Ll_transcript_392562

• Id Trinity: TRINITY_DN45922_c5_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_392562
• Sequence: CTTGTATTGACTTTGACACTGTCCGCGTCGAACATAGCCACCGACCATTTCACCAATCCATCTGCCACGTGTCATCTTCCTTCTCCACCTTTTCTAATAA TAATATATATAATTCTATTAACCAACCCTTAACAATTCCTTCATTTTCTCTTCTTCTGTCACTTTTTTCCATTTCATTTCAATTCGATTCATTCCCTTTT TTTTATCTCACGCGCCGCCGAACCATGCCGTATTGTGATATCGGAACGCTGGAATCACCGTCACCGTCGTTTTCTGCTGCCAGTGTTGTTTCTGATGATT CTCAACTCAACAATGATTTGAAGATTTTTTATAGAACTTATGGACGTGGTCCTACTAAAGTTCTTCTCATCATAGGTCCTTTTTTGATTCATTCTTATTT TGTTACGCAATTAGTGAATATAAGTCAAAATAGTCTATCCGATAAAATGTCGGAACATGATTTTAATTTTTTCGGGAGCAAATTGGTATGATGATTTTGT TAGGTTATGTTTGGGAGTTGAGGTTTGGACGGAAAAGAACAGATGACTTAAAAGTCATCTCAGAGAGAAAGTTGTCTGACAAATATATTTTATGGCTCTA AACTTTTTCCGTCAGTTTCCTCTCTGAAACTCGACTCGCAGAATTGTTAAGGAATTTTTTACTTTGTGTTTTCTGGGTTAGGAAGATTTTTGTTACCGTT GCTGATTTTACATGGAATTAACGGTCAGGATTGGCGGCAACGCACGATTCGTGGGGCCCACAGGTGATAGGTTTGACCGGAACCGATGTCCCGAACAACG ACACATGTAGTGGTGATGGTGATGATGATAATGAGTGCGGTGGTGGGATCCAGGCATGCGCGTTTGATAATAGGGGCGTGGGTCGGAGCTCTGCACCCGT TAATAAATCTGACTATTCGTGAGTTTTTTATTGTTAGGGAATTCTCCAATTTTCATTCATTGTTAATTTAATATCAATGATCCACCCACTTTTATTATCT ATTAAGCATTTATACGTAACTATTACATCACCCACCATTCGTTTAGATTACTTTTTCCGTCAACATGATTAAATATTAAATATGAATGGTAGAGTAGATG CAATGATAGTATATAAGAATCATACACTGTTACTGTATATATCTTTTTCTCTAGAAGTAATACACATAAATATGAATGATATAAGTTGAACACAAATCTG CTCTCTCAAAAGATTAACTTGTAGTAAATTGGTTTTTGAAGATTTTAAGAATACAAATTAGTCCTCAGATTTCAAGTTGAGATTAGTCCTTTTTAGCCTA ATTTTTTTTGGGATTAATTGATCCAACTTCAGATATTTAATGACAAATTTGGAATCTTTGGCCACCATTTTGGATTTGTAGTTCTTCAGGAACCAAGTTG GTATACATGAGCGTCAAATTGGGTGTTTGTTGTAATTTAAAATTTACTGACATACAGTAGAAAAGTTCTTAATTTAAATATTTATGCATTCATTCCGAAG GGATTTGAATAAGTGAATGTATGGTGGAACAATAAACATTGAAGTGAAATTTCAACCATTGAAGTGAAATTTTATTCGCCGAGTAATTTGAAATTGATAA TTTTTGGCTGCAGAACCCAGATCATGGCAAAGGATGCCATTGCTTTATTAGATCATCTAGGTTGGAAAAAAGCTCATGTTTTTGGGCACTCAATGGGAGC GATGATAGCTTGTAAAGTAGCAGCTATGGTTCCTGATAGAGTCCTGTCCTTGGCCTTGCTCAATGTAACAGGTGGAGGCTTTGAATGTTTTCCAAAGTTG GATCGACAAACAGTCTCCGTTGCTTACCGTTTCTTGAAAGCAAAGACTCCTGAACAAAGAGCTGCTGTTGATTTGGACACTCACTACTCTCAAGAATATC TTGAGGAATATGTTGGAACTGATAAGAGAAGAACAATCTTATACCAGCAATATGTTAAAGGTATATCAGCGAGTGGTATGCAATCTAACTATGGTTTTGA AGGTCAACTTAATGCATGTTGGACGCATAAAATATCTCAAACAGAGATTGAGGTGATCCAATCTGCAGGTTTCCTCATTTCAGTTATTCATGGCAGACAT GACATAATTGCTCAGATATATTATGCAAAAAAATTTGCTGAGAGGCTTCAACCTATGGCGAGAATGGTAAATCTTCATGGAGGTCATTTAGTGAGTCATG AGCGGCCAGAAGAGGTTAATCAAGCACTTTTTGACTTGATAAAGGCATCAGAAGTGAAGATGAGTCCACATGAATGGACTAATTTGCCAACGAAACAGTC TTGTAAGTATTCCACACAGAGGAAAATATTTTTTCTTGCACTTCATAATTCAGCACGAGCTCACACATGACACATGCAATGACTGTTTTCTGTAGCTTGG TGGCTTGTCAACGTGTGGTAGTCTAAGCTTCAAGCCGAGACGGACCCACGTTGGTGGGTGTTCGGGCTCATGTCCCCACTTAAAATTTTCTACTATGTAA CATTTTTGTCCCCGCAACTTAGTAAGGTTTGCCCCAAATACAAGGTGATAGGGTAAATTCCAATTTTAACTAACCACAGCCCATTCCTCTCTTTTGGTTT CGGACTTCTCTTAATTCCTCTCTTCTCAGCTGCAAACCCAATTTCGTTCACCCGGTGTTAACTTTCCATGGCTTCCTACTTGGTTGGATGATTCATTTAG CACCTAGCAGCCAAGTTTCCAAAGACACTAAGTCCAATTTTAACTAACCACAGCCAATTTCTCTCTTTCGGTTTTCCGGCTTCTCTTAATTCCTCTCTTC TCACAGCAAACCCAATTTTATTCACCCCATGTTAAACTTTCCGTGGCTTCCTACTTGGTTATATGATTTAATTAGCACCCAACAGCCAAGTTTCCACAGA CACAGAGCCATGTTTCAGTGCATACGTGGTCCCGGATGGATTCACAGGTGAATACCTTTAAGATTAACTAAATATTGTACAGACCAAAAGAAAAACAATA GCAAAATTAACATTGCCTGCAATGAAAAGTTACAACAGATATCACAAATTTAAAATACAAGTTACTAGAATGTTGACCAATAGGTTTGCCCTGACTAGGT CACTGCCCAAAATTTCATGGTCCTATTCATGTGAGTATAAATATATGGTCTGATATCACATGCATACTTATATGAAATGTGAAGTATCCATCAATTATCA CTGCCATATGTTCTAATGCATCATTTCCTAGGCTTATGGTCATAAGTTATGATAATTTATATATCTGTTGACTCCCTATTTGAAATATTAGAAGTTAACT AATCCTAACTGTAGTATGTTCTAATGAATCTAACCCTAGTCTTATGGTTGTCAAACTCTTGACTATTTGAATCAAGTTGCCTTTGTTTTTTACAATATAC ATTGGATTTATGAAGCTAGTTTCATTTTTTATTTTGAACTTCAAAATAATGCAGAGGCAAAATATAGTGCAAGAGTTTTTTCTACTCTTGAATTGAAGGG TCTAAAAGAGAAAAGAAGATAATGGAAACTCAAAATAACATGGGATTGATGTTGATTGTAGTATGATCAATGGTGGGGTCTA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_141329;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_392562

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0.1
• PW2: 0.8
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_392562

• Blastp: Putative aminoacrylate hydrolase RutD from Methylobacterium with 25.46% of identity
• Blastx: Putative aminoacrylate hydrolase RutD from Methylobacterium with 25.97% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (Mchl_2054)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001750)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434641.1)
• Pfam: alpha/beta hydrolase fold (PF00561.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;