Id Trinity | TRINITY_DN45980_c0_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_393446 |
Sequence | AAGTCATCGGTGTTATATGAAAAAGTGAGTGGTCTCTATTCTCTTTCGTGGAACAAGGTACCAATTTCAGATCTCACTAATTTTCTGGCTTTCCATTTCC ATCAACATTGTCATTAACTCAATTCCATTTCTGGGTTTTAATTATCTATAATGTACACTTTCATCTTTTCATTTCCTATACTACATTTTAAGTTATGTGA GTTTTTAATGTATACTTATTTGGATTCATATTTTTATTTTGATTAAAAATACTTAGTGGGATTTAATTTGTCGGATAAAATTACATATATCTACCTTTCA TAGTATTAAACTAGTGGGGAAGTGAGAATCTCGTATATTGTGCCGCCCTTATTTAATTTGGACTAGTGGGGTTGTGGATTATTATTCTATTGGCATTGCA GGACTACTGTTGTAGCATCTTGTTATTTCTGTTTGCACTTTTTGTCGGTATAATTAAGGCTATCCTTTCAACTTATTGTTAATGAATTAATCTCTTTCGT GATGTGGACCTCTTAATAAGTGTTGTTCTTAAAAATCGAACCTTTAACTTTTGGTATTTCTGGAGATCTAGTCGCGTTTTATACCATTTGACGAACACCT TGTTAGTTGTGTTTTTATGCTTAAATTACATAAAGTTGGCTTCTTTAGCTTAAGTTTGTTGATGGGGGTCACTTGTTATGAGATTTACATCTGTTTTTTT TTACTGTCCTATTTCATTGTGTGCCATTGTGATCAAAGCAAGATGAGTAAATGGCGATTTTGGTTTCGCTTGATTAGTTTGTTGGGTAGAAGAAATGGGA CTGAATGCCTTTTCATCTCACCTTGTGTTGTAGAAGATCCCATTTAAACATTAGATTTACTAGATGAAAAGATAAAAAGGAAATGTATGTTTATGTGTTA AAACAAAATATTCATGTAATTTGGAGTTTAATTCAGTTTTTCTCCTCAAAATGCTCATTCATACAAGTTTCCCCTTTGTTTTGTTCTTCTTTGTGAGGTT AGTGACAACCATTTTCAATTATTCTGATTACCTCTATAGACAAATCCAAATTTGCCAATCCTCCTCAATATTTGTATCACCGGTTGGTTTTCGTCTTTAT AGCTACACTTTTCGTTCTACAGTCTACACTAATAATATACCTATGCATGCTATTCACTACGACTTTCGTGGTTGAAGAATCATATAGTTATGTGGAGAAA GGAAGAGGTTGTATTGTTGTATATAATTGAAAGCTAATAGCTGCTCTTACTTCATGTAAAATAATCACCTGTAAGCATTTAAAAGGTAATTAACTTGTTT ACTTTAGGCTTCAAAGTAAATACTTCAATGGTTGTAGTATCTTAACCATTCATAGTTGTTGGCTTCTATTGAGCTTTGATGACTCTTGGTTCTGTCTGGT GCAATTACGGTTATCTTTTCATTTCATGAAAGAAAATATGCAATGCTTCAATGCAGGTTTACCTACGAAAGTTCTAGTTTAACAGGAAATGGGTCGTGGG GTCAGTAGCGGTGGTGGTCAGAGCTCATTGGGCTATCTCTTTGGCAGCGGGGAGGCTCCAAACAATGCTCAAGGTTCCAACAATCAAGGTCAGCCCGAAA ATGGTGTCCATGCTCAAAATCCTAGTGGTGCGTCACAGCCAATTTCGACCAACCAAGGTCAGACTGCAAATGGTAGCCATGCTCAAAACGCTAGTGGTTC TTCACCAATTGATAAGGGAATTCCGGCTGGAATTCCTGGGAATCTAAAAAACAATTACCATCGTGCCGATGGACAAAACTGTGGCAACTTTATCACGGTA TAGCCCCTCTGGCCTTCTCAAATTTCCAATCATGATCTTTGAATTTTATATAATTATCTGAGTATCTGACTCTGCTATTTCTGCTATAAATATTATTGCC ACTTACCTTATTATCTTAACCTAGAGAAAGTAGAAAGCTTCATAGTATAATCGTTGAATATTCAAATCTTATTCTCTTGCTTCTCATTTACTGATAATGT CAAGTAAAATATCAATGAAGAAGTTGCAAGGTTAGTGTTGACAACTGAAGCAGGGTGCTAAACAAACTCTTGAAGTAACAGTTAGTCTTTAGAACTTACA ATAGTACTATTTCAGACATCTTGTATGCATTAAGTTCCAGTGAAAAATAATAAAATATTCAAAACATCAAAGGATATAAGTTATATAACAAGAAGTTCGG ACTTGGGAGTAATCGAAATTCTATTTTTTTCATATGAATAGGATATAATATTGCACTTTATCCATGTTTTTGTTATTTTTATTGGTATAATATGTATTAC AATTTACAAGTATTCATTACTTCAAAACCTGTAGTTTATTGGAGTACTTCATTTTCTTTAAAATTGGTCGCATATTTTCTGTCTGAGTGCTAGAGCTACC ATCATGGTCTCTGATTTGTGCTTGATGACACATGCTCAAGAAAGTTGGTGCTACTGCTGCATCTTTGTAGCTTGACATTTAGCAATTCCGTATTTGATTC GTATGATAGTTTCCAAGCAAAGTTTTCCTCATGATTTTATGTCATTACATCATAGGTTTTTTTATTTTTGGGTGTACTACATCATAGGGGACTAAAGATG CAAGGAAACTACAGTTTTCAGCTTGCATGAATGAAACAATAGTAATGCAGAGTTGGTATGGTGCTTTAGGAGTGAAGATCGAGTAGTATTTTTTGTTCAC CGGTGATAAACTCGCCGCTCGTTTGGATACTGAATTATTTAAGTATTCTTAATCCCGGTTTCTCCTTTTTTGTGTGTAGGATCGGCCATCTACCAAGGTC CATGCTGCTCCGGGTGGTGGATCTTCTTTGGGTTACCTCTTTGGTGATTCCAGGAAGTAGTAATTCCTCAGTGTGAAGTGTATTCTACACTCTAACGTAC AATATGCAAAATAGATGGTCCAAAACTATGCTGATTCACAATTATGTGTATTTCTGTTAATGAAATTTACTGTGCTGGTGTTGAAGTTGTAGCTCATAAT TGTTCTGTTGTTTTTATTTGCTTATGTTCATACCATAGTACTGATTTTATTGCAATGTCTTCTGCCGCATATTTTATAATTGTTTGTTTTCCGAAAAATT ATCGAACTCTCTAGAACCTCGACCTTTTTCTATAAATGGATCTCACAACATATCTCACATTTATAAAAâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_141666; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_393446
Blastp | Protein SPIRAL1-like 1 from Arabidopsis with 52.43% of identity |
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Blastx | - |
Eggnog | in maintaining the cortical microtubules organization essential for anisotropic cell growth(ENOG410XU77) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G26355) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442747.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |