Id Trinity | TRINITY_DN46065_c0_g3_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_417812 |
Sequence | ATTAAAGTGTTAGGATTGTTGGTCGGTGATGAGAAAGGGGTTGCACCTTGCAACTTACACGATTTTAATCCTTGTTGTCATAATTAAAGTAAGTAATGTT ATCGTATTAGCATGATATCAGGTAAAGATCAAGATACATGCTAGTGTTCATGATTTTCTGGATGTGATGGGGCACGTGATATGTAATGTATTTGTAACGA TAATTTGATGCGCACATAGATATTAGATAGGGATCTAATGTTTAGCATGACCGGACAACTTGGCCCTGTACATATATGAGTGTCGGTGGGGTTCATAAAA CGTGTTTAGGCGTAAAAAAGGGAATGGAAAACGTGGAGGAGAAACATATCATCCGGATATCCCGTCATCCAAACAATTTACATCCTTAGCCTTGATGGCA GGTATGTGAATCTCGAACAAACTGTTATGTTTTTTATGACATTCTATCAAGAAAACAACTTGCTATCTTTGGAAAAGGTACTATTTTTTGTTAAGTATCA GAAATGATACTTATGAAAACTTTTTCATGGTAGCAATTGATTTCTTTCTTCTTTCTCAGTGTCTCACTTTTTTTATAGTTTCCATGGCTCACCTGAATTT TTTGTAATGTTTGTTTCATGCTAATAACTAATAAGTCATTTTTATGTGTACACTATCAAAGTCACCCAACGTATGAAGCCTTTCCATGCAACAATTAACG CAAATCTTAATCATTTTTAACAAAAATGCCTACACTGTCAATTGAAGAATTTCATATTGTTGTTCATTACTTTTGTTTTACATTCAATTGGTGGCCTTTT CCCTTTATTTGTTATGCTATTCATGGTTTGGGTTCTTTCCATTTCATTCTCCACCGAATACACATTTGGTAAAACATATGTTACATGGTAGGCAAGATGA AGTATCCTAATGATGTGAATTAATTGCTTAGATTGCTTCTAAAAATAGTCAGTGTGCTATCATTATGATATTGGAATTACATTAACATTTGGTGATATTG AAATTACAGTGACCTCGACAGAGATATGTGGGTGTAACTTTTGAAAGGAGAGGTGTGTCAGATTTAATTAAGCAAGTGAGGTCAGTGTAATTTCTCTTAA TTTAATTTGGTGAAGGTTAGGTTGATCTTTCTGTTGTTGTCAGTGTTTTTACCTTTGAACATAAATCTAATGGTCTCTATCTGCCATTGTTGGAAGTAGA GGAAAGACAAGGTTATTCTAACTTAAATAGGTGTACCCTTTACATATTTAATATAATAATACCTATTGAAGACTGTTAAATAACTAACTTTACATATTTA TTTTAGTTTTGAGCCAATATTTAATATTCAAGCAGACAGAAAGAATCAAGTCTCTAATTGATAATGTTTGCTTTAGTGGGGACTCACTGCTTGTTTATTT CGTAATAGCAGTGCCTGCTGTTGCTGCATGATTGGTTGGGTTGGAACCAATTTCAGTTTTGTTTATCTGATATCATTTTGTAGTTTTGTTTCAGGTGGGT TTTGGAGTGGTTGATGCTATAGCTGAAGCTGAAAAACTTAATTGAACCATAAACTTATGCATCGTGATAATTGATGCCAGTATAGTATGATCCTATCGAA CAAGATTGACATCTTATTCAGTTCTTTTAGTTTGATTGCTGGAACATAGAAACCATGTCAATGACAAGAATCAAGTACAGTCAGAAAGAACTTTTTTGCC AAACCTAAACCTATATATGTTGTAATTAATGTGTTGAATGACAATATTGCTTTCATCGATATTGCATACAACCATTGATTCTGTATAATTTTTAATTCCA TATTTCAGAATGTTGGTGAGTAAAACAAACGGCCTTTAAGTATTTGTAAGTATGTACCATTTGTAACAGAAATTGTTTTCCTATTGCAGGTTTTATAGGT GATGTACCGGTTATATGTGCATAACCAGAGACTTTTATGAATTCAAGTGGTGAACCTATAAGTCTTCATTGTTGAGAAAGCACTTTCCTATATGAATTGA TTCTAGATATTGGAAAAAATGTTGATTATTACTCAGATTCCTAAATACATAATAACGAATTGGAATTATTGAAGAAATAAAACTAAATAAAATGAGTTAC AATTCTTTTGAACCAAGAAAAAACAATTGTGGTCAGATTAAGGTACATTTGGTCCAGAAAGTCATTCTGAAAATATAAAATAACAAGAATTCATATGATT TTATTGTATAGAAATAGTATGGTTAGAGTATCAGATGGACATACATATACATCGTATTTTTCTGATGTGAATGACTGTCCAAAAAGTGTCCCAATGTTGC ACTACAACTTTGTAGTTACCAATATTCAATAGTCGGTTGATTTTCTGTAGTGACTACTTTTAGTTTGATGCTTATTGGCTAGTATTCAAATCTATTATGA AGGTTGGAGCCATAGTTTTGTATTCAAATCTACTTTGTCCTTTTTATTTACAAGTGCTGGAAGATTGTCTGCTTGAGCATTGAATTAATAATTTTCTCAT GTCTTCGATCTACTGGATTTGCCTTTAGCTAAAATGCAGCTGCTGCCAAAGTATGGAAATGGAGGTCATAATGGGGAAATGACTATGCCCAACTTGGAGA ATACTTTTGTTAGTTGTTGCACAATCAGTTTTTATACTATCAAAATGGACCAAAGTGAAAGATCATAGAGGGTTGTGAGATGCTTACCTTACATACCTTA TCTTGGAAAGGCACTACTTATCTGAGTTGAATTTTACATTACAACATGAGCTAGAGCAGTGTGGATTCTTTCGCTCAAAGGGTTTGATAAAAGTGCAACA TTTGTTAATGCCAAGAAGATAGAGCATATTGGTTAAGTGATTGCTGATTTTGAATATCCCTATTTGCCAGCAGATACACATTAACTTAAAAGATTACACT CATTATAAGATCTTTTTGTTCATTGGGTATACCTATGTTTGAGTATCCATCCTTTCTTTCAGAATGCAGTGCAGCTTAATAAATTATAATATTGAATTTA TGGAATTATTAGGCTCTTGTATGTATGCGTTGTTACATAAGAATAAGATCAATTTCTTTGTTTATAAAGATCCATATTTGGCTGCATAGCTCACACATGA CTTTACCACTGTTTTTATCAGTGCACTTAATGTCATGAATTTCATTCTTCTTATGTTAATTTCAATTATGCAAATTATTATCTCAATATATTAAGCAAAA AAAATCATGTTGTTTAGTTCCATTTTCCAGTCCAGCTTGTGTAGATTATAATATAAACTAAGGGCAGTGCTTTGCTGAGGTTAGTGTGTCCGCTACAAGT TTTATGTTGACACAAATTTTAGGTATAAGTATATAGGTAAAAAGATATAACAGTCATTTAGATAGGCTAATCTGGATGTAATATAAAAAATGAATCTGAT TAGTTGTACTTGGCATCACAAATTAACTAAATACTTATACTTCTTTAGTACAATGTAATTTTATCTGTAGGTATCTGACTCAACCAAAAGGTTGGCTGAT CAAGGTTATATGATCCCACTGGATTTACTCAGTGAAATCTGCATATTTATCATTGCAAAAACAGGACAATGAAGTGAACATTTTTTGTACTCTAATATTT GGAATGCCAAAGCTCAGTGGAAGATAATTGCTCTTGCATGGAGAATTATGCTCAACCGGTTGCTTATGAGAAGGATCTGCATCGGCGAGATATCGATCAC TAAAGTGACAATCTTTGTGTTTTCTGCAAAGATGCTGTTGAAACGGTAAACCATTTTTCCCCTCATGATTCAGTTTGGCAAGAATGCTACAATACCCATG GATGGAGAATCTAATTTTATGCAGCATTCATGGTTGGGAGCACATAAGTCTTTTGAATTTATGGTTAGACGTGGTTTGGAGTTTATGGCTTTATGTGGAT ACCAATACTCTTGTCCTGTGATTGGGTAGGAGGGTTATGTTTTCAATCTTGTAGCAAGTGCTCTCTATGTAAAATAAGTGCACTGCTGGTACCTACCCTA TTGTGAATAAAATTTATTTTTAATAAAAAACTAACTAGTTACTTGTGCATTTGGACGAAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_142046; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_417812
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_015954346.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |