| Id Trinity | TRINITY_DN45922_c5_g2_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_392569 |
| Sequence | CTTGTATTGACTTTGACACTGTCCGCGTCGAACATAGCCACCGACCATTTCACCAATCCATCTGCCACGTGTCATCTTCCTTCTCCACCTTTTCTAATAA TAATATATATAATTCTATTAACCAACCCTTAACAATTCCTTCATTTTCTCTTCTTCTGTCACTTTTTTCCATTTCATTTCAATTCGATTCATTCCCTTTT TTTTATCTCACGCGCCGCCGAACCATGCCGTATTGTGATATCGGAACGCTGGAATCACCGTCACCGTCGTTTTCTGCTGCCAGTGTTGTTTCTGATGATT CTCAACTCAACAATGATTTGAAGATTTTTTATAGAACTTATGGACGTGGTCCTACTAAAGTTCTTCTCATCATAGGTCCTTTTTTGATTCATTCTTATTT TGTTACGCAATTAGTGAATATAAGTCAAAATAGTCTATCCGATAAAATGTCGGAACATGATTTTAATTTTTTCGGGAGCAAATTGGTATGATGATTTTGT TAGGTTATGTTTGGGAGTTGAGGTTTGGACGGAAAAGAACAGATGACTTAAAAGTCATCTCAGAGAGAAAGTTGTCTGACAAATATATTTTATGGCTCTA AACTTTTTCCGTCAGTTTCCTCTCTGAAACTCGACTCGCAGAATTGTTAAGGAATTTTTTACTTTGTGTTTTCTGGGTTAGGAAGATTTTTGTTACCGTT GCTGATTTTACATGGAATTAACGGTCAGGATTGGCGGCAACGCACGATTCGTGGGGCCCACAGGTGATAGGTTTGACCGGAACCGATGTCCCGAACAACG ACACATGTAGTGGTGATGGTGATGATGATAATGAGTGCGGTGGTGGGATCCAGGCATGCGCGTTTGATAATAGGGGCGTGGGTCGGAGCTCTGCACCCGT TAATAAATCTGACTATTCGTGAGTTTTTTATTGTTAGGGAATTCTCCAATTTTCATTCATTGTTAATTTAATATCAATGATCCACCCACTTTTATTATCT ATTAAGCATTTATACGTAACTATTACATCACCCACCATTCGTTTAGATTACTTTTTCCGTCAACATGATTAAATATTAAATATGAATGGTAGAGTAGATG CAATGATAGTATATAAGAATCATACACTGTTACTGTATATATCTTTTTCTCTAGAAGTAATACACATAAATATGAATGATATAAGTTGAACACAAATCTG CTCTCTCAAAAGATTAACTTGTAGTAAATTGGTTTTTGAAGATTTTAAGAATACAAATTAGTCCTCAGATTTCAAGTTGAGATTAGTCCTTTTTAGCCTA ATTTTTTTTGGGATTAATTGATCCAACTTCAGATATTTAATGACAAATTTGGAATCTTTGGCCACCATTTTGGATTTGTAGTTCTTCAGGAACCAAGTTG GTATACATGAGCGTCAAATTGGGTGTTTGTTGTAATTTAAAATTTACTGACATACAGTAGAAAAGTTCTTAATTTAAATATTTATGCATTCATTCCGAAG GGATTTGAATAAGTGAATGTATGGTGGAACAATAAACATTGAAGTGAAATTTCAACCATTGAAGTGAAATTTTATTCGCCGAGTAATTTGAAATTGATAA TTTTTGGCTGCAGAACCCAGATCATGGCAAAGGATGCCATTGCTTTATTAGATCATCTAGGTTGGAAAAAAGCTCATGTTTTTGGGCACTCAATGGGAGC GATGATAGCTTGTAAAGTAGCAGCTATGGTTCCTGATAGAGTCCTGTCCTTGGCCTTGCTCAATGTAACAGGTGGAGGCTTTGAATGTTTTCCAAAGTTG GATCGACAAACAGTCTCCGTTGCTTACCGTTTCTTGAAAGCAAAGACTCCTGAACAAAGAGCTGCTGTTGATTTGGACACTCACTACTCTCAAGAATATC TTGAGGAATATGTTGGAACTGATAAGAGAAGAACAATCTTATACCAGGTGTGATATATTAAATACACTTAGTTTTAATTAAGTTTAGCTGGCTTGTTGAG TCTGCTCAGAATTTATTACTTTTGTGCTGTCATGGAGTGTTTCTATAGTTAAATAGCACTCTACCAGAAGCTTTTTGTTAGGTATCTAAACTGAATCTAA TTACTTAATACTTATGAACATGAGCTCTGAAACTGATATCAAAAAATACCGGTTCAGACTTCAGAGACAGTGTAAGATATCCTCAAAAAGAAGGAAATTC GACAAGAAAAAACACTGCCAGAGCCTTAATGGTCGTGCTTCCTGCTATTTCCACCAAAAACCTTACCTCTTTTCCAACCTCTTTTTCTGGATCTTACTAC CCCATTTATTATCCGGTCAATTGAATTCTCGTCCAAGTAATTCTCCTTCTGCTACCTTTCCATTTTGTATGCTGCACTTCCCCAGTATGAAGAGATTCGT CACGAATGCTTTGTTGTTTCCCTCATGGACCCCTGCTTCTCACCTTATTTCTCGGAAAAAATACCGTAGTTATTCTATCACATTTACATAGAAAAACGGA ATTTATGCAGGTAGTTGCAGGCTTGCAGCAACTTCGCTTTTGTTAAATAATGCAAAGGCATCACCACCATGACTTAAGGCTCAACAAATATTTGCATATA CTAGAAGTGTCAGAACTCAACCTTTTAAAACATTTTTAATTTTTTGATATGATTCACTTAGAATTTCCAAGTTTAAAAACAGACCATGCTTAGTATCACG ATTGTTTTCGCACTTTACATGGGTATATGCTTGGATAGAGAGAAAAGGAAGGGATGTTTGGGCATTTTTATGAGAAGGAAAGAGGGCTGAGGGATTCAGT TAACCCTTCAAAATCCTAGAACGTTTACTCGAGTTTTCTCAATTTGGGGAAATTCGAGGATAAATTAACTTATACCCGATTATAATGCTATTGTTTCAAA TTCATTTATATTATTAACCTGAACATGAGTTTAATAAATATTATTCCCATCCTTTCCCTTTCCCTCTCAACTCCAGGCACCTTACGAATTTGTACTAGCC ATCGCGCTCTGCGATTAAGTATTATGAATTTTTTCCATCATGTGTTCCTAATTCAGTACCGCCGTTTCTTTCAGCAATATGTTAAAGGTATATCAGCGAG TGGTATGCAATCTAACTATGGTTTTGAAGGTCAACTTAATGCATGTTGGACGCATAAAATATCTCAAACAGAGATTGAGGTGATCCAATCTGCAGGTTTC CTCATTTCAGTTATTCATGGCAGACATGACATAATTGCTCAGATATATTATGCAAAAAAATTTGCTGAGAGGCTTCAACCTATGGCGAGAATGGTAAATC TTCATGGAGGTCATTTAGTGAGTCATGAGCGGCCAGAAGAGGTTAATCAAGCACTTTTTGACTTGATAAAGGCATCAGAAGTGAAGATGAGTCCACATGA ATGGACTAATTTGCCAACGAAACAGTCTTGGTGGAAAGAGAAAAGGATGTTATTTGTGAGAACAGATATTCAGGGTGGAAGCAATGTCTCCATGAAGTTT TGCTTATTACAAAAACTACATCACTGCTTAATATACTTCTTTGGTCTCCTCATCTTAGCATTTGAATATGCAAGAAAGCTTCTAAAAAATTTAAAGCCTG TAAGGGTTGGAAATTCATCCTCATAAGTTGAATATCAATAACCCTTTCTTATTTAAGAGTTGCACGTGGTTCGTAAACCCATGTTGAATTGAAGCACGTG TTCAGCAAGGTGAGGAGTATGCGGCAATGTTGACTCTAATTGTTTTCTCATGTGGGAAACGTGTGGTTTTATCAAACAACCAAAAAAGCAAGAGAGGATC TCAATTTTGCACGAGGGCTATTTAATATAGAATGGGTTGTGGGTAATGGATAAATAATTCAAAAGTGTAAAGTTAATATAGGAACATGTGTATTTAATAT TTAAGAGTTAATATTTTATGTTTTTCAAAATTAACTTTACACTTTTGAAAAATTAACATAAAGTGGGTGATGTTACATTTGTTCATAAGCAAAAGTTGGA GAGATAAATTATATATTAACCTAATTTACAAGGTATTTACAACTTTTATACTTTATTCAAGAGCTTTCCCTTCCTCCGAAACATAAAATTATTTGTTGTG AGTTACTTTCATATAGTCAATGCTATCTTATCGATAAAGACAAGAATAATATTATATTATTCTACTGATTTTTATATTTATAAGAAAATGACATATGTAC TTCTAAATGAG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_141329; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_392569
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001750) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434641.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |