Ll_transcript_417868

• Id Trinity: TRINITY_DN46038_c0_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_417868
• Sequence: AGAGCATATAACTAAGACCAAGAATATTCAATTAGCATATACCCTTTTTACTTCACCTTTCTCTTTATTTCACAATAAATACTCATACCCATTACATTTT TTCTCAACAACAATTACCATAACCATAACAATTTCTTGTTAATACCCAAATTCTCTTCTTTTTCACTATGGCTCTTAAAGCTGTTCATGTTTCTGATATT CCTTCTATAGATATTGTCCCAGAAAGTCCTCTTACTCGATTTTCTAATGGGGTGGAGTTTAAGGTACCAAAGTTTGTAGTGATTGGACATAGAGGACATG GCATGAATGCTTTGCAATCTTTGGATAGAAGAATGAAAGCTATTAAGGAAAATTCAATTATGTCCTTTAATGCTGCAGCTAATTTTCCTATTGATTTCGT TGAATTTGATGTTCAGGTAATGATTCTTATATTTCTTTTCTCACTTCATTTTTCAGAATAGTTGTCCATATTGAATGAGTCCGTGATCTAATAGTATAAG GTCTCGGCATACGGACACTTAATGAGAGAGACAAAAAACTCGAAAAAGATTAGTTCTTTACGTGTTTTAACAATATAGTAAACAAGAAGTCATTGCTAAA TTGGGACGGTTTTATCTGTTTTTTCTATGTTCTGTTTTGTTCGTGCGGTGTGATGTGTCTGTTTCTTAAGTTTTCAATTTTCCTGTTTTACAATTTTGCC CTTTGAGTTCAATAGGTTTTTCTGTAAATGATTTATTTGTCATGGGTTTTTGTAAATTTGTTCATTGCTGAATTTATTTAACTTTGATTACTTGAATCAG TATTAACTGGTTTCTTGTGTTATGGGTGGGTTCTTTTATATGAAAGTTTCATGATTCTACTTTAAAAAGTTGAAAGTGTGAAGAATGAATGAGGAAAAGA AGAAAAAGTTAAAAGCAAAAGTGTTTTTTTTGTAGGTGACAAATGATGATTGCCCAGTCATTTTCCATGATGACTTTATCCTCTCCCACGAAAATGTAAG TTCATACCATCCCCATCTTGTATTATACGCTATATCAATTTGGTCCCGAAAATTTTTAAAACTCGAAATGGGCGTGAAAGATATTAAATGTTAGTCAAAT TAGACTTTTATTTTTTATGGTGACTAATCTGTCACACATTCGCGATCTTTAAGTAGTAATTTTAATTTTTCTCAATTTTCGGATCAAATTGGTACACCCG AAAATGAGATATCGACTCTATCCTTTATTATTGAGAGTTGATTATGAATGTGCTTTGGAACTTTCTTCTACAGGGTGTTGTATTTGAGAAGAGAATCACA GAGCTACGTTTGTCAGAGTTTCTTGCCTATGGTCCTCAAAGAGAGGTTGGAAAGGATGGAAAAGTTTTAGTCAGAAAAACGAAGGATGGGAAAATAGTCC AATGGGAAGTTGAACAAGATGACTCACTTTGTACACTTGAAGAAGCTTTTCTGAAAGTTGAACCCTCTTTGGGTTTTAACATTGAGTTGAAATTTGATGA CCACATTGTCTATGACCAAGATTATCTTACCCATGTTCTTAATGCAGTCTTAAAGGTTGTGTTTGGTCATGCCAAAAACAGACCTATTATCTTCTCAACT TTCCAACCAGATGCTGCATCACTAGTTAAGAAATTGCAAAGCACCTACCCTGTATTCTTCTTGACAAATGGAGGATGTGAAATCTATGAAGATGAAAGAA GGAACTCTTTGGAAGAAGCTTTAAAACTTTGTTTGGAGAATGGGTTGCAAGGAATTGTTTCAGAGATTAAAGGGGTATTCAGAAATCCTGGAGTAGTAAC TAAGATCAAGGAATCTGAGCTTTCTCTCCTTACATATGGATCATTAAACAATGTTCCAGAAGCAGTTTACATGCAACATCTAATGGGAATTGATGGGGTA ATAGTGGATTTGGTCCAAGAAATAACAGAAGCAGTTGCAAATTTGATAACATCAGCAATAGTTGTTGATGAAGAGGGTTTGAATGAAAAGTTGCAATTGC ATTCTAAGCCTAAATTTTCTCAGAAGGAGCTATCTTTTCTTTTGAAGCTCATTCCACAGTTGATACAGATTTGAAAGCAAAAACCATTCTATACAGATTT TAGTTGATTTGTCCTTCACACTGATATAGGCTTTAGAATTCTTATTTCATGGGCTTTGTTATGTCATTTTCATGAAATACATGGTAGCATGAAACCTTAA TCCATGTAGATATATTTTCTTCTTGTGACTTGAGGGGATTAAGGAATGAGAGTGATTATGTATGCAGTGAATATTTTGATGGCCCTTTAACAATTTCCTA CATTGTCAAGCATAAAATTTGATATGTTATACTAATATTCTGTCTAGAATAACTTCTTCTTGCATATAAATTATCGTTGTTCCTAATAGTGGGAACACAT CTTCTATCCTAAAATGTGTATCACTCTATGTACCTCTTGTTTATTAATACAAGGGATATAGAGTGTTCCACATTTTAGGACAGAAATATGTTCCGAGCCT TTAACAAAACATTTGACTAATACTAATAATACCCTGTTTTTTGATTTTGTGAACTTACAAAAAGACAACCATATATGATGAAAATGTTGAGGAATTAACA AGTAGAAGCACTAATACTTGGAGTTTTGCAATTTGGCTAGTTTTTGCTGGAAAAAAGCTAGTGAAAGGGTAGTTAGTGCTGAAAAAAATCAGCTTAGAAT TTTGTAGAGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_141910;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_417868

FPKM

• PAB: 54
• PNAB: 5
• PS1: 11.9
• PS2: 2.6
• PS3: 3.9
• PW1: 11.8
• PW2: 6.5
• PW3: 3.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_417868

• Blastp: Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPD1, chloroplastic from Arabidopsis with 65.54% of identity
• Blastx: Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPD1, chloroplastic from Arabidopsis with 64.59% of identity
• Eggnog: glycerophosphoryl diester phosphodiesterase(COG0584)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G02040)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019437407.1)
• Pfam: Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family (PF03009.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;