Ll_transcript_356414

• Id Trinity: TRINITY_DN45818_c5_g5_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_356414
• Sequence: ATTCCACCAGTTACAGTCCCTCCCGTTGTGAAGCCACCAGTAACATTACCTGTTCCAATTCCACCAGTTACAGTCCCTCCTGTTTTGAAGCCTCCAGTAA CTTTACCTGTCCCAATTCCACCTGTTACAGTTCCACCAGTTACAGTTCCTCCGGTTACAGTTCCTCCGGTTCTTAACCCACCAACAACACCGGGGACGGG AGGGAAATCGCCATGCCCATCACCGAGTCCTCCAGCACAGGAAACATGCCCAATTGACATACTGAAACTGGGTGGATGTGTTGATCTGTTAGGTGGATTG GTGCACATTGGACTGGGGGACCCAGCTGTGAATGAGTGCTGCCCTTTGCTTCAAGGACTTGCTGAGGTTGAAGCTGCAGTGTGTCTTTGCACCACTATTA AGCTCAAGCTTCTGAACCTCAACATTTTTGTTCCAATTGCTCTTCAGCTTCTTGTTGCATGTGGAAAGTCTCCTCCTCCTGGTTACACTTGCTCCCTCTA AACCACTTCAGTGCTTCTTCAACAGTGTAAGTCTCTCTAAAACCCCCACAAAACCCTAAGTTATGTTTTCTTTTACATTGTCAAACACCAACTCTTTATA AAATAGAAGGACTAAACGGTCACTTTACTTGTGTTTTTTGTTTTCATTAATCGATAATAATATGAGATTCTTTGTTAACCATTTTCTAAAATGAGTGAAA CTTGTTAGGGCATATGTTTCTTAGGTATTTAAGCAGTAAAATCCGTTGAATATATAGTTATTGAAATAATTAAGTTGAAAAGACAACAAAATCCTTAATA TAATTAGCTTTAGATTCAAATTGGTCGTGTCTACCTTTTCTATTATACTGCTCAATCATTAAGTTCTACTGATCATTAACCAAGTTTCTTTCTTTTTGGA AGTAGCTAGTAAAATGCATGGTTATCCACTTGCTCTTTTATGTTTTTTCTCTCTATTTTAGAAAGGTAATAGTGACTGGCATGCATATTAATTAAGCTTG TCGTTTTTTATAAATAAATAAAAGATTAAGTTAGAAGCTGAATATTTTATTTAAATCATTATCATTATAGGATATAAGTCATATAAGTCCTGAGAAGAGG GAGTAAAAGGTTAGAGATTTTGTCCAAAAACAATACCTTTCCTAGCTAGCTATCTAAACAAAGATTATTAAATTAATCAACATTCTAGTATAAAAGTTAC TGATTCAATTATTTTCTCTTCACTTTACTTTAAACTGTTATTATATATGATTGTGAACGTTTTGTCTTCACACTAAGTGGAATTAAGGATGCAAGATTTG ATTTCTATTTCCAATTATTAATGTTGTCCTATTATTGTATACCCGTGAACTTGAAGTCTTTGTCTAATTTGATGTCACTATCTGTGATTTGCAGGTCAAT GTATTGAAGAATGTATGGTTGAAATAGACATGAGGGTGTCCACCACTCTTTGTTCTCTTGCTTAATGGAATTGTTGTTGTTTGTTTAATTTGGCTATTAT TTGTAAAAAACATTTGTTTTTAATTGAGAATGTTCAATCTATGTCTAGTATTCCTAGTAGGCCAAGTAAAGTAGCAGCGAAGATGCTTAATTCTCTGTGA ATTTTAATAAAATTATTGATATGAATTTCACTTTGTGTTGGTTGTTGATGGTTACCTTAGTGTTCTATTATTGTGTACCATATTTGCTTCAAATTGGGAT AAGATATTCTAACTTGTAGTAAAAAACATCTTGAGTATATATCAAAAATATCAAATATGCAGAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_140863;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_356414

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 2.4
• PS1: 0.3
• PS2: 2.7
• PS3: 0.3
• PW1: 0.5
• PW2: 0.3
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_356414

• Blastp: 36.4 kDa proline-rich protein from Lycopersicon with 65.52% of identity
• Blastx: 36.4 kDa proline-rich protein from Lycopersicon with 65.52% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464051.1)
• Pfam: Hydrophobic seed protein (PF14547.5)
• Rfam: -
• GO: -