Ll_transcript_277009

• Id Trinity: TRINITY_DN45717_c3_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_277009
• Sequence: CCCAGAGGCATAATTCAATAGAACACAAGTCAACGATTCCTATGTTCCTGATGCCGTTTAATTTTGTCTGTTTTTTTTTAGATTTTGAAGTTCTTGTTGA AGCTTTAATCTTTATTAGAGCTTCAACTATATCTCCTTCAACTTCCACTAAAGCTTGAATTTTTCGATTCTCCATTGCATTTCAACTCCTGGGTCATTTT TTGTTCACCAAAAAATGTTATAAAAGGAAATCAGATAAAGGGCTTGCTCAAAAATGTTGATTTCTGTTTGGATGATTATGGAAGTGAACAAAGTGAAAGC ACATGAGTGAAGTTTGGAACTTCTTTGTTTTGGGACTAACCCCTTTTGTTTAATTCAGATGTTGTTTTCTGGTAATATGGATGATGGTGAGTGCTATAGT GATAATGGTAAGGAAAATGAGAGTCTTGGTGACCATATACTTGAGGAAATGGAGTCGATTTGGATAGACATTGATCGGAGGTTGGTAATCTCTAGGATGG TTAGTGATTCTGTCATAAAGGGCATGGTTAATGCTGTTGAGGAACAAGCAGCTGAGAGAATTGCTCAGAAAGAATTGGAGGTTGTCGGGCTAAAGAAAAT GCTACGTAGTTTTGAAGAGGGTTCGGATGAAACTAAAACACTGAGGTCTTCGGTAACTAATCGTGGATCGCATGAGGCTGCTACACATCATATTTCAGAT AGTGTTTTAGAGCATGGTGGACATGTAGGGTCTGATAGTCCAGAAGTTGCTGCCAAGGAGCAGTTAAAGCAGCTCAAGAAAGCGATAAATAAAATAAGAG GGTCTGGTTCCATCAAAAGAATTAGTTCAGGTTCTGACTTGGTGGGTTTAGATGGTATTCTGCAAGAGAATGTACCGGAAAGATGGATATATGTCGATAA ATCTTTTGAAAGTCTATCTGACACTCTAGACACTTTGTGCAGAAGGGTAGAAGTTGTGGATCAGTCGTCGATGGCATCACTTTATCACGAGGAACTGGAG TTTCGATCAGAAATTGAACGCATGGTGATTAGCAATTGTATCTGGAGTTTGCAGCAGGCGTTTGAACAGAAACTATGGGAGATTTATGATTCTGAAAGTA GAAATTGTTTTGACCAACACAAAGAGATCTCAAGTATGCGTCAGCAATTGGATTCAATATTTAAAGCACTCTCTGTTTCTGAGACCGGGCTGCTTACTTC TCATGGATCCTTGGAAAATGGCGAGGAATGGTGCCATAGTAAAAGGGCTGACCATTTCCACTGCAAGCTTCCAATGACTATTTCATTGCCTTCAACTTTG GAAGAAAATGGCAAACATGAAAACTCGAAGAATAGCAAGCATGAGAATGTGGATCCTTCCTTACTAAAGCACATGTCTAGAGATGAATTGATTACCTATT TTAATTCTGAGATAACCAAAATGAGAAGAAACCATGAATCTCAAGTGCAAGAGGTGACTGAAGAAAATTTCCGCCTTAGAAGGGAAGTATTGAATTTGAA AGAAAGAGGTTCTCATTCGCCAATGAAGAAGGACAAAGACTTTGATTTATTGAGGAAAAAAATCTCTGATGCCATCTCAAAGTTGGATAAAATCCTTGTT GGAAATGAGAAAGTGCATTGGTTCACTGAAAATATTGAATCTCTTGGTAGTTTAAAGGATAGATTGGATTTCTTACTCTCTGAGAATCATCAACTGAAGG ACACCCTAACGGAAAAGAAAAAGGAAATTAAGAGTCTTTCCTCTCAGCTTTCCGTTGCTGTGGAGAACTTGTCGCTGCAACAACTGACTGAGAAAAAAAT GTTACAAACTATTCAGAAGCTTGAGGATAATATAGGGGTTGCACATGCTGAAGTTCCAGTTATTCAAGATGTGTATGAATGCCTCTTTGAAGATATTGCG AGTGAATTCAGATGCATTACGGAAGAATTACATCTGAAGAACAGTATCATGGAAGAAATCTATGAAATAATTTTGAAAGATGCTGCTCACAGTCCTCAAG CTTCTCGCGAGTTGGAAATCGAGGAAGCAGATATGGAGGCATCTATGATGCAAGAACTATTGGATATTAATCAAATTATATTTAAAGAAGCTTTGGTGGA TGTGAACAAAGCATTAAAATCGGAAGCTGCTAAGAAGGAGGAACTAAAACAAGAAATGCTTATCTTGACATCAATGGTAGAAGCAAGAGAGAAGTTAGCC CAAGAAGCAGCAGATGCATTGGTACAAGAGAAGCAAAAGATGCAGTTGGCCTCTGTACAGGTTAACAGTTTCCGAACTCATACACTTCAGCAACAGACAT TACTTACCGAAACCAATGAAGAGTTAGATGCCACTAAGGGTGACCTGGTTGCAGCATTGAAGGAGATTGAACAACGCAAGGAGCAAATGCATAAGTTACA TCAAAATCTTGAACAAAAAGTGAACGAGCTTAGAGAAATTGATGACGAAAGAAGGGTGCTTTGTTCTGTTACACAAAAGCAACAAGATGCATTAACACTG GTTGAGGCAAAAGAAAAGGAGACCAGGAATCAAATGGAATCAACTGTCGATCTCATCGATAAATTGTTGACAATGGTTACAGATTTTGAAGCTAGAGTAA ATGGAGATTTTTCAAAAAATTGTTTGAGGCTTGAAAACATGAAATCTGAGTTCCGTTACATCAATAACAAAGCCAGTATACTTAAAACCACTGGATTGGT GTACAAGCAAATGCTAGAAACAAGATGTTCTGATCTTGCAACGGCTGAAGAAGAGGTTGATCTTTTGGGGGATGAGGTAGATACTCTTCTTAACCTGCTT GAAAAAATCTACATTGCACTTAATCATTATTCGCCCATTTTGCAGCATTACCCCGGGGTAAGAATCTTCTCCCTTTTTGCTCATATTTTTTATGTTTGTA CAATGTTGAAGTTTGCATGATGCCAATAGATGTGATATTCCTATGAAGACTCTTATTATTTGCAGACTATTTTTTCCTTATGAATGTGCAGTTATTTTAG GGTTTAGGGATATTGAAAGCACCTATTCCTTTATTTGTATTGAGGCAATGTACTAGACCTAAAACTGCAGATAGAAAAATTTGAAAATCTTAGGCAAATA TTTTACGAGCTTAATAAATTATTTTTTATATCCTATTTACGGTCGCTTGAACTTTTGCTCATTGGCATTGCTTGGTTTTTTCAATGAACAACACTTCTAA GTTGTAATTTCTGCCAACCTCGATAGTATTGATTTTCTTATCATATTTGAATGAGAAAGACAGTAAAGACAGTTGCACTGTGAAGGAAAAGAGAAGGACA CAACCAAGGAATTTAGTGCACACCGGGAGAGAAGTTGATGGAGATTAACAAAGTAGGAACGTGCTCCATTCGGAAAACTAGGTTCATTCTTATTAGCAAT TGAATATTGATAGTTCGGTACCATGTAGAAAGATACAGAAGGTGTAGAATCTACATAGAGCCCGAGTTTTGAGAATACATTGTGATGTCTTTTATATTTA GTGGTCACAATTGCCACACAAGAAAAAGGTATAACTTTCTCATGTAGTGTGTGTATATATAATATAACTTCGTACATTTTTCGGAATAATGCCAAGTTTA ATTTGTCTACACTTCATGAAAAGAAAAGGGGTAAAAAACCGAGAATTTTGTGGGGAAGGTGAAGTGTATACAAATTTAAAATTGGTAAATAGTTGTCATT TGCAAAAAATTCGTCGGGGATATATTAGGAATAAAAAAGTTAAATCTCCTTCAATGGACTTGAAGTATGAAATCCAAATCCCACTTTCCTTGTAAGGAAT GAGATATCGTGCTCCATTCGTTGTTATGTAGAACGTGACTGGGAATGGGAGGCTTTTTTGTGGTTAACAAACGTGGGAACACAGGAATAGGATTTGTACA ACCTATTAGTGTAAAAGTAAGATAGTAGTGAAACTACAACTATGTACAGCGAGTGGCGATTAGATTCAGTTGAATTATATCCCTTTACGTTCCTTTGAAT TTACACTTCAACGGAATCTAATGGACACTAAAAACAGTAAAAGCGTCCACTTTGAGCTTCAACTGTATCTGTAGCTATGAATCAGACACAATCCCTTGTG TGTGTATTCTTTTATGTCCTTTTTTGTTTCTTTCGTAAATTTCTCAATTGTGTTTTGAACATCAACTAATGCTTAATGCAAGGTACATATTTAAGTCATA GGTTTCTCTCACAGACGCATAGAAGATGACAGAGGTTTAACCTTTGATTTATTTGTTACCGAAGCAATGATTTTTTATATTTGCTTCTTTGGTTTCTTAA TCTTTCTTTGTGAGATCAAGTTGTATGAAAATTCTTAGCTATTGTTCTCCATAAATATGAGGAAGATATCATTTTTTTAGTATGAGGAAGTTATCGTAGG AGGTTGGTCTTGCCCGACAAATGATTCAATGTGTGTTTGGTTTTGCGGTGAGAAGGCCTCAAATCACGTTCGGCAAAAGCTACAGCTAGTTTGCATTCCC TGGAATGTCGAAACAAACACACGCCAAATATAGCTACTAACTAAATTTAATTGATAGTAGTGGTCATTGCTAATACAAAGTTTTGTGCCTCACACAAAGG GATACAAAAATAAATAAATAAGCTAACAAACCTGATTCAATTTTAATTATACTCAGAAGGTATGAAATGACAGAAATACATTCTTAAAGTTCCGATTCAT ATAGATTTATAGAGCCGGCCATATTTTTGAAATTCGTGGGCAAGATACGCCTCGTAGTATAACACCTGCATCAGAAATGTAAGAATGATATCATATATAT ATGGAGAACAAAGGACTAAAACTTTCTGTATAACTTGTCTGATCTCACAGGGACAGATTAAGTAACAAACACAAAGTCAAAGGTTAAAAATATGTGTCTT GCGTTAAGATGCATTTGATTTTCAAAATGAAATTGAATGCCCTTACTGAAATTTGGAAAAAAGAAATATACGAATGACGCACACAAGGGCTTGAGTCTGA TTAGATTGAAGTTCGAAATGGAGAATTTTACTGTTTTTAGTGCCGATTAGATTCGGTTGAAGTATGACTAGATAGAAACATAAGGGGATACAAATTTCTT TACAACTTATATGTATATAAAGTAAGTTGCGCTTTTCGTGATGAATATTAATTAAGATTATTTGATATTCATGTATAAAATAGTGTGTTGATTGATCTGC ATAAGTTTCAATATGAAATTGTTTCCATAATTAGCCATTGATTTTGCAGGTGGTTGAGACTCTGGAGCTTATAAGAAGAAAAGTAAATGAAGAGTCTCGA AAAGTTGTTAGTCATTTTATCTGACCAGGTTGTAATGGATACAGGTGACAAAGTTGTACATTTTTGTTCACAAAAGTTGCACACAAGTAGGAGCTAGCTG ATTGTAGCTGCTGGATTTTTGATCCCTTAAAACATATATTTTGTGGAACACAGCTATTAGAAAAGAATGCAACAATTTAAGAAGTAGCCAACACCACACT TTTGTTTTTGCCATAAACCAATGATTTATGTTCATTTAGTATAATGATATGTTCCCTTTGCTCCTGTAAACCACAAATTAGTATTTTCTCTTTGTGATGC ATAGTTTCTGTTCTGTATGCTTTGGATTAGTAGCATTCTTATATGTTTTTTTTTGTTAGAATAAATCTGTATTGAGTTTCTAGTTTTGTATTATTGACAT AGGTGTATGACAATTTTTTTTTAATTTGTGAACTAGCCATTTCATAATAGTCACCTTGTGTGTCACATGGATCTAAAGGTCTATTTACGAGTTAGTTTTT TTTAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_140439;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_277009

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.3
• PS2: 0.3
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0.2
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_277009

• Blastp: WPP domain-associated protein from Lycopersicon with 41.03% of identity
• Blastx: WPP domain-associated protein from Lycopersicon with 40.63% of identity
• Eggnog: WPP domain-associated(ENOG411240X)
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425667.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;