| Id Trinity | TRINITY_DN46069_c3_g3_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_418867 |
| Sequence | TTAAATCCAACATTCAACTCATATTTACAAATCCTTAAATCTCGTTCAATCAATCTTAACTCAATCAAAGTCTCATACTAATGGATGCTCCGAAGACAAA CCCATTTCGAGTCACCAGGGTTTTACCTGAACCTGACCTTTACCTACACACATCTCGTGGAAAACCTATTCCAGTGCACGCAATCATTTTGGTACACACT CTTTTCTGATAATTCAATTTCAAATCAATCAGTTTTAAATAAATCTAAACATAAAAGATTTGGGTAGTTTATGAGTTGATTTTTGAATGATAATGAAGCG AAAGGCTTCAGAGATCATCTAAAACCTTGAACTTACTTTCATTCTAAAACTTAATTCACAAAATCTAAAAAATATAGGCAGTTTATTTCGTTATGATTTG CTTAACCAATTTGCATTTTTTGAATCTAATTTTGTTGTGTTATAATCCTGAAGGCTTCAGGGTCACCAGTTCTGGAAAACATTATAATGTCCAACAGAAC CGTTAAAATCCACGGCGTTCCATACGACGCCGTTATCGCCTTCCTGAGCTTTATCTATACCTCCAGGTTTGTAATATTCTACTTCACATTAATACGAGAG TAATCAATTTACTCTATATTTTAGCCTAAATCTGATGATTTAACATTAGATTTTAAATTTTTTTAAAGTTATTCTTGGAGTTATTAATATTATGATACAG TTATTTCTTGTTTCAATTCTAAGGAGTATTGATTATGTGTGCAGGTGCACGGAGGAGGAGATGGAGAAGTACGGAATGCACCTTCTTGCATTGTCACACG TGTATTTAGTGCCGCAATTAAAGCGAAGTTGCATCAAGGGTCTGAGTCAACGTGTTAATACAGAGAATGTGGTGGATGTATTGCAACTAGCGAAGATGTG CGATGCACCAGATCTCTATGTCAAGTGTTTTAAGCTTCTGACAGATAATTACAAAGAGGTGGAGAATACAGAGGGTTGGAGATTCTTGCAGCATCATGAC CCAAGGCTCGAACTTGATATTCTTCGCTTGATGGATGAACACGAATCGGTAAATTTTTTTTAAAAATTGAATTTGAATTGGTCATAGTTTATGGAAATGC ACTGAATAATGTATGGAGAGTTATCTTGATTTTCGTTCATTCCTATGACTATATAAAGATTAATGGGAAAATATTACATCACTCAATCTAAATAATAGAG TAAGAGTAATGATATATAAGTAAATATATCATTCTATCAGTTTTTTATAAAAGTAATATATCTTACTTGTTAATAAATTATTCATTAATATATTAATAAT CATTATATTAACATATTAAAAATTATTGGATAAATTATTCATATATTAATAATCATTAATAAACTATTCATTAATATATTGACCAATTATTACTTTTCTT ACGTTGCAGGTGGAATATATTATTTTTTATAGAGTACAAACATGTTTTGGTTTCTTAAAAAATTCACAAATCTAAAAATGGTCCAAAAAATTAAATGTAA ATCATATTAATTATACAAGACATATGATAGAAACTATTTTAACTTACCATTATTAATTTAGATTTTACTTTTTAAATAGTACACAAATTGAATATCTACT CTTATGTGACATTCATAATAATTTAGGTCATTCCTATCCAAGAAACTAATTAGATCATATCATTTCCTGTTTTATACTGTGGTAAGTTTGTTTTTGGTAA AACTAGGGATAAACCAAAAAATCACCACAATATAAAATGAACTTAATTCACCACACTTTCGTATATGAAGGAGGATGTGAAAATGTTTTATGAAGCCTTA AAATGTCATATATTGGTTAAATGTGTTAATAAACTTTTCCTATGAACTAGGTGAAACATTTTTTTTAAATATAACTTGTTAACATTTAGTTTTTGTGAAC AGAGGAAGAAGAAATGTAGGAAACAAAGGGAGGAAGAAGGGTTATATATGCAGCTGAGTGAAGCAATGGATTGTTTGGAACACATATGCACAGAAGGGTG CACCGATGTGGGACCTTACGATGTGGAACTTAGCAAAGAGAAGAGAAAGCCTTGTTCCAAGTTTGACACGTGTCAACCTATACAAGTGTTGATTCGCCAT TTTGCCACGTGTAAGAAGAGGGTCAATGGAGGATGCTTGAGGTGTAAAGGGATGTGGCAGCTCTTTAGGCTCCACTCTTTCATTTGCCAACATGATTCTT GCAAGGTTCCTCTTTGCAGGTAAAAGTCTCCACATATGATTTTTCATATAAGAAAGATTTGTTTTCCCAAATTTTGTTTTATCTCTTGTTAGTAATAGTG GAAAAAAATAATGATAATAATAAAATTTAATTGATATATTATGTTTTCATTGAAGTAGATAACGAATGAATATAAATAGAAGATAATATATCAATTTACA TTTACATTGATATTATAGTATTTCTTCTTTCAACTTGGGGTGGGTCGTGAAACATGCCACAAACGTGTACGTGGGGTCCCCTCAAAAGCTATAATATTTG TTTATTATCCCTGATGATGTTATTAAGTTTCTTTATTTTTTACTTATTTTCTGTGAACCTAATTAAGTCTTTAGTCACTGTCTATGCCGTGTCTGAATGT TTTGTTTTACTAGCATGTCTTTAGCATTTTTCTATTTAGTGGATAATAGTTAACGGGTGGAATATTGTAACAGGCAAATTCAATTGAAAATGCAGCTAGA GAACAAGAAAGTTGATGCAAAGTGGAAACTCCTAGCCAGGAAGGTGGCCTCAGTCAAAGCCATGTCTTCCTTGTCAGTGCCAAAGAGGAAGCGAAATGAG GAAATTAGAGACACCATAATCAATTCTGGCATCAGAAATTTCAAATAGTATAAATAATTCTAAAGAGAAGATGCTTGATTTCTTTTGAGAAGCTGCAGGG TTTTGAATGAATGGTGTGGTCGTGTTTTCCCTGCTTCCTTGAAGGTGAGTTAGCTAGGTTCCCTAAGTAGGAAATTGCAAAATAACGGAGAAATGACAAG TTGGGGTAATTGAGCAATGTACAAGGATAAACAAGACTAGAATCCCAAGGCTTAGGAGATCTAATGACAAGAACAAGAACCAAGAGGGCAAGAGAGGCGT TGTGTCAAGTCAATGCATCACTCCTTGAAGTCAAAGCAATGAAAGATGACTTAGAGCCAAGGATTATGCACTACATTGAAGAACGGAATAGTTTTGTTTG GCACGTTCGTGTCCTGGCCTATGGTGAGGTTGTGGTTGCTTCTTGAATAAGCTTGACATTTCCTTGCCATGAGACACAATCATGTACTTCAAACACGATT TGGCTGTGTGCTTGCCAATTCTCGCATATTTTTTTTGTAATTTTCGAAAATTGTAATTTATCTTTTCAAATAAATGATCGTTGAAGTTTCATACCTGAAC CACACAAGCTTGTTGGATGCTTGATTTTACTTCAAACACGATTTGGCTGT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_142074; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_418867
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | BTB/POZ and TAZ domain-containing protein 1 from Arabidopsis with 60.18% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019414255.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |