Ll_transcript_356400

• Id Trinity: TRINITY_DN45818_c5_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_356400
• Sequence: CAATGAAAAATCAAAAAAATATTACCTCTTTTTGTTTTCTTCCATCTCCTGCATACCCAGTCCCTACTATTCCTATATATCTCACTCTTTACATTCTTCA CAATATACTACTTACTTGCTACTACTACTATCTCTCCCTTCTTTCTTTGTTACAAAGAGAGACATGGAGTCCTCAAAGATCCATGCTTTTCTCTTCATTT CTATGCTCTTCATCTCTTCTTCTGCTCCTATTCTTGGTTGTGGCTATTGTGGTAACCCTCATCATAAGAAGCACAAGCCAAGCAAGAAACCCAAGTTACC AATCACAGTCCCTCCCATTGTGAACCCACCACACATTGTTCCACCTATTATTGTGAAGCCACCAGTTACAATTCCACCAGTGCTGAACCCACCAACAACA CCAGAGAATAAGCCATGCCCACCACCAAAGTCACCAACACAGGCAACATGTCCAATAGACACACTGAAACTGGGTGCATGTGTGGATCTGTTAGGTGGGT TGGTGCATATTGGGTTAGGGGACCCAGCTGTGAATGAGTGTTGTCCAGTGCTTCAAGGACTAGTTGAGGTTGAAGCTGCAGCATGTCTTTGCACTACTCT TAAGTTAAAGCTTCTGAACCTAAACATCTTTGTACCAATTGCACTTCAGGTTCTTGTGGCTTGTGGAAAATCTCCTCCACCTGGTTACACATGCTCACTG TAATCCACTTAATAAGTGTCTGTTAACCTTCCTCAACTGTGTATGTCTCTCTGAAAACAAAAATATCACTGTGTTTCTTGTTTTTATTTATTGGTAATGT GAGATTCTTTGTTAAGCATTTCCTAAAATGAATGAAACTTGTGTCTGAATATGTTTTATTAAGTAAGCAGTACTTATGTAATCTGCTGAATAGTAATTAA AATAATTAATGTTCAAAAACACCATAATCCTTAATATAATGCATTACTTGTCCCTAACCTTGTTACAATCCAATGAAATTGTAAAACCTACTAAAAAAAG TTTGACTAGTGAAAAACATGCATGTTAATTTTTTTTAGAGATCAAAATTTTATTGAAATGAAATAGGGATAGAAACATGCTTTTCAGAGATATAATCTTT ATTCCTTAGTCATCCTGAATTTAATTTTTGTAACATGTAAAAAAATTATGATTTTCATAACATGTATTAAGTCTTAATGAATTAGAATAATTTTTGTTGA GGTAGAATCAAAACAATTTCTGTTACTCACCCATCTTCATAAAAAATGTATTATATTCTTACAACACATCTTTAATATTTGATTGAAATTGTTATGGTAA ACTGTGTCAAAACAACAATAACTCCTTCGGCTCAATATTTAAAGAAATTGTTATGGTAAACAGTGTCAAAACAACAATTACTCCTTTGCTTCATAGTGAT TAAAAATTAAAGTATTTAATACTCAATCATTGAGACCTGTTTTTCTTATAAGTAATCAATTAATCATTAAGACCTGCTGGTTAGTGAATAGTGCCCGGGT TAATTTCTTTTTGGAAGTACCCAATAACAAGCTACTAGTTATACGGAGGGATATATTCTCTTAAGTTTGTTCCCATGTACTAAGTCAATCATAATAAAAG AAAAAAAAAGATAAAATTATAAATATTTAATTTTTTAACTGATATGATATATTATAATTGGTTTGAGACAACAGATCTTTATACCTAGTTATATATAAAA AAATAAGTTCAGAAACTGAATAATTTATTGAAATTTTGTGAAAGAACAATAAACATTCTAATAGGAAAGGTACTGATTCAATTATTTTCTGTTTTCCTTT TAAATGTCCTTATATATATCATTATAAACGTTTTGTCTTCACATGACTTGATTTCTATTTCCAAAATTATTAATGTTGTCCTATTTTATACCCGTGAGTT GATATGTCTTTGTCTTATTGGATGTGACGGTGTGTGATTTGCAGGACAATGTATTCAGGAATTATGTTCAAATCGTCACCCACTCTTTCTCTTCATTAAT ATTGGAATTGTTGTTGTTTAGCTATTATTGGTAAAAACCCATTTGCTATTATTTTTAATTGAGATTGTTGCATGTATGTTTAATCCTAGGCCAAGTAAAG TAGCAGTGAAGTTGATTAATTCTCTATGACATTTTAGTTAAAATATTTGTTGATTTGCATTTTATTGAAGTTCAGCTTCATGTTATATTATTGCGTCACA TTATTTGCTTCAATAGGGGATAAGCTCAGTCTCTTGAAAATGTAGAATAAATATATTGTGCATGCCATATATGAGGGGTATATAATTAGATTCCTAGGTA CTTGAACATTGTAAATTTTGCAACATGTTGGATTTTCCTTTACATTTCTGACTGGGTTAATTTGGGACATAAGTATGACGTACGATTCCACCCGTTACAG AGAGAACCCCTCTGGTTTTGGTTTCCAATGAGCTTGTGGAAGTTTGCACTTTTCATTAAAAATTACTTTTTGATATAAACCAAGCAAAAAACTGTGTAGA AAATGATATGGGTGATAAAATAATACTTTATTTATTAATAATTGACTTATAAATAATATATTTTATTGTCACATAATATGGAGATCTTGTTACACATTTT ATTGTCACATAATGTATATCACCTTGCATAACATATAAAAATGTTTTATACCCCATCTTTTGTCACATCTTGTCCTGAATTGGTACACATTCTTGCAAGT CTATATCACATATTAAAAATGCTATGGACACTGTACTAGATATAAGTATGGTTAGATACCGTTATATACTATGCAAATTTAAAATAAATATATGACATAC GAATATGAGTAAAAAATCATTTGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_140860;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_356400

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 9.5
• PS1: 9.1
• PS2: 11.1
• PS3: 14.7
• PW1: 3.2
• PW2: 1.3
• PW3: 3.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_356400

• Blastp: 36.4 kDa proline-rich protein from Lycopersicon with 65.52% of identity
• Blastx: pEARLI1-like lipid transfer protein 1 from Arabidopsis with 48.24% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019440604.1)
• Pfam: Hydrophobic seed protein (PF14547.5)
• Rfam: -
• GO: -