Ll_transcript_276332

Id TrinityTRINITY_DN45766_c1_g1_i3
Name TranscriptLl_transcript_276332
SequenceCTAATATTTTCTATTAGTAAGCCCAAAAAGCCCAAACGCAACGTTTTATACCTTTATTGCCATTTTCATTCACTATCACTGTCTTTCTTTCCCAGTGTGA GAAAATCCCTAAACTCAACAACCCTCTTCAGTTCTTCAAAGCGAATCAAGCTTCAATCTTTTGTAATAATGAAGGTAGTAGCACTTGTTAGCGGTGGCAA AGATAGCTGCTATGCAATGATGAAGTGTATTCAATATGGCCACCAGATTGTTGCATTGGCGAATTTGTTGCCAGTTGATGATTCTGTGGACGAGCTCGAT AGCTATATGTACCAAACTGTTGGGCATCAAATTATTGTCAGCTATGCTGAATGCATGGGATTGCCATTGTTCAGGAGGCGAATACAAGGATCCACAAGGC ATCAAGAGCTTGGTTACAAAATAACTCAAGGTGATGAGGTTGAAGATATGTTTAATTTGTTATGTGAAGTGAAAAGACAGATTCCCTCGGTTAATGCGGT ATCATCTGGAGCCATTGCGTCTGACTATCAGAGATTGCGGGTGGAAAGTGTTTGTTCAAGGTTAGGCTTTGTTTCTCTGGCATACTTATGGAGACAAGAT CAGTCATTGCTCCTCCAGGAAATGGTAAATTGTGTTTTGCAGAATCATTGATATCATGCACATATGCAATTAAATAGCAAGGTTTTTAACTTTTCCTCAT TGAGAGTGAGCAATGGTGCAACGGTAAAGTTGCTGCCTTATGACATGTATTTCATGGGTTTAAATCCTAGAAATAACCTCTTTGCTTGCTTAGGACTAGG GTAAGGATGCATATATTTACCCTTCCCCAGATCCATCACCGATATGGTGGGATCCTTGTGTAGTAGGCTGCGCTTTTCTGTTCAGATGATTCTAACTCCA TTTTGCTCCTGACCAGATTGCAAATGGAATTGTGGCTATAACTGTAAAGGTATAACTTGTTTAACTTTGTTTGTAATGTTTCTTCCAGTTTTTAGTTTTT CTTTTTGATTTGTAAATGCGAGAGATGTCCTATTTTCTTATCATATAGTTGGTTGGTCTTACTTATCATCCATGCAGAGAGACCTTACTGTTGCTTTGAT AACATTGAGCATTTTTCCTGATATCAATTGACATCTTTCAAAGGTTCCATGATGCTAATGCTATCATGTAATCTAATAAAATTGAGGTTTCTTTTGGCTC TGAATATATATGGTGGTGCGCCACATGAGTAATATGCAGCCAAACATAAGTGTTGTAAAAGTGAAACCATTTCCTCCTACTAAGTAATTTTATGTTCAAC TTGCATCAGATAACTGTTAGTTTGGAATTTTTAATGTTTTATTTATGGTTCAAGGTAGCAGCCATGGGTTTGGATCCTGCAAAGCATTTGGGTAAAGAAT TAGCCTTCTTAAATGCTTATTTGCATAAGTTGAAAGAGTATGTAAAGTTATTCATCCTCCCTTTTTCTTTGTGTGATATCTGTATAATTCCTTCTGAGTT TCAACAATAACACCGTTCTTTGATTTTTCTTTATTTTTGTTTCACCCATTCTGTCTTGTATCACTTTTTGCAGGTTATATGGAATTAATGTTTGTGGTGA AGGAGGAGAATATGAAACATTAACTCTTGATTGCCCTCTATTTACTAATGCTCGCATTGTGCTTGATGAATATGAAGTCGTGAGGCACTCTTCAGATTCC ATAGCCCCGGTTGGAGTCCTTCATCCCTTAGCATTTCATTTGGAAAATAAGGCAGACATCCAGTCTTTAAAATCACAAGACAAAATAAATGAGGTCGGCA CACATAAACCGGGATCTGTGATTGAAGTAATCGATAATCTAGAAAATTTTGATGCCACATGCAAGCCTGTGGATTATAGTGTTGATTCAATTGATGGCTT AGAGCATAAATTTATCATTTCAAGAACAAATAACAGGAGGACATTTTCCTTATGCTGCTGGTTGCAAGATTCATGCAATGGTTTGCAGAAAGATTTGAAG ACTGTTTTGGAGAAAGTCGAGTCACAATTAGCGTCCTTTGGTTTTGGTTGGGAGAATGTTATTTATATTCACCTTTACATTGATGACATGAACAAGTTCT CAGAGGCAAATGAGACATATGTGAGGTTTATAACACAGGAGAAGTGCCCATTTGGTGTCCCATCCCGTAGTACAGTTGAAATGCCTCTAGTAGAAATGGG TTTAAGCAGAGCATACATTGAAGTTCTGATAGCAAACAATAAAGATAAAAAGGTTTTGCATGTGCAGAGTATTTCCTCTTGGGCACCTAGTTGCATTGGG CCATACAGCCAGGCAACCTTGCACGAGGGTATACTTCACATGGCTGGTCAGTTGGGGCTGGACCCTCCTACAATGAATCTTTGCAATGGAGGCCCTACTG TTGAACTGGAACAAGCACTAAGAAACAGTGAAGCAGTGGCAAAGTGCTTTAATTGTTCAATATCAACATCTTCAATTGCTTTTATTGTTTACTGTTCTAA ACATGTCTCATCTTTGGAGAGACTTGATATCCAGGAGAAACAAGAAACAATTTTTAGGCAGAAGAAGATCTCCATTTCACGGGAAAGGCACACGGACAAA GTATTATTAGATCCGATGTTCCTTTATGTCCTTGTTCCTGATCTTCCTAAAAGAGCATACGTAGAAGTAAAGCCTATTCTTTATGTCGAGGATGACACAG ATGTAGCAATTGAGACAAACACAGAAAGATCTTGTTCAAAGGAACCACATTATTGGGGTTTCAAGCAGGAAGATTGGCATGATTCTTGCATTCAGAAATG TGTGGTTCCAGGAAAGATATGTGCCAGTATAGTGTCTATTACAAGGGAGTTGGCTGCAAAGATATGTTTTGATTCCCCTCGTCCTGATTATGTAAATGAT GGTCAATACTCTCTACCTAAGGTGCATATGGAGAAGTTATCGAAGTTCTGCGTCTATCTTCTCGACAAAATTATAAGTGATCACGACTTTTCCTGGGAAG ATATAATGAATTTGCGGTTCTACATCCCGGCAAGCCTTCAACTGACGGTGGAGGAATTGATGCCTATGTTCAGCAATGCACTTCTGGAGCTTGCTGAGAT GAGTCAAAAGAAAGTTATGAATGGTGAGGAGCCAATCTTCAACATAGTTCCTGTCTTAGGTGCTGGGAGGGCTGCTTCATCCATGGATGATGTTGTAACC TGCGAATTACTGGCCCGGAAATCCTGATTATATGCGCTTTATGAACAAACTGGGGTGATTAAGGGGCTCAAGGATAGTTCAGTTGCTGTGTGGTTTTGCA GCTGATGTTAGTTTTTTGTTTTAATGGCAAATGTCATTGCCTTTTCAATTTGTCTATCTTATGGATCAATTATATTTATTTATTAATCGAAGTTACTATT GGTTGATAGAGAATATAAGTAGACATTTGACGGTGCAATCAATACCTTTGCCCTTTATATACATGTTAGAATATTCACAAGATATTTGTGGGAGAGAGTG CTTCATAATAGATTTGAATAAATTGTTATTGTTTTTTGTTAAAAAAAAAAAAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_140671; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_276332

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_276332
BlastpDiphthine--ammonia ligase from Schizosaccharomyces with 33.08% of identity
BlastxDiphthine--ammonia ligase from Danio with 59.12% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (SPBC577.12)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019421815.1)
PfamEndoribonuclease L-PSP (PF01042.20)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;