Ll_transcript_276324

• Id Trinity: TRINITY_DN45773_c0_g2_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_276324
• Sequence: GACATGCAATACTTTTATTTTCCACGGATTACAACTAAAAATTAATATAAATTAAAAGAACAAAAAAAAGTAGTTAACTGAGTGTCCAACGAGGTAGTAG TACATGGTAGTTTGTTGTTGAGATCCAACAAAAAACAAATATGAGGTTTGTGCTAGTTATTGGTGTTGTCTTCCTGATCCACTTTTGGTGTGTTGATGCT GAAGAACCATTATTCTCGTTGGATGGGAAGGTGTTAGTCTTGGACGAATCCAACTTCGAATCTGCCATATCTTCCTTCGATCACATCCTTGTTGATTTTT ACGCTCCTTGGTGTGCTCACTGCAACCGTCTCTCTCCTCAATTGGATGCAGCCGCGCCTGTACTTGCAAACTTAAAGAGCCCCATAGTCATAGCGAAAGT AGATGCTGAGAAGTTTACCAGCCTTGCAAGAAAATATGATGTTGGTGCATATCCAACCATTTTGCTTTTCAATCATGGCGTCCCAACAGAATACCATGGA CCAAGGAAAGCAGAGTTACTAGTTCGTTATCTAAAGAAATTCGCTGCTTCTGATGTTTCAGTTCTTGATTCAGATTCTTCTGTCAGTAAGTTTGTTGAAG AAGCTGGCACTTTTTTCCCCGTATATATTGGTTTTGGGTTGGACAGTTCTGTAATAGAAAAATTAGCCATAAAGTATAAGAAAAGTGCATGGTTTTCTGT GGCAAAGGATTTTTCGGAGGATCTCATGATATTGTATGACTTTGATAAAGTTCCTGCGCTGGTTTCCCTTAATCCAAAATACAACGAGCAAAGCACATTC TATGGCCCCTTTGAAGGTTAGTTTATACGTGGATAATCAAGCGTACATACTTGTTAAATATGACTTACTTGAACTTCTCTTCTCCAGTAGACATTGCTTC ACGCCATTGAGTTTGCTTTGACATAGTCAAGAATATTTGCTGCACATGCTAAATCAACAGTGAAATGATGGTTGATTTTTATATGATAATATTTTCTTTA ACAAGGCACTTTTAAGCTTAATGTGCGGTTATTTGAAGCTGATTTTGATATACATGCTTGATAGACTAGACCAACTTTCCTAAAAGCCTTAGCTATTACA TAGAGGCCCAAAAATGATTTTTATTAATCTAACATACTCGTTCACCTAAGTGAGGAAAAATGGACAATGCACAGGACTGTTCTGATTTTAGCCCTCAGCC GCAGTAGTTCTTTATGAAGGTAAGATTAACCTCTTTTCGGAGCAAAACTCTGTTTTGATTTTACTAGAACTTGGCTAGATTAACATATAATCTTCCACGG GTGCTTAGGTCACCACATACTTTATCCCAAAGTTTGTATTTTTATTTTATTTTTTGATATTTGGAGCATTTCCTTAGTACGACTCACTATCTAGGTTTTT CGTAGAATAAGAAGTGTAAGTCTTTATGGAACTAGGCTCTGCTCTTAATAAAATACATTTAGCTAGACTAGAATTGTGGCAGAACTTGTAGCTATTGGCG GTCTTTTTCTTTGCAGCTTTTATGGGGTAGGAAGATTTTTATGGCTTCCATATATATTTTCACCCTTGATTTCTTTGTATGGCTTTTCCGAAGTATCTTT CTATCGTACGGTATTGGGCATAGGTATGTATCTGAACAGGTATGAAAGACATTATGAAGTTCCTGTATTTCATGATAGGAACTAATGTTTGATAACTCAA ACATTAGTGATTGTTCTTTTTACTTGTAAACTAATAAAGTTGGAGCTTGAATGTCAACTATTAATCTAGAATGCCTTTCTTGCTCCACTAGAAGTTACTA ATGTTCTGAGCTTATCAGTAATTCAGTGCTTAAATTATACTGAACTGTATTTTTTTCTTTATTCTCTCACATCGTCTCATGTTAGAAACTCGGAATATTT TATCTTTATTTCATCATTCTTGTTCTCAATTTCTTAAAGTTGTTTTTACTTAGATACATCGTTACAGGAATCTTTTTATGAGTTATGTTCTTGTTTTCAT AAGCAGATGAATTTTTGGAAGATTTTGTTAAACAAAACCTGATTCCCTTAGTTGTGCCTGTATCTCATGACACACTTAAGTTGATGGAAGCTGATGATAG AAAGATAGTTTTGACAATTGTTGACGATGAAAATGAAGAAAGATCAAAGGAGCTGGTAAAGCTATTGAAGGCTGCTGCATCTGCAAATCGCGACTTAATA TTTGGTTACGTCGGAGTTAAACAGTTGGAAGAATTTGCTGAAAAATTTGATATCAGGACCAAACTACCAAAAATGGTCATTTGGGATAAAAGTGATGAGT ACCTTTCAGTTGTCGGTTCGGAAAGCATCGAGGGGGAGAATCAGTTAACACTGATCTCTAAATTTGTAGAAGGATACAGGGAAGGAAGAACCATAGAAAA AACAGTTAGTGGCCCTTCACTAATGAAATTTATTCATGGATCTTTTGACATTAGAATGTTGTACTTCCCTATTTTTATGGTTGCAGTAGTGTTGCTTATT CAGTGTATGAATAATGGAGATGATGAACTCCAAGGAGTACCAAATGAAGTTCAGATTCATCATTCAAGTAACTCAGCTTCAGAAGTTGAAAGCAAAGAGT ATTATTATAAAGCTGGAGATAAACAAGATTAAGTTAACAAATATATTGACATAATCATAAGTGGATTTCATAAGGATATTATTGTTTTAGATGGGTTTAG AATTTCCATACCTATAGCTATTGGTATGTGTAAATATCAGACTATGTGAATTTTCATAATTTTGAGGTTTGGCCTAAATTGTGCATTCTGATGTACAAGT TTTCATAGTAATTTGACTAATGACTTTATCATGAAAATGCTTTATCTATTATTTTAAAGATTACAATAATAAAACTGCTAAGTTTATG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_140704;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_276324

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 1.2
• PS1: 0.8
• PS2: 1.5
• PS3: 1.8
• PW1: 0.7
• PW2: 1.6
• PW3: 2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_276324

• Blastp: Protein disulfide-isomerase 5-2 from Arabidopsis with 45.7% of identity
• Blastx: Protein disulfide-isomerase 5-2 from Arabidopsis with 67.32% of identity
• Eggnog: Thioredoxin(COG0526)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G35620)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019441995.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;