Id Trinity | TRINITY_DN45796_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_276251 |
Sequence | GTCACAATCAACACAAACACACTCAAAACTTCTTCTCTCTCCTCTCACTTTTCAAACCTTCTCTTTCTCTCTCTCGTCGTTACAGAAGAACATATGCTCC GAATATCTCATTCCTCATTCTTCATTCAACCTTATTCTCTCACAAACCTTTTTCTTCTTCCAACATGGTATGCTTCTACCTCAAGCAAAAACCTTTCACA AGTTTGAGACAAGAAGGGGAAAGAGAATAAAAAGTTAATTGATTCTTTTCAAGCTCATATTTTAAGGTTGCAGCATGAGTTTCAGAGAAGGGAATGAATG TGAAGAATCAAAATCAGTGAGTCAAAATGTGTCACTTACAAATTCTCAGTTAACAGTTGATGAGAGTCTTCTGGTTGATCCCAAGTTATTGTTTATTGGT GATAAGATTGGTGAAGGAGCTCATGGCAAAGTTTATAAAGGAAGGTAAGTTGCAAAGTTTATGGTCTTTTTTTTAGTATTTTAAATAGTGGTTGTCCAAG AAAAACTATAGGGGAACCTTTAAGAAGTGTTTAGATGTAAATATTTTATCTATAGACATGATTTACGATAGGATATTATGGTGTTGTTTGATCATAATTA TGTGGTTGTGGTTGTTTTAATTTATGGTTGTGAGTTCATGTAGATATATTAGTTGCTTATAATCCCTTGCATGTTAGACCCTACAATGGTAGGATATTTA TTTACAATTCTGGGTTTGTTTGAGCAAACAACTTAATTCAATAAGCTAATTTAAAATAGGGTAGCAAGAGCTTATTTTCATATGTTTTTCTGATAAATTT ACTAAAGTAAGCTAAAAGGAGTTTATAAAAAAGCATATTAGTTATTTTTTAAGCTAATATCATGAGCTTATTTTATAAACTGTTCTCATAAACACAAATA AGCTCTCTATAGGTTATTCCAAACACTCCTTAGTTTACATAATTTTTATATTTTTGCACCAATAGCTGGAGGAATTATTAAATGTGTGAAAGTCAATGTT TTCTGTGGTTCCTTTACTTTCTCATGGAGTAAATAACTGTGCTTCATTGTTGGTATATAAAACTTGCTTCAAACATCAATGATTTTCCTGTTCTGCTAAT TCGAAAATCGACAGTGTAGATTCCACCATCATGATAAGACTGTTGGAATGGTATTCATAATTTGATTTTACTTAATAACTACTGATATCTAACTGAAGGC GAAACGGTATTTGATTTTTTATTCCACTGATGTAACTATTAATGGTTACTAGAGGTAAGCTCAACTGTATAGTTTTGTGTATTCATGATACATCAATTGA TTTGTCAACAACTAGAGTCTTGGTTTATGTAGGAATAGTTAATAATTTTCCAGGTATCACGACCAAATTGTTGCAATTAAAGTTCTGCACCGTGGGAGCA CTTCAGAAGAAAGAGCTGCGCTTGAAAATCGTTTTGCTCGGGAAGTTATTATGATGTCCCGTGTCCACCATGAGAATCTTGTTAAGTTTATTGGAGCTTG CAAGGACCCTCTTATGGTGATAGTTACTGAGCTATTACCGGGAATGTCACTCCGGAAATATTTAATGAGCGTCCGTCCTAAACAATTAGAACTTCATGTG GCTATAAACTTTGCCCTTGATATTGCTAAAGCAATGGATTGGCTGCATGCCAACGGCATCATACACAGAGATCTAAAACCTGGTACTTTCATGTATATAT AGTACACTGCGTGTAATAGTCATTATCCAGTTCATATCAATATATCCATATAATGAAGGGGTTATTAATTTATTGCACTAGGCACATCAAAATTACTAGT ATATGTTATGAAAGAGGAAAAAAGAAAAAGGTTTCTTTTCCTATTTGAATTAAGACATTCTTTACAATATACGGTACTGAAATATTTTTATTTTTAGTGT TTACAAGGTGGATAATGAATCTGGTTGCCGCATCTATCGTATAATTTTTGTTGTTGTCGCAAATCTTTGTTCTTCATGACTGACTTTTATCAAACTTATC TCTGCTTACCATTCTTCAAAACATAGGAGAGACAGAAGTACTGCTAATTACATGCGAAAAACATGCTAATCATAGTAGTTTTTACATTATTGTTCTAGCA TGAAATATAGGTATATGATATATAGGTGTGTCTCTCTTCAACTATGTTTTGAAACTGTCACAATGCAGACAATCTGTTGCTTACAGCAAATCAGAAGTCT GTTAAACTTGCAGATTTCGGTCTCGCAAGAGAAGAATCTGTGACTGAAATGATGACTGCAGAAACTGGAACTTACCGTTGGATGGCACCAGAGGTATGTA GTATTCTCCATTGAAAACTATCCATGGTCTGATAAAACTGGCACTTTTTGGTGTTTATCATCTTGATCCATGGTATTAAAACCATCAAGTTGCAGTAATC TGAAATTAATTTGAAGAGTGATCTGAACTTAATTCTGGGTTTGCCATAATGGCAGACAATTGTACTTCTCTGTCTAAAACTGATAGATTTGATTTTAGCA TTGATTTGGTCCTTGAAATTGGCATAATCAGTCTATTTTTTTTCCTGACATTATGAAGAAGAAAAAACAAATTTAGTCTGACTTTGAAAACCGACAATCC ATTTAGTCCCTGACAATAATCAACCAACTTGGTCCCTGAAATTTGGTTTGCTTTGTCAATTTTTTGGCCCCTTAAATTTGGTCCCTGCAAAGCTTCAATG TTTGACTTTGGGTTTGTTTATGCTGCAAAGGTTGAATGATCATTTTGATCAAGGTTTGTCACATAGGTGCTAATTTGTATATGCTTTATGTTGACATAAG GGACTACGTTGATTGATAATTGTATTGCTGGGGACTAAATTTGTGTTTTCGAAATATTAGGGACTAAGTTGACTGATGGCGCCAATTTTAGGGACTAATT GATGTTTTACTTGATAAATTTGATGTACTTCCTTGTCTATTTTGTGTAACCGCTGCATTGCTTGTGAGTGGATATTGGCAGTACCATAGTTTCGTTTTAC CCAATTAAGTGAGTTCCATTCCGGAGTTATTTAATTTCTAATAATGAAGGGACCTGGTACAAGCTTGTCAACTAAGTTTTAATTATTTCGCTGAATAGAT AAAGGTAATTTATGCATATAGGATCCCTACAAGTCACTGATTATGTACATTAAAAATGTATTATGGATTTTCCGCCATATAGGTTTTGTTTATATACATG GATTTTTTTATGAACGGTCATGTTTTCGCAGTTGTACAGTACTGTGACATTGCGACAGGGAGAGAAAAAGCATTACAACAACAAGGTTGATGTGTATAGC TTCGGAATTGTTTTGTGGGAGTTACTAACAAACCGCATGCCTTTTGAAGGGATGTCTAATTTACAGGCTGCATATGCCGCTGCGTTTAAGCAAGAGAGGC CTAGCATTCCTGACGATATATCTCCCGATCTCACGTTTATCATACAATCATGTTGGGTCGAAGAACCCAACATGAGACCAAGCTTTAGTCAGATCATCCG CATGCTCAATGCGTTTCTCTTCACACTCTCACCACTATCTCCTCCTTTGCCATCAGAACCTGACAATGATGAACCCGAAGTAGCAGCAGCAACAACGACA AGTAATGGTGCTATTACCGAGTTTTCTGCCCGGAATAAAGGAAAGTTTGCTTTTCTACGCCATTTGTTTTCTTCAAAGAGGACGAAGAACTAACAGTGTG AGTGGTAAAAAAAATGAAATTACCTTTTGTTGTAGATGAAAAAGATATGGCATGGTATGGTACATAATCTATGAGTAAGACCATCTAATGTAACAAGTAG AAGGATGTAACATGTTCCACAAAAGAATAGAATGTTGTTTATAGGCTTTATGAAAGAGTAAGAAAGAAAAATAGGATTTGTTTACCTTATCTAGTTAATC TTGTTGTAAAGGAACACATTGGTATAAACATATTCTTGTTTTGAGAATGTTATTAATTAATGCATAGTAATTCATCATAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_140770; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_276251
Blastp | Serine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 51.76% of identity |
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Blastx | Serine/threonine-protein kinase HT1 from Arabidopsis with 51.76% of identity |
Eggnog | Serine Threonine protein kinase(COG0515) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G62400) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412787.1) |
Pfam | Protein tyrosine kinase (PF07714.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |