Id Trinity | TRINITY_DN45922_c5_g2_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_392549 |
Sequence | CTTGTATTGACTTTGACACTGTCCGCGTCGAACATAGCCACCGACCATTTCACCAATCCATCTGCCACGTGTCATCTTCCTTCTCCACCTTTTCTAATAA TAATATATATAATTCTATTAACCAACCCTTAACAATTCCTTCATTTTCTCTTCTTCTGTCACTTTTTTCCATTTCATTTCAATTCGATTCATTCCCTTTT TTTTATCTCACGCGCCGCCGAACCATGCCGTATTGTGATATCGGAACGCTGGAATCACCGTCACCGTCGTTTTCTGCTGCCAGTGTTGTTTCTGATGATT CTCAACTCAACAATGATTTGAAGATTTTTTATAGAACTTATGGACGTGGTCCTACTAAAGTTCTTCTCATCATAGGATTGGCGGCAACGCACGATTCGTG GGGCCCACAGGTGATAGGTTTGACCGGAACCGATGTCCCGAACAACGACACATGTAGTGGTGATGGTGATGATGATAATGAGTGCGGTGGTGGGATCCAG GCATGCGCGTTTGATAATAGGGGCGTGGGTCGGAGCTCTGCACCCGTTAATAAATCTGACTATTCAACCCAGATCATGGCAAAGGATGCCATTGCTTTAT TAGATCATCTAGGTTGGAAAAAAGCTCATGTTTTTGGGCACTCAATGGGAGCGATGATAGCTTGTAAAGTAGCAGCTATGGTTCCTGATAGAGTCCTGTC CTTGGCCTTGCTCAATGTAACAGGTGGAGGCTTTGAATGTTTTCCAAAGTTGGATCGACAAACAGTCTCCGTTGCTTACCGTTTCTTGAAAGCAAAGACT CCTGAACAAAGAGCTGCTGTTGATTTGGACACTCACTACTCTCAAGAATATCTTGAGGAATATGTTGGAACTGATAAGAGAAGAACAATCTTATACCAGG TGTGATATATTAAATACACTTAGTTTTAATTAAGTTTAGCTGGCTTGTTGAGTCTGCTCAGAATTTATTACTTTTGTGCTGTCATGGAGTGTTTCTATAG TTAAATAGCACTCTACCAGAAGCTTTTTGTTAGGTATCTAAACTGAATCTAATTACTTAATACTTATGAACATGAGCTCTGAAACTGATATCAAAAAATA CCGGTTCAGACTTCAGAGACAGTGTAAGATATCCTCAAAAAGAAGGAAATTCGACAAGAAAAAACACTGCCAGAGCCTTAATGGTCGTGCTTCCTGCTAT TTCCACCAAAAACCTTACCTCTTTTCCAACCTCTTTTTCTGGATCTTACTACCCCATTTATTATCCGGTCAATTGAATTCTCGTCCAAGTAATTCTCCTT CTGCTACCTTTCCATTTTGTATGCTGCACTTCCCCAGTATGAAGAGATTCGTCACGAATGCTTTGTTGTTTCCCTCATGGACCCCTGCTTCTCACCTTAT TTCTCGGAAAAAATACCGTAGTTATTCTATCACATTTACATAGAAAAACGGAATTTATGCAGGTAGTTGCAGGCTTGCAGCAACTTCGCTTTTGTTAAAT AATGCAAAGGCATCACCACCATGACTTAAGGCTCAACAAATATTTGCATATACTAGAAGTGTCAGAACTCAACCTTTTAAAACATTTTTAATTTTTTGAT ATGATTCACTTAGAATTTCCAAGTTTAAAAACAGACCATGCTTAGTATCACGATTGTTTTCGCACTTTACATGGGTATATGCTTGGATAGAGAGAAAAGG AAGGGATGTTTGGGCATTTTTATGAGAAGGAAAGAGGGCTGAGGGATTCAGTTAACCCTTCAAAATCCTAGAACGTTTACTCGAGTTTTCTCAATTTGGG GAAATTCGAGGATAAATTAACTTATACCCGATTATAATGCTATTGTTTCAAATTCATTTATATTATTAACCTGAACATGAGTTTAATAAATATTATTCCC ATCCTTTCCCTTTCCCTCTCAACTCCAGGCACCTTACGAATTTGTACTAGCCATCGCGCTCTGCGATTAAGTATTATGAATTTTTTCCATCATGTGTTCC TAATTCAGTACCGCCGTTTCTTTCAGCAATATGTTAAAGGTATATCAGCGAGTGGTATGCAATCTAACTATGGTTTTGAAGGTCAACTTAATGCATGTTG GACGCATAAAATATCTCAAACAGAGATTGAGGTGATCCAATCTGCAGGTTTCCTCATTTCAGTTATTCATGGCAGACATGACATAATTGCTCAGATATAT TATGCAAAAAAATTTGCTGAGAGGCTTCAACCTATGGCGAGAATGGTAAATCTTCATGGAGGTCATTTAGTGAGTCATGAGCGGCCAGAAGAGGTTAATC AAGCACTTTTTGACTTGATAAAGGCATCAGAAGTGAAGATGAGTCCACATGAATGGACTAATTTGCCAACGAAACAGTCTTCTTGGTGGCTTGTCAACGT GTGGTAGTCTAAGCTTCAAGCCGAGACGGACCCACGTTGGTGGGTGTTCGGGCTCATGTCCCCACTTAAAATTTTCTACTATGTAACATTTTTGTCCCCG CAACTTAGTAAGGTTTGCCCCAAATACAAGGTGATAGGGTAAATTCCAATTTTAACTAACCACAGCCCATTCCTCTCTTTTGGTTTCGGACTTCTCTTAA TTCCTCTCTTCTCAGCTGCAAACCCAATTTCGTTCACCCGGTGTTAACTTTCCATGGCTTCCTACTTGGTTGGATGATTCATTTAGCACCTAGCAGCCAA GTTTCCAAAGACACTAAGTCCAATTTTAACTAACCACAGCCAATTTCTCTCTTTCGGTTTTCCGGCTTCTCTTAATTCCTCTCTTCTCACAGCAAACCCA ATTTTATTCACCCCATGTTAAACTTTCCGTGGCTTCCTACTTGGTTATATGATTTAATTAGCACCCAACAGCCAAGTTTCCACAGACACAGAGCCATGTT TCAGTGCATACGTGGTCCCGGATGGATTCACAGGTGAATACCTTTAAGATTAACTAAATATTGTACAGACCAAAAGAAAAACAATAGCAAAATTAACATT GCCTGCAATGAAAAGTTACAACAGATATCACAAATTTAAAATACAAGTTACTAGAATGTTGACCAATAGGTTTGCCCTGACTAGGTCACTGCCCAAAATT TCATGGTCCTATTCATGTGAGTATAAATATATGGTCTGATATCACATGCATACTTATATGAAATGTGAAGTATCCATCAATTATCACTGCCATATGTTCT AATGCATCATTTCCTAGGCTTATGGTCATAAGTTATGATAATTTATATATCTGTTGACTCCCTATTTGAAATATTAGAAGTTAACTAATCCTAACTGTAG TATGTTCTAATGAATCTAACCCTAGTCTTATGGTTGTCAAACTCTTGACTATTTGAATCAAGTTGCCTTTGTTTTTTACAATATACATTGGATTTATGAA GCTAGTTTCATTTTTTATTTTGAACTTCAAAATAATGCAGAGGCAAAATATAGTGCAAGAGTTTTTTCTACTCTTGAATTGAAGGGTCTAAAAGAGAAAA GAAGATAATGGAAACTCAAAATAACATGGGATTGATGTTGATTGTAGTATGATCAATGGTGGGGTCTAGGAAGAGTAGATGTATACAACCTTACCCCACA AGTGGAAAGGCTGTTTCT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_141329; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_392549
Blastp | Putative aminoacrylate hydrolase RutD from Methylobacterium with 30.77% of identity |
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Blastx | Putative aminoacrylate hydrolase RutD from Methylobacterium with 30.77% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (Mchl_2054) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001750) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434641.1) |
Pfam | Alpha/beta hydrolase family (PF12697.6) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |