Ll_transcript_417872

• Id Trinity: TRINITY_DN46038_c0_g1_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_417872
• Sequence: ATTGAGTTGAAATTTGATGACCACATTGTCTATGACCAAGATTATCTTACCCATGTTCTTAATGCAGTCTTAAAGGTAAAATTTTAACATTAGACTAATA CCAACAGTTTTGTTTTGTTAACCGATATCATCAATGCCGTAGCTTGCACTATGGTCGCATTGCGGCTGTTGCGATACGGACTGTGGCTGTTGCGTTGCGG CCCAAATACAGCTTAAATGTTGTTTGATATTGTTGTGTTGTGGTCGCTGTGTGATGCATCACTGCAACCACACTATTGCTACTCGAGTACGAATATTACT TTGTAACAAAATGTATATATCTTACATTCATTAACATTGTGGAACAGGTTGTGTTTGGTCATGCCAAAAACAGACCTATTATCTTCTCAACTTTCCAACC AGATGCTGCATCACTAGTTAAGAAATTGCAAAGCACCTACCCTGTAAGTTGAATATCACCCTTCTTCTTTGAAATTTTGAAGGAGACAATGCTTTTATTT GTTCTAATATGTTGTCTTTTGTGTTGTACTAGGTATTCTTCTTGACAAATGGAGGATGTGAAATCTATGAAGATGAAAGAAGGAACTCTTTGGAAGAAGC TTTAAAACTTTGTTTGGAGAATGGGTTGCAAGGAATTGTTTCAGAGATTAAAGGGGTATTCAGAAATCCTGGAGTAGTAACTAAGATCAAGGAATCTGAG CTTTCTCTCCTTACATATGGATCATTAAAGTACGTCTTATCGACTTTATGCTATATACGTGTTTTTGTCTGTTCATCCATGCATTCTTATAGTATTCTTA CTGAAGTAAGAATGATATTTATCATTTTGAAGAAAAAACCAGATGTTATTCTTCATTTACGGACACGTGTATTAAATTATAACATAACGTGTCAGACCCA AATAAGAATGAAATTGATATTCTGCGATGGATATGCTATTAGTTGTTGGAAGTAGTTGTGACTGATTTTTGGTTTTGTTTTGACAATACAGCAATGTTCC AGAAGCAGTTTACATGCAACATCTAATGGGAATTGATGGGGTAATAGTGGATTTGGTCCAAGAAATAACAGAAGCAGTTGCAAATTTGATAACATCAGCA ATAGTTGTTGATGAAGAGGGTTTGAATGAAAAGTTGCAATTGCATTCTAAGCCTAAATTTTCTCAGAAGGAGCTATCTTTTCTTTTGAAGCTCATTCCAC AGTTGATACAGATTTGAAAGCAAAAACCATTCTATACAGATTTTAGTTGATTTGTCCTTCACACTGATATAGGCTTTAGAATTCTTATTTCATGGGCTTT GTTATGTCATTTTCATGAAATACATGGTAGCATGAAACCTTAATCCATGTAGATATATTTTCTTCTTGTGACTTGAGGGGATTAAGGAATGAGAGTGATT ATGTATGCAGTGAATATTTTGATGGCCCTTTAACAATTTCCTACATTGTCAAGCATAAAATTTGATATGTTATACTAATATTCTGTCTAGAATAACTTCT TCTTGCATATAAATTATCGTTGTTCCTAATAGTGGGAACACATCTTCTATCCTAAAATGTGTATCACTCTATGTACCTCTTGTTTATTAATACAAGGGAT ATAGAGTGTTCCACATTTTAGGACAGAAATATGTTCCGAGCCTTTAACAAAACATTTGACTAATACTAATAATACCCTGTTTTTTGATTTTGTGAACTTA CAAAAAGACAACCATATATGATGAAAATGTTGAGGAATTAACAAGTAGAAGCACTAATACTTGGAGTTTTGCAATTTGGCTAGTTTTTGCTGGAAAAAAG CTAGTGAAAGGGTAGTTAGTGCTGAAAAAAATCAGCTTAGAATTTTGTAGAGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_141910;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_417872

FPKM

• PAB: 2.9
• PNAB: 0.9
• PS1: 1.3
• PS2: 0.1
• PS3: 0.6
• PW1: 0.9
• PW2: 0.7
• PW3: 0.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_417872

• Blastp: -
• Blastx: Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPD1, chloroplastic from Arabidopsis with 58.76% of identity
• Eggnog: glycerophosphoryl diester phosphodiesterase(COG0584)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G02040)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_003548989.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;