Ll_transcript_276247

Id TrinityTRINITY_DN45796_c0_g1_i2
Name TranscriptLl_transcript_276247
SequenceGTCACAATCAACACAAACACACTCAAAACTTCTTCTCTCTCCTCTCACTTTTCAAACCTTCTCTTTCTCTCTCTCGTCGTTACAGAAGAACATATGCTCC GAATATCTCATTCCTCATTCTTCATTCAACCTTATTCTCTCACAAACCTTTTTCTTCTTCCAACATGGTATGCTTCTACCTCAAGCAAAAACCTTTCACA AGTTTGAGACAAGAAGGGGAAAGAGAATAAAAAGTTAATTGATTCTTTTCAAGCTCATATGTGAGGAAAAAAAATTGTATTTTTATTATTTTTCATTATG ATTCTCTTCTTGTAGCTATAGAACAGGGTTTTTGATTTATTTTTTAAACTATGGAGATGTTCTTCATGTAGAAAAATTGGATTTTTTATTCCCCTTTTAT TTATTTTTTCACTTTAAAGTTTTGAGAAGCCGTGGTTCTAGAATATAGGAATCGGGGTTTTGTTGTGTTGTTGGATTTAAAAGATAGTTTTTTTATAAAA AGAACTTGAACTTGTTATGTGGGTAATGATTGAAATGAGGATTTGGGATATAGTTTAAGGTTGCAGCATGAGTTTCAGAGAAGGGAATGAATGTGAAGAA TCAAAATCAGTGAGTCAAAATGTGTCACTTACAAATTCTCAGTTAACAGTTGATGAGAGTCTTCTGGTTGATCCCAAGTTATTGTTTATTGGTGATAAGA TTGGTGAAGGAGCTCATGGCAAAGTTTATAAAGGAAGGTAAGTTGCAAAGTTTATGGTCTTTTTTTTAGTATTTTAAATAGTGGTTGTCCAAGAAAAACT ATAGGGGAACCTTTAAGAAGTGTTTAGATGTAAATATTTTATCTATAGACATGATTTACGATAGGATATTATGGTGTTGTTTGATCATAATTATGTGGTT GTGGTTGTTTTAATTTATGGTTGTGAGTTCATGTAGATATATTAGTTGCTTATAATCCCTTGCATGTTAGACCCTACAATGGTAGGATATTTATTTACAA TTCTGGGTTTGTTTGAGCAAACAACTTAATTCAATAAGCTAATTTAAAATAGGGTAGCAAGAGCTTATTTTCATATGTTTTTCTGATAAATTTACTAAAG TAAGCTAAAAGGAGTTTATAAAAAAGCATATTAGTTATTTTTTAAGCTAATATCATGAGCTTATTTTATAAACTGTTCTCATAAACACAAATAAGCTCTC TATAGGTTATTCCAAACACTCCTTAGTTTACATAATTTTTATATTTTTGCACCAATAGCTGGAGGAATTATTAAATGTGTGAAAGTCAATGTTTTCTGTG GTTCCTTTACTTTCTCATGGAGTAAATAACTGTGCTTCATTGTTGGTATATAAAACTTGCTTCAAACATCAATGATTTTCCTGTTCTGCTAATTCGAAAA TCGACAGTGTAGATTCCACCATCATGATAAGACTGTTGGAATGGTATTCATAATTTGATTTTACTTAATAACTACTGATATCTAACTGAAGGCGAAACGG TATTTGATTTTTTATTCCACTGATGTAACTATTAATGGTTACTAGAGGTAAGCTCAACTGTATAGTTTTGTGTATTCATGATACATCAATTGATTTGTCA ACAACTAGAGTCTTGGTTTATGTAGGAATAGTTAATAATTTTCCAGGTATCACGACCAAATTGTTGCAATTAAAGTTCTGCACCGTGGGAGCACTTCAGA AGAAAGAGCTGCGCTTGAAAATCGTTTTGCTCGGGAAGTTATTATGATGTCCCGTGTCCACCATGAGAATCTTGTTAAGTTTATTGGAGCTTGCAAGGAC CCTCTTATGGTGATAGTTACTGAGCTATTACCGGGAATGTCACTCCGGAAATATTTAATGAGCGTCCGTCCTAAACAATTAGAACTTCATGTGGCTATAA ACTTTGCCCTTGATATTGCTAAAGCAATGGATTGGCTGCATGCCAACGGCATCATACACAGAGATCTAAAACCTGGTACTTTCATGTATATATAGTACAC TGCGTGTAATAGTCATTATCCAGTTCATATCAATATATCCATATAATGAAGGGGTTATTAATTTATTGCACTAGGCACATCAAAATTACTAGTATATGTT ATGAAAGAGGAAAAAAGAAAAAGGTTTCTTTTCCTATTTGAATTAAGACATTCTTTACAATATACGGTACTGAAATATTTTTATTTTTAGTGTTTACAAG GTGGATAATGAATCTGGTTGCCGCATCTATCGTATAATTTTTGTTGTTGTCGCAAATCTTTGTTCTTCATGACTGACTTTTATCAAACTTATCTCTGCTT ACCATTCTTCAAAACATAGGAGAGACAGAAGTACTGCTAATTACATGCGAAAAACATGCTAATCATAGTAGTTTTTACATTATTGTTCTAGCATGAAATA TAGGTATATGATATATAGGTGTGTCTCTCTTCAACTATGTTTTGAAACTGTCACAATGCAGACAATCTGTTGCTTACAGCAAATCAGAAGTCTGTTAAAC TTGCAGATTTCGGTCTCGCAAGAGAAGAATCTGTGACTGAAATGATGACTGCAGAAACTGGAACTTACCGTTGGATGGCACCAGAGGTATGTAGTATTCT CCATTGAAAACTATCCATGGTCTGATAAAACTGGCACTTTTTGGTGTTTATCATCTTGATCCATGGTATTAAAACCATCAAGTTGCAGTAATCTGAAATT AATTTGAAGAGTGATCTGAACTTAATTCTGGGTTTGCCATAATGGCAGACAATTGTACTTCTCTGTCTAAAACTGATAGATTTGATTTTAGCATTGATTT GGTCCTTGAAATTGGCATAATCAGTCTATTTTTTTTCCTGACATTATGAAGAAGAAAAAACAAATTTAGTCTGACTTTGAAAACCGACAATCCATTTAGT CCCTGACAATAATCAACCAACTTGGTCCCTGAAATTTGGTTTGCTTTGTCAATTTTTTGGCCCCTTAAATTTGGTCCCTGCAAAGCTTCAATGTTTGACT TTGGGTTTGTTTATGCTGCAAAGGTTGAATGATCATTTTGATCAAGGTTTGTCACATAGGTGCTAATTTGTATATGCTTTATGTTGACATAAGGGACTAC GTTGATTGATAATTGTATTGCTGGGGACTAAATTTGTGTTTTCGAAATATTAGGGACTAAGTTGACTGATGGCGCCAATTTTAGGGACTAATTGATGTTT TACTTGATAAATTTGATGTACTTCCTTGTCTATTTTGTGTAACCGCTGCATTGCTTGTGAGTGGATATTGGCAGTACCATAGTTTCGTTTTACCCAATTA AGTGAGTTCCATTCCGGAGTTATTTAATTTCTAATAATGAAGGGACCTGGTACAAGCTTGTCAACTAAGTTTTAATTATTTCGCTGAATAGATAAAGGTA ATTTATGCATATAGGATCCCTACAAGTCACTGATTATGTACATTAAAAATGTATTATGGATTTTCCGCCATATAGGTTTTGTTTATATACATGGATTTTT TTATGAACGGTCATGTTTTCGCAGTTGTACAGTACTGTGACATTGCGACAGGGAGAGAAAAAGCATTACAACAACAAGGTTGATGTGTATAGCTTCGGAA TTGTTTTGTGGGAGTTACTAACAAACCGCATGCCTTTTGAAGGGATGTCTAATTTACAGGCTGCATATGCCGCTGCGTTTAAGCAAGAGAGGCCTAGCAT TCCTGACGATATATCTCCCGATCTCACGTTTATCATACAATCATGTTGGGTCGAAGAACCCAACATGAGACCAAGCTTTAGTCAGATCATCCGCATGCTC AATGCGTTTCTCTTCACACTCTCACCACTATCTCCTCCTTTGCCATCAGAACCTGACAATGATGAACCCGAAGTAGCAGCAGCAACAACGACAAGTAATG GTGCTATTACCGAGTTTTCTGCCCGGAATAAAGGAAAGTTTGCTTTTCTACGCCATTTGTTTTCTTCAAAGAGGACGAAGAACTAACAGTGTGAGTGGTA AAAAAAATGAAATTACCTTTTGTTGTAGATGAAAAAGATATGGCATGGTATGGTACATAATCTATGAGTAAGACCATCTAATGTAACAAGTAGAAGGATG TAACATGTTCCACAAAAGAATAGAATGTTGTTTATAGGCTTTATGAAAGAGTAAGAAAGAAAAATAGGATTTGTTTACCTTATCTAGTTAATCTTGTTGT AAAGGAACACATTGGTATAAACATATTCTTGTTTTGAGAATGTTATTAATTAATGCATAGTAATTCATCATAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_140770; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_276247

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_276247

BlastpSerine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 51.76% of identity
BlastxSerine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 51.76% of identity
EggnogSerine Threonine protein kinase(COG0515)
KeggLink to kegg annotations (AT1G62400)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019412787.1)
PfamProtein tyrosine kinase (PF07714.16)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;