Ll_transcript_392232

• Id Trinity: TRINITY_DN45958_c7_g3_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_392232
• Sequence: CTCTGCGCGCGTGCATCGCTTCTCGGCCACATCGACGCGCTTCGCGAGTTAGGTCACTGCCTCCATGACGGTTACGGCGTGAAGAAGAACCTCTCAGAGG GTCGCCGGTTACTAGTACAAGCCAACGCCCGAGAGCTCGCGTTAGTCATACGCTCAGTGACAAGCGCGTCTCCGTCACGCTCGCAATCTGATTCATCCTC ATCGCTGACGTGGCGTGCGGGTGATTATTCGGTGTGTCCGTTACTGAGTGACTACGTGTACAACGTGGCGGTTCCAGAGGTGCAGCCCGTGGGTTTGTTC ATGAGGGAGTGGTTTGAAACGGGGCCGGGCCGGGCCGAATTAGGTAACGGTTTGAGGCTTTGTGGCCACATTGGGTGTGGGCGGGCCGAGAGCCGGGCCC ACGAGTTTCGGAGATGTTCGGTGTGTGGTAAAGTGAACTATTGCTCGCGTGGGTGTCAGGCTTTGGATTGGAAGCTACGGCATAAGATGGAATGCTCGCC GGAGGAACTGGTGGTTCAGGACAATGACGGTGATTATGATAACGGTGGTGTTGAGTTAGTCAATGACGACGTCGTTTGAGGTTAGAAATTTAAGCTTTAG TCTCATAACTTTGTGAAAAAAAGAGGAGGAGTTTGATGAATTTAAAAGATGGTTATTAGGTTTATGATTTCTTTTTTTGTAAAGTACATATGGGGCAAGC TTTTCTTTTTGGAGACTTCAAGAAATTTCTTTCAAAATTATTATTATTGTGGAAGCATGCCGAAGATTAGATAAGTGGTGGTTTTATTCAAAAGAAAGTT TTACTTGTTAGAGTACCGAGGTAATCTTTAAGATAACAAGGTTATTTTTAAACAGAAAATTAATAATTGAATGTAATAGTGTTATATTCTGTTTTATTAT GCACAGTTTATTTTTAATTATTATTTACTTTTTAAAAAGTATTACAAATTAGAGAGATAATGTAGTTGTGTAAATAAATATTATACTCTTTATTAAATTT TGTGTTTAAAGGTCCTTTCGAACACTTATGTACGAAAATTCCAAAAATTTCCTAGTTGATTATATTTTTATGAAGTTTATTTGATTTTTTAAACTTTAAT ATAATCCAGGAGATTTGTCTTTGGGATAACTTTGATAAAACAAAAATATTATCTTATGACAATATAAGATTTAGCTTATCTTTAAAGACTCCTTGTTTCA GAGAATGAGGTGATCTTAATAGATTAAAATTCTAGCCTTTTTTCTTAAAAATTCTGTGTTATAATAGGATATATTTTTAAGAATTGGTAATAAGATATTA TAAATGTAATTTTATATGTTTGAAGTTACTACCTCTGTTTTTTTGCATATGTCCTTTTATAAAAAAATTGTTCTTAATTATATGTTTTGATAATATCTAT ACTCTTTTTTTACAATTTTACTCTTATATTGTTGGGGTAGTAATTAATCGAGATAATTAGTAAAATTATTACAGAAAGATAATAAAGGACACATTAGACA AAGGTTACACTAATTTAATAAAAATAGATGTATTAATTATATTTCTTAATCTACAATCATAAAAGATGTTTAATCTATGTGCTAAAATCTTAAATAAATA ACAAAACAAAGTGTACATGGAAATACTTTAGGTTACTAATCATTGTTAGGAAAGAGATTTAGATATACTAATAAGGTATTGGTGTAAGTGACGTAAAATT ATGTTAAATTTCTAGAAAGACCAAAAGATCAATAATTCAGTTCTTATAAGTGATACTTATTAAGAGGACAATATGTATCATATATCTTAAAAGTGTGTTT AGTTTCTCCTAGTACAAGAAAGAGCATTCAATATTAAATAAAAAATCTAAAATGAAATACCCAAATGCAGAAAAATGGGTTGGTATGGTTTTGGGGTAAG AGAAAAAGATTGAAAGGGAAATTAACAAAAAGTGAAAAAAACCAAATGCACGTTCATTGGTGTTTGTGTTTCAATCGATCTATATCTATATTAATATATA TCTATATCTATACTATCTATACTATTAATAAAGGGAAAACACAAAATAACTACCTACTATGGTGTAATTTGTGTTTTCCTATTTTGCCATCAATATTTTT TATTTATACAAAAAATCATATAACATTATCTTCTTATTTTATCATCGTTATCTTTTCATTTTAAAATTGTATTTACTATTTAGAAGAATGAACATTACAT CAACTGAATAAACTACACATTACAAATGATAGAAAATCATATTGACATGCATAGTAGTATATGTCGACAAGCTAGTATATTACTATATAAGAAAAGAAGG TCTTCATGCCACATGTCACCTTCTCCTTAGTTTATTTTCCCTCCAAAAGTTCCTTACCTCTTCATATACACCCTCACACATATGATAATGTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_141508;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_392232

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 2.2
• PS1: 2.7
• PS2: 2.5
• PS3: 3
• PW1: 2.2
• PW2: 3.9
• PW3: 2.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_392232

• Blastp: -
• Blastx: F-box protein At1g67340 from Arabidopsis with 55.68% of identity
• Eggnog: F-box protein(ENOG410YZID)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G67340)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019429262.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;