| Id Trinity | TRINITY_DN45785_c0_g2_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_277175 |
| Sequence | CTTTATTCTCAATTATCTACTAGTCAAGAAACAAAAAAATGTTCTACCCATTATGATCTATAATCTTTGATTAGTATAGGAGGTGGTTGTATCATCTTGA CTTTACTTTTTTTATTCAACCAATCTACAAAGATTGGCCTAATTCATGTACCAAAATGAATTATAAAAACGAAAATCCTAAGTATAAAAAAAGTCCATAA TGTTTTGATATATGAGAGGAAAAAAGCAAAAGTAGTGTGGTTTAGCAAAATAAGACAAATAAAATGTCTCAGTCCTTGATCGCAGTGCCCTTAACCCAGC AATTGTTTAAAAGGAACAACGGAGTGTTATCGTTCTTCGCTTCTTCTCATTCCACTTCTTCAATTTTCAGATCTCATTCTCTCTCTCTCTTCTCTCAAAA TCAGAAGAGGCGTAATCCTCTCTCACCTATTAAACCACCGAGTGTATCTTTCTCATCTTCTCAAACTACTATGGGTGGAGACACTCCTCAAAACGACGCT GGAATGGACGCTGTTCAGCGTCGTTTAATGTTTGATGATGAGTCCGTACCGTTTCCCTTTTCATTTCCTGTTATTTTGTTCTGATACGCATTTCGTTTAT TTTGATGTGTTATTTGCGTCATTTCATTCGCTTCTTTTTTCTTCAGTCTCCACATAACAAATTACTTCATTTTTATTATTCTTATTTTTTATTTCTGTAC TAACAAGTTATCAGAAACTAATCTTTTCGGCCGGTGACTACTGCTCCCAACAAGTGTCACTGTCCCTACCAGAAATCGAACTGATCTCTCTGGGATGATG TTATGGTTTAGGTCTATTATTGATTATTAATTGAATTGAGACAGCGACTTTAACTTAATTTAATGCCAAATTTCTGTTAAGTTGATTAAAATGTTTCTTG AGATTATTTTATGCTTTTGCTTATGTTTTCTTGACTGTCTGTATATCATGCTAATCAAGGCAGTCAAAGGAAAAAGTCACCCTTGAGGTGCTAGAGATTT AGTCAAGGAAGGCTGCAACCTTATAAAAAAGTTGACTAGTTTGCACTACTTGTAAATTATGTCCTTGATTATAACATATTATATTGACGTGGTCAGTCAA CCGATGTTTGGTCCGAGTGGTAAAGAGACCGGTTCCTCTTAACCGAGAACTCGGGTTTGATTTATATGAATGAAAAAATATAGGGATAGGGTAAGTTTTG CCTCCTCATATGGGTCTTACCGGCTCGAGTTCAATAGTTAGAGTGTAAAGTGATTCTGGAAATTGGGTTGCTGGTAAAGCCAACAACTATTTGTTTTAAT AAATATTTTGACTAGCATACCGCCCCTGGTATTAAAATTAGGAAGTTAGATGTGGTGTACGAGAGACACTGAAAGGTGTCATAACTGGTAAAGGGTAGAC AGGCCTTTTGTAGTGGCTTATTAGTAGGAGTTGAATGCAGGTATAATAGTCAGAATGTTGAAATAATGACTACATGTTGATCTTTGAGACTCTTTCAAAC AGGTTTCGTTAAAAGGACATAATAATCTTTCAATATTACTATGAACGTTACGGTTGAGTAATAACTTTTTTTTAGGAAAGTCATTGTAACAAGGTCATTT ATTCAACTGTATTTTCTTTTCTTGTTAGACTTTCTGAGGCATGGGATGCACTTTTTACCATCTTCCACCTTAAGTCAGTAAAACCGTATTTGCTTTTGAT TACCTTTGGTTTAATCGCTGTTTTTTTCAGCTATAAGTAAGACATACCTGAGCCTCTGTTAGGGTGAGGTGCGGTTCCGCTCCAATAATTGGAACTTGGA GTTTAAAGTGATTTCTGAATGTCAAATACCTCAGACCAAAATATTTTCAAACTCAAAGCTGTTTGCTGTTAACAACAGTAACCATTTTTTAATCAATATG TTGGTTGGCTAGCTAGCATACCCGTTAACAACTTGCTAAAATGTTATGTTAAATGGGGGTATGGTATTCAGAATGTTGAAAGAATAACTAGTTGTTTGAT CTTTGAGACTCTTGCATGCAGGTTTTGTGACAGAACATTGTAATCTTATTTTTTTACCATAAACCATTACGAGTGAGTTGTAAATCTTTTTGGAAAGTCT ATGCACAGAGGGGTCAGTTATTAAACTGTTTTTTACCTAGTGATGCTGATCCCTTGGGGTGTTGGCCCCCTGCACTTTAGGCACACCAACTCTTGTTAGC ATCTTGCAACAGATAGAGTTAGGAAACACGTAGTTGAGCATTAACTAATAATTTACATGTTGATTTTCCAGGTGAATCTGTGCACAGCATAATCATACTT GGTTGAAAACTTCTAGCCATTATTTTTTTATATTTCTTACTTTTGTCTTTGAATCTCTTTAGTACAAGTTTTGCATGTCATTCATAAAATCATAGTTGTT TCAATATGAAATTCTATTAAGTATCAAACTTGCTTCCCAGTTTTTCTAGGTTAGTTTTGTTGCAGTAGTTGATTTTTTTTAATATCTGGTGTTTCAGTGA TGAGAAGAGGCTTTTCTTTTTCCATGTATAATTTTCTTGGTCTTTATACTAATATTTCAATGTCCTCTTTCTCCTTGTACATATTAAATATCCTAACTTC CATTTTTACTAATGCATCATTGATTTCTTCATCTTACCTGAATTGGTATTTTTTTGTTTTGGAATTTCACAGATGCATTTTAGTGGATGAGACTGACCGT GTGGTTGGTCATGATTCCAAATATAATTGTAAGTGGACTTTCCATTTTGAAATCTTATTCAATATTCGTGGACTCACATTATTTAGCATTGAAATAGTTG TTACAAAGTTTTGTGTGCTTTGACTTCTTATAATTTATAATTCTTGTTTTCTGAAGAATATATACTTTTATGATTTATTATGTTTGTAAAAGTGGATTAT GTGATATTGTTGGGGGTTTATTATCATGAAATTTTCTGAGTTGACTCTGCAATATGATGGTTTGAGCAAACAATATTGTATATTTCATACATAAATCGTT GATTATCTTGTAGTCCATATCAACTAACCTATTGTATTGGCTAAAAAAGTAGTAGTCTTAATTTTTACCGTGTTAGCCTGTATGGATTGATTTGTAATTG TAATAACTATATTTTTTACCAATTGTGATTTTAGAAACAATTTGTCAAGTTTGCGGTATTTTTTTATAAATATAACCCATAGTGTGTGTTCCTGATTTTC TTTTTACTATCCTAAATCTTCATGAGATAAAATACTCATATCTACAATGCAACATAGCTTCCAGAGAAGTTGTTCTCAAAGTTGTCCATTTTTTTCTGAG ATAATTCCTCATATGAAACATGTTATATTTGCAACATGGTTATGAACCAGTAGCAATAGTGGCACTATTCTTCTGTAGCATTGCATGTCCATGAGAACCA GTGTGTTCCTGATTTTCTTTTTACTATCCTAAATCTTCATGAGATAAAATACTCATATCTACAATGCAACATAGCTTCCAGAGAAGTTGTTCTCAAAGTT GTCCATTTTTTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_140743; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_277175
| Blastp | Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase I from Clarkia with 61.11% of identity |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431222.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |