATGCCA TGTCATGTGATGCTGCCCTCACACAGTCATAATTCAAAACTGAGAAATAGAGCTTTGTAAACTAGTGCTAGAATTCTGTCAATTAAATAAAGCAAGAACT TCTTGTGCGAAGCTCTTTCAGAAGTTAAAAAATTCATCATAAATATATTTGAGTAGAAGCTCATGAATAATTCCCCTTCCGTGTCCATTGTGTTGAGGCA TGCAATCAACTTTTTTAATCTTATATTCTTGCTTGCTTAGTCTTTTGTATGCTTTAAGTCTATGTTTTAGTTTGTGATATTTCAGCAGTGGATCAATTTT GAAAATAAAATAAAAGATCCTAGGTACTTTGTATTTTGATGATGCAGCTGAATTATCCTAATTTTTGTTAGTGGATTATATTCTTTTAGAAACTTGTTTC GTGTATATGAGACTCCATTTATGTTTATGCATTTGATTGGCTGTGAGATAAATATTTCATAAGCTGATTCTTGTTCTGTAGAATGTCCTCATATTTTAGT GATATTGCTCAATAATCATTAAGCTGATTTTCCATGCATTGATTCTGAAAATTAGGAGGCTATACTATTGGATCTTCTCAGAGTTATTGGACATCATGGA GCCCGACTTGCAACACCAATTCGTACCTTGCAGAAAACATACCGTGGTGCTGCTGACTTGGAGAACATACCATTTGCAGATTCCACATTCAGTGGTAATG GACCAGTATCTAACCGGCCATTATTAATGATTGAATCCGCTTACAAGATCAGTGCAGATGATAAGATGAAAAGTCGGTCAGCACGCCCAGCTGGTGACCA AGATAACAAAACAACTGTTCGAACCAAACCTGACAGCAAGACAGACACCAAGGTTAGTGACTCTGAGGTGGGCATGCCAGAAGAAATGTCCTTCTCTCAG AAAGACATCAATGTCAAACAATCTAAGAGTCAGACAACTAACAATGTCAATCCAAACATTGACACTAACAACATCGTTTCCTCGTCGTTGACGAGCACTG ATGACGGTGGACTTCCTACGATCATGTCAACAAAACAACAAGGGGAAAAGAAACCAGCTTCACAGTCTCATGCTTCCAACAGGCCTGTTCTTGAAGAGAA TATAGTGCTAGGTGTTGCATTGGATGGATCAAAGAGGACCCTTCCTATTGATGAAGGGATTGATAATGCTGCTACAACTCGCGAGGCAAAGGAAATGGCT GCATGTCAAGGTGGAAATGGATCTCCAAAGGGTACAGATGGGAATGACAAGATTGCAATTGCTCCAACCTCAAAGTGATGTTGTAATCACTAACGAGTGA GTTTAATTAGTTAGTAATTTGAAGGTTGTGTTCCAGAATCCACACCCATGATGTTGTATATATTATAACTTCCTTTGTCATACACCATTCATTACGCCCT TCTTACAACCATATTGTTTCATTAATTTGGTTGTGTTCATTATAACTTCCTTTGTCATACATTTTATTAAGTATTTATGTTCCCTATTCATTAAATGAGT TCATTTTCTGTCAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_139943; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_426441
Blastp | Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 38.76% of identity |
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Blastx | Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic from Arabidopsis with 90.76% of identity |
Eggnog | Mechanosensitive ion channel(COG0668) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G10490) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421403.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |